({3-[5-(4-acetylamino-2-{5-[5-{3-(dimethylaminopropylcarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl}-carbamoyl]-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl-carbamoyl}pyrrol-1-yl)pentyloxy]-propylcarbamoyl}-methyl)-carbamic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: ({3-[5-(4-acetylamino-2-{5-[5-{3-(dimethylaminopropylcarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl}-carbamoyl]-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl-carbamoyl}pyrrol-1-yl)pentyloxy]-propylcarbamoyl}-methyl)-carbamic acid
• 英文别名: 4-[[4-[[4-acetamido-1-[5-[3-[(2-aminoacetyl)amino]propoxy]pentyl]pyrrole-2-carbonyl]amino]-1-methylpyrrole-2-carbonyl]amino]-N-[3-(dimethylamino)propyl]-1-methylpyrrole-2-carboxamide
• 化学式: C₃₄H₅₂N₁₀O₆
• 分子量: 696.85
• InChiKey: VYTCQWHOMWVEGZ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.7
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  199
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1,5-戊二醇 在 palladium on activated charcoal 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 氢气 、 碘 、 sodium hydride 、 potassium carbonate 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 34.5h， 生成 ({3-[5-(4-acetylamino-2-{5-[5-{3-(dimethylaminopropylcarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl}-carbamoyl]-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl-carbamoyl}pyrrol-1-yl)pentyloxy]-propylcarbamoyl}-methyl)-carbamic acid
  参考文献：
  名称：

  通过合成的三吡咯-肽共轭物具有高亲和力，序列特异性的DNA结合。

  摘要：

  通过含氮系链将bZIP转录因子的基本区域连接至双霉素样三吡咯肽，可产生能够高亲和力识别特定的指定DNA序列的杂合体。氮在系链中的重要性由其被醚键取代引起的亲和力显着降低（超过10倍）表明。氨基丙基链在邻近带有含氮系链的吡咯的吡咯上的连接将亲和力增加约一个数量级。这些结果证实，质子化的胺基在设计的DNA结合肽上的合适位置提供了更高的亲和力，这很可能是由于与磷酸二酯主链形成了盐桥联的接触。

  DOI：

  10.1002/chem.200500010

文献信息

• High Affinity, Sequence Specific DNA Binding by Synthetic Tripyrrole-Peptide Conjugates
  作者：Juan B. Blanco、Olalla Vázquez、José Martínez-Costas、Luis Castedo、José L. Mascareñas

  DOI：10.1002/chem.200500010

  日期：2005.7.4

  basic region of a bZIP transcription factor to a distamycin-like tripyrrole peptide by means of a nitrogen-containing tether produces a hybrid capable of high-affinity recognition of specific, designated DNA sequences. The importance of the nitrogen in the tether is shown by the considerable reduction in affinity (more than 10-fold) caused by its replacement with an ether linkage. Attachment of an

  通过含氮系链将bZIP转录因子的基本区域连接至双霉素样三吡咯肽，可产生能够高亲和力识别特定的指定DNA序列的杂合体。氮在系链中的重要性由其被醚键取代引起的亲和力显着降低（超过10倍）表明。氨基丙基链在邻近带有含氮系链的吡咯的吡咯上的连接将亲和力增加约一个数量级。这些结果证实，质子化的胺基在设计的DNA结合肽上的合适位置提供了更高的亲和力，这很可能是由于与磷酸二酯主链形成了盐桥联的接触。