亲和力数据,例如解离常数(K D)或抑制浓度(IC 50),广泛用于药物发现。但是,这些参数描述了一种平衡状态,由于药代动力学效应,通常在体内无法建立平衡状态,因此它们不一定足以评估药物功效。药理活性的更准确指标是结合过程的动力学,因为它们揭示了蛋白质-
配体复合物的形成速率及其半衰期。虽然如此,尽管对于药物
化学程序来说是非常需要的,但对结构-动力学关系(SKR)的研究仍然很少。使用最近推出的分析工具kinITC,这种情况可能会改变,因为不仅可以从等温滴定量热(ITC)实验中得出结合过程的热力学信息,而且可以得出结合过程的动力学信息。使用kinITC,重新分析了29种
甘露糖苷与细菌粘附素FimH的ITC数据,以使其结合动力学更容易获得。为了验证这些动力学数据,进行了表面等离振子共振(
SPR)实验。kinITC的动力学分析表明,FimH拮抗剂的纳摩尔亲和力来自于(i)处于结合状态的蛋白质与
配体之间的优化相互作用(降低的失速常数k