3,3'-(((2-(3-azidopropyl)-2-methyl-1,3-dioxane-5,5-diyl)bis(methylene))bis(sulfanediyl))dipropanoic acid | 1704097-30-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 3,3'-(((2-(3-azidopropyl)-2-methyl-1,3-dioxane-5,5-diyl)bis(methylene))bis(sulfanediyl))dipropanoic acid
• 英文别名: 3,3a(2)-[[2-(3-Azidopropyl)-2-methyl-1,3-dioxan-5-ylidene]bis(methylenethio)]bis[propanoic acid]；3-[[2-(3-azidopropyl)-5-(2-carboxyethylsulfanylmethyl)-2-methyl-1,3-dioxan-5-yl]methylsulfanyl]propanoic acid
• CAS: 1704097-30-2
• 化学式: C₁₆H₂₇N₃O₆S₂
• 分子量: 421.539
• InChiKey: OZIDODSCMZETBR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.1
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.88
• 拓扑面积：
  158
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3,3'-(((2-(3-azidopropyl)-2-methyl-1,3-dioxane-5,5-diyl)bis(methylene))bis(sulfanediyl))dipropanoic acid 在 N,N-二异丙基乙胺 、 间氯过氧苯甲酸 、 三氟乙酸酐 作用下， 以 氯仿 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.17h， 生成 bis(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3,3'-((2-(3-azidopropyl)-2-methyl-1,3-dioxane-5,5-diyl)bis(methylenesulfinyl))dipropanoate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of two new enrichable and MS-cleavable cross-linkers to define protein–protein interactions by mass spectrometry

  摘要：

  交联质谱（XL-MS）技术从蛋白质复合物中提取结构信息，无需高度纯化的样品、结晶性或大量物质。

  DOI：

  10.1039/c5ob00488h
• 作为产物：
  描述：

  5-溴-2-戊酮 在 sodium azide 、 lithium hydroxide monohydrate 、 camphor-10-sulfonic acid 、 水 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 苯 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 3,3'-(((2-(3-azidopropyl)-2-methyl-1,3-dioxane-5,5-diyl)bis(methylene))bis(sulfanediyl))dipropanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of two new enrichable and MS-cleavable cross-linkers to define protein–protein interactions by mass spectrometry

  摘要：

  交联质谱（XL-MS）技术从蛋白质复合物中提取结构信息，无需高度纯化的样品、结晶性或大量物质。

  DOI：

  10.1039/c5ob00488h

文献信息

• Mass spectrometry-cleavable cross-linking agents
  申请人：The Regents of The University of California

  公开号：US10393752B2

  公开（公告）日：2019-08-27

  Provided herein is synthesis of novel mass spectrometry-cleavable cross-linking agents. The novel mass spectrometry-cleavable cross-linking agents can be used in mass spectrometry, tandem mass spectrometry, and multi-stage tandem mass spectrometry to facilitate structural analysis of intra-protein interactions in proteins and inter-protein interactions in protein complexes. Also provided are methods of mapping intra-protein interactions in proteins and inter-protein interactions in protein complexes.

  本文提供了新型质谱可裂解交联剂的合成方法。新型质谱可裂解交联剂可用于质谱分析、串联质谱分析和多级串联质谱分析，以促进蛋白质中蛋白质内相互作用和蛋白质复合物中蛋白质间相互作用的结构分析。此外，还提供了绘制蛋白质中蛋白质内相互作用和蛋白质复合物中蛋白质间相互作用的方法。
• MASS SPECTROMETRY-CLEAVABLE CROSS-LINKING AGENTS
  申请人：The Regents of The University of California

  公开号：US20170082635A1

  公开（公告）日：2017-03-23

  Provided herein is synthesis of novel mass spectrometry-cleavable cross-linking agents. The novel mass spectrometry-cleavable cross-linking agents can be used in mass spectrometry, tandem mass spectrometry, and multi-stage tandem mass spectrometry to facilitate structural analysis of intra-protein interactions in proteins and inter-protein interactions in protein complexes. Also provided are methods of mapping intra-protein interactions in proteins and inter-protein interactions in protein complexes.