2,3,5-tri-O-benzyl-D-ribitol | 84366-59-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 2,3,5-tri-O-benzyl-D-ribitol
• 英文别名: (2S,3R,4R)-2,3,5-tris(phenylmethoxy)pentane-1,4-diol
• CAS: 84366-59-6
• 化学式: C₂₆H₃₀O₅
• 分子量: 422.521
• InChiKey: NJEJAQAZBITKET-UODIDJSMSA-N

物化性质

• 沸点：
  595.2±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.180±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  68.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,3,5-tri-O-benzyl-D-ribitol 在 咪唑 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.5h， 生成 2,3,5-tri-O-benzyl-1-O-tert-butyldimethylsilyl-4-O-p-nitrobenzoyl-L-lyxitol
  参考文献：
  名称：

  通过 Pummerer 反应立体选择性合成 4'-β-硫核糖核苷†

  摘要：

  描述了使用 Pummerer 反应作为关键步骤的 4'-β-硫代核糖核苷 14、15、27 和 30 的有效立体选择性合成。1,4-脱水-2-O-(2,4-二甲氧基苯甲酰基)-3,5-O-(1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷-1,3-二基)-4-亚磺酰基-的Pummerer反应d-核糖醇 (R-10:S-10 = 2.7:1) 在甲硅烷基化尿嘧啶的存在下以 66% 的收率提供所需的 4'-硫尿苷衍生物 11 的 β-端基异构体，而没有形成其 α-端基异构体。与 R-10 的反应以 87% 的产率得到 11，而与 S-10 的反应导致所需产物 11 的产量减少 27%，同时 3,6-O-(1,1,3 ,3-四异丙基二硅氧烷-1,3-二基)-3-羟基-2-羟基甲基噻吩(12)。观察到的 R-10 和 S-10 反应差异的一个可能解释是反应通过 E2 型途径进行，它更喜欢抗消除。因此，在反应条件下，R-10

  DOI：

  10.1021/ja000541o
• 作为产物：
  描述：

  甲基 2,3,5-三-O-苄基-D-呋喃核糖苷 在 sodium tetrahydroborate 、 甲酸 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 19.0h， 生成 2,3,5-tri-O-benzyl-D-ribitol
  参考文献：
  名称：

  4-硫代呋喃糖苷的合成，反应性和立体选择性

  摘要：

  硫糖，其环内氧取代了硫原子的糖，已被用作天然存在的聚糖的稳定生物等排体，因为硫糖糖苷键对化学和酶促水解作用是稳定的。我们通过实验和计算评估所有四种非对映异构体硫代呋喃糖苷，对呋喃糖基硫杂碳鎓离子的稳定性和反应性进行了深入研究。我们显示，所有呋喃糖基硫代碳鎓离子均以1,2-顺式反应三乙基硅烷的选择性选择，让人联想到它们的羰基合成。噻碳鎓离子所占据的计算构象空间与相应的呋喃糖基氧碳鎓离子的构象空间惊人地相似，这表明支配呋喃糖基氧碳鎓离子和噻碳鎓离子的稳定性的立体电子取代基效应非常相似。尽管硫代核糖-furanose看起来比其氧代相对物，硫代反应性较低的ARA - ，L-来苏- ，和木糖-furanosides看起来比它们的氧当量更具反应性。使用供体和碳阳离子中间体的构象偏好来解释这些差异。硫代核糖的反应性较低（路易斯）酸介导的反应中的呋喃糖苷以及噻吩和氧碳鎓离子的相似性使硫代-核糖-呋喃糖苷成

  DOI：

  10.1021/acs.joc.8b02536

文献信息

• Synthesis of 3′-C-branched 1′,5′-anhydromannitol nucleosides as new antiherpes agents
  作者：Nafizal Hossain、Herman van Halbeek、Erik De Clercq、Piet Herdewijn

  DOI：10.1016/s0040-4020(97)10431-8

  日期：1998.3

  series of 3′-β-C-branched anhydromannitol nucleosides were conveniently synthesized starting from commercially available d-ribose. The reaction sequences were: (i) conversion of the protected pentofuranose to the corresponding nitrohexopyranose; (ii) addition of the conjugated base of the nitrosugar to formaldehyde; (iii) removal of the nitro group by n-tributyltin hydride treatment and (iv) Mitsunobu

  从可商购的d-核糖开始方便地合成一系列3'- β - C-支链脱水甘露醇核苷。反应顺序为：（i）将受保护的戊呋喃糖转化为相应的亚硝基六吡喃糖；（ii）将硝基糖的共轭碱加入甲醛中；（iii）通过氢化三丁基锡处理除去硝基和（iv）Mitsunobu型烷基化以引入核碱基。中间体和最终化合物的构象由NMR分析推导。胸腺嘧啶同类物显示出对单纯疱疹病毒（HSV）的有效活性。
• Synthesis and Evaluation of Hybrid Structures Composed of Two Glucosylceramide Synthase Inhibitors
  作者：Richard J. B. H. N. van den Berg、Erwin R. van Rijssel、Maria Joao Ferraz、Judith Houben、Anneke Strijland、Wilma E. Donker-Koopman、Tom Wennekes、Kimberly M. Bonger、Amar B. T. Ghisaidoobe、Sascha Hoogendoorn、Gijsbert A. van der Marel、Jeroen D. C. Codée、Herman S. Overkleeft、Johannes M. F. G. Aerts

  DOI：10.1002/cmdc.201500407

  日期：2015.12

  in glucosylceramide metabolism—glucosylceramide synthase (GCS), acid glucosylceramidase (GBA1), or neutral glucosylceramidase (GBA2)—is therefore an attractive research objective. In this study we took two established GCS inhibitors, one based on deoxynojirimycin and the other a ceramide analogue, and merged characteristic features to obtain hybrid compounds. The resulting 39‐compound library does

  葡萄糖基神经酰胺的代谢和涉及的酶已在药物化学中引起了极大的兴趣，因为源自葡萄糖基神经酰胺的糖脂水平的异常是导致一系列人类疾病（包括溶酶体贮积病，2型糖尿病和神经退行性疾病）的原因。因此，对参与糖基神经酰胺代谢的一种糖加工酶（糖基神经酰胺合酶（GCS），酸性糖基神经酰胺酶（GBA1）或中性糖基神经酰胺酶（GBA2））的选择性调节是一个有吸引力的研究目标。在这项研究中，我们采用了两种已建立的GCS抑制剂，一种基于脱氧野oji霉素，另一种基于神经酰胺类似物，并合并了特征性特征以获得杂化化合物。所得的39个化合物文库不包含新的GCS抑制剂。但是，有效的（200 nm）鉴定出对GBA2几乎没有活性的GBA1抑制剂，因此可以作为选择性GBA1调节剂作为进一步生物医学开发的先导。
• Synthesis and structural elucidation of 1-(3-C-ethynyl-4-thio-β-<scp>D</scp>-ribofuranosyl)cytosine (4′-thioECyd)
  作者：Noriaki Minakawa、Daisuke Kaga、Yuka Kato、Kanji Endo、Motohiro Tanaka、Takuma Sasaki、Akira Matsuda

  DOI：10.1039/b204993g

  日期：——

  A practical synthesis of 1,4-anhydro-4-thio-D-ribitol (5) via 1,4-dibromo-1,4-dideoxy-2,3,5-tri-O-benzyl-L-lyxitol (12) is described. This method reduced our previous eleven step procedure starting from D-ribose by three steps. The Pummerer reaction of 1,4-anhydro-2-O-(2,4-dimethoxybenzoyl)-3,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-4-sulfinyl-D-ribitol (6) in the presence of N4-benzoylcytosine afforded the 4′-thiocytidine derivative 7b on a large scale. Starting with the resulting 7b, 1-(3-C-ethynyl-4-thio-β-D-ribofuranosyl)cytosine (4; 4′-thioECyd), of which the 4′-oxo congener ECyd (3) is a new type of potent antineoplastic nucleoside developed in our group, was synthesized via elaborate protection and deprotection procedures, and successive reaction with cerium trimethylsilylacetylide. X-Ray crystal structures of 4′-thioECyd (4) and ECyd (3) are presented in this paper. Although striking differences in bond lengths and angles were observed in C1′–S4′ and C4′–S4′, and C4′–S4′–C1′, the overall structures of each compound, including the sugar puckering mode and the syn/anti conformation around the glycosyl bond, were similar.

  1,4-脱水-4-硫代-D-核糖醇的实用合成 (5) 描述了1,4-二溴-1,4-二脱氧-2,3,5-三-O-苄基-L-来木糖醇(12)。该方法将我们之前从 D-核糖开始的十一个步骤减少了三个步骤。 1,4-脱水-2-O-(2,4-二甲氧基苯甲酰基)-3,5-O-(1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷-1,3-二基)-4-亚磺酰基-的Pummerer反应D-核糖醇 (6) 在 N4-苯甲酰胞嘧啶存在下大规模提供 4α-硫胞苷衍生物 7b。从所得的 7b 开始，1-(3-C-乙炔基-4-硫代-β-D-呋喃核糖基)胞嘧啶 (4; 4-thioECyd)，其中 4-oxo 同系物 ECyd (3) 是我们课题组开发的一种新型强效抗肿瘤核苷，是通过精心的保护和脱保护程序，以及与三甲基甲硅烷基乙酰化铈的连续反应合成的。本文介绍了 4-thioECyd (4) 和 ECyd (3) 的 X 射线晶体结构。尽管在 C1-2-S4-2 和 C4-2-S4-2 以及 C4-2-S4-S4-C1-2 中观察到键长和角度的显着差异，但每种化合物的整体结构，包括糖褶皱模式和糖基键周围的顺式/反式构象，都是相似的。
• 4'-thionucleosides and oligomeric compounds
  申请人：Bhat Balkrishen

  公开号：US20050130923A1

  公开（公告）日：2005-06-16

  The present invention provides modified oligomeric compounds and compositions of oligomeric compounds for use in the RNA interference pathway of gene modulation. The modified oligomeric compounds include siRNA and asRNA having at least one affinity modification.

  本发明提供了经过修饰的寡核苷酸化合物和寡核苷酸化合物组合物，用于基因调控的RNA干扰途径。这些经过修饰的寡核苷酸化合物包括至少具有一种亲和力修饰的siRNA和asRNA。
• Glycosidase inhibitors and methods of synthesizing same
  申请人：Pinto Mario Brian

  公开号：US20060247222A1

  公开（公告）日：2006-11-02

  Methods for synthesizing Salacinol, its stereoisomers, and analogues, homologues and other derivatives thereof potentially useful as glycosidase inhibitors are described. In some embodiments the compounds of the invention may have the general formula (I) or (II): The synthetic schemes may comprise reacting a cyclic sulfate with a 5-membered ring sugar containing a heteroatom (X). The heteroatom preferably comprises sulfur, selenium, or nitrogen. The cyclic sulfate and ring sugar reagents may be readily prepared from carbohydrate precursors, such as D-glucose, L-glucose, D-xylose and L-xylose. The target compounds are prepared by opening of the cyclic sulfates by nucleophilic attack of the heteroatoms on the 5-membered ring sugars. The resulting heterocyclic compounds have a stable, inner salt structure comprising a heteroatom cation and a sulfate anion. The synthetic schemes yield various stereoisomers of the target compounds in moderate to good yields with limited side-reactions. Chain-extended analogues of Salacinol are also described.

  本文描述了合成Salacinol及其立体异构体、类似物、同系物和其他衍生物的方法，这些化合物可能用作糖苷酶抑制剂。在某些实施例中，本发明的化合物可能具有通式(I)或(II)。合成方案可以包括将环状硫酸酯与含有杂原子（X）的五元环糖反应。所述杂原子优选包括硫、硒或氮。环状硫酸酯和环状糖试剂可以从碳水化合物前体，如D-葡萄糖、L-葡萄糖、D-木糖和L-木糖中轻松制备。目标化合物通过杂原子对五元环糖的亲核攻击打开环状硫酸酯而制备得到。所得到的杂环化合物具有稳定的内盐结构，包括一个杂原子阳离子和一个硫酸盐阴离子。合成方案以中等到良好的产率产生目标化合物的各种立体异构体，并且副反应有限。还描述了Salacinol的链延长类似物。