5'-N-propynylamino-N'-[4-{(2S)-2-(N-tert-butoxycarbonyl)aminobutyric acid}]tert-butyl ester-5-deoxy-2,3-O,O-(1-methylethylidene)adenosine | 1227195-16-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 5'-N-propynylamino-N'-[4-{(2S)-2-(N-tert-butoxycarbonyl)aminobutyric acid}]tert-butyl ester-5-deoxy-2,3-O,O-(1-methylethylidene)adenosine
• 英文别名: tert-butyl (S)-4-((((3αR,4R,6R,6αR)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)methyl)(prop-2-yn-1-yl)amino)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)butanoate；tert-butyl (2S)-4-[[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(6-aminopurin-9-yl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]methyl-prop-2-ynylamino]-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]butanoate
• CAS: 1227195-16-5
• 化学式: C₂₉H₄₃N₇O₇
• 分子量: 601.703
• InChiKey: BGKWNACYCQMLGB-XCPBYIKRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  165
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-N-propynylamino-N'-[4-{(2S)-2-(N-tert-butoxycarbonyl)aminobutyric acid}]tert-butyl ester-5-deoxy-2,3-O,O-(1-methylethylidene)adenosine 在 水 、 三氟乙酸 作用下， 生成 5'-N-propynylamino-N'-[4-(2S)-(2-aminobutyric acid)]-5'-deoxyadenosine trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  开发有效和选择性的蛋白质精氨酸甲基转移酶双底物抑制剂

  摘要：

  蛋白质精氨酸甲基转移酶 (PRMT) 的原型抑制剂是通过通过可变接头将胍功能连接到细胞辅因子 ( S )-腺苷甲硫氨酸 (AdoMet)的非反应性胺类似物来构建的。对于两种这样的化合物，观察到对PRMT1 的有效抑制（IC 50为 ∼3-6 μM）以及对赖氨酸甲基转移酶 SET7 的弱抑制（在 100 μM 时的活性约为 50%）。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2010.02.069
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-异丙叉腺苷 在 叠氮磷酸二苯酯 、 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 potassium carbonate 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 9.33h， 生成 5'-N-propynylamino-N'-[4-{(2S)-2-(N-tert-butoxycarbonyl)aminobutyric acid}]tert-butyl ester-5-deoxy-2,3-O,O-(1-methylethylidene)adenosine
  参考文献：
  名称：

  Design, synthesis, and kinetic analysis of potent protein N-terminal methyltransferase 1 inhibitors

  摘要：

  设计并合成了一种新型的双底物类似物（NAM-TZ-SPKRIA），它被设计成一种强效、选择性和首个NTMT1抑制剂。

  DOI：

  10.1039/c5ob00120j

文献信息

• Design of a fluorescent ligand targeting the S-adenosylmethionine binding site of the histone methyltransferase MLL1
  作者：Yepeng Luan、Levi L. Blazer、Hao Hu、Taraneh Hajian、Jing Zhang、Hong Wu、Scott Houliston、Cheryl H. Arrowsmith、Masoud Vedadi、Yujun George Zheng

  DOI：10.1039/c5ob01794g

  日期：——

  FL-NAH is a fluorescent ligand for the SAM-binding site of the MLL1 lysine methyltransferase.

  FL-NAH是MLL1赖氨酸甲基转移酶SAM结合位点的荧光配体。
• Discovery of Inhibitors of DNA Methyltransferase 2, an Epitranscriptomic Modulator and Potential Target for Cancer Treatment
  作者：Marvin Schwickert、Tim R. Fischer、Robert A. Zimmermann、Sabrina N. Hoba、J. Laurenz Meidner、Marlies Weber、Moritz Weber、Martin M. Stark、Jonas Koch、Nathalie Jung、Christian Kersten、Maike Windbergs、Frank Lyko、Mark Helm、Tanja Schirmeister

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.2c00388

  日期：2022.7.28

  Selective manipulation of the epitranscriptome could be beneficial for the treatment of cancer and also broaden the understanding of epigenetic inheritance. Inhibitors of the tRNA methyltransferase DNMT2, the enzyme catalyzing the S-adenosylmethionine-dependent methylation of cytidine 38 to 5-methylcytidine, were designed, synthesized, and analyzed for their enzyme-binding and -inhibiting properties

  表观转录组的选择性操作可能有益于癌症的治疗，也可以拓宽对表观遗传的理解。设计、合成和分析tRNA 甲基转移酶 DNMT2 的抑制剂，该酶催化S-腺苷甲硫氨酸依赖性甲基化胞苷 38 至 5-甲基胞苷，并分析其酶结合和抑制特性。为了快速筛选潜在的 DNMT2 结合剂，建立了微量热泳分析。除了天然抑制剂S -adenosyl- l- homocysteine (SAH) 和 sinefungin (SFG)，我们还根据N的结构鉴定了新的合成抑制剂。-腺苷-2,4-二氨基丁酸（Dab）。构效关系研究表明，Dab 4 位的氨基酸侧链和 Y 形取代模式对 DNMT2 抑制至关重要。最有效的抑制剂是炔烃取代的衍生物，表现出与天然化合物 SAH 和 SFG 相似的结合和抑制效力。CaCo-2 测定表明，酸的膜渗透性差和乙酯前药的快速水解可能是纤维素中活性不足的原因。
• Toward the development of potent and selective bisubstrate inhibitors of protein arginine methyltransferases
  作者：James Dowden、Wei Hong、Richard V. Parry、Richard A. Pike、Stephen G. Ward

  DOI：10.1016/j.bmcl.2010.02.069

  日期：2010.4

  Prototype inhibitors of protein arginine methyltransferases (PRMTs) have been constructed by attaching guanidine functionality via a variable linker to non-reactive amine analogues of the cellular co-factor (S)-adenosyl methionine (AdoMet). Potent inhibition of PRMT1 (IC50 of ∼3–6 μM) combined with weak inhibition of the lysine methyltransferase SET7 (∼50% of activity at 100 μM) was observed for two

  蛋白质精氨酸甲基转移酶 (PRMT) 的原型抑制剂是通过通过可变接头将胍功能连接到细胞辅因子 ( S )-腺苷甲硫氨酸 (AdoMet)的非反应性胺类似物来构建的。对于两种这样的化合物，观察到对PRMT1 的有效抑制（IC 50为 ∼3-6 μM）以及对赖氨酸甲基转移酶 SET7 的弱抑制（在 100 μM 时的活性约为 50%）。
• Design, synthesis, and kinetic analysis of potent protein N-terminal methyltransferase 1 inhibitors
  作者：Gang Zhang、Stacie Lynn Richardson、Yunfei Mao、Rong Huang

  DOI：10.1039/c5ob00120j

  日期：——

  A novel clicked bisubstrate analogue (NAM-TZ-SPKRIA) was designed and synthesized to be a potent, selective, and first NTMT1 inhibitor.

  设计并合成了一种新型的双底物类似物（NAM-TZ-SPKRIA），它被设计成一种强效、选择性和首个NTMT1抑制剂。