8-(4-methoxyphenyl)-2'-deoxyadenosine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 8-(4-methoxyphenyl)-2'-deoxyadenosine
• 英文别名: 8-(p-methoxyphenyl)-2'-deoxyadenosine；8-(4-methoxyphenyl)-dA；(2R,3S,5R)-5-[6-amino-8-(4-methoxyphenyl)purin-9-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• 化学式: C₁₇H₁₉N₅O₄
• 分子量: 357.369
• InChiKey: DFIUPRQDDZENDP-YNEHKIRRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4-碘苯甲醚 、 2'-脱氧腺苷 在 哌啶 、 copper(l) iodide 、 palladium diacetate 、 caesium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 15.0h， 以75%的产率得到8-(4-methoxyphenyl)-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  Pd(0)/Cu(I)-介导的 2'-脱氧腺苷的直接芳基化：Cu(I) 的机制作用和与相关嘌呤核苷的反应性比较

  摘要：

  Pd/Cu 介导的 2'-脱氧腺苷与各种芳基碘化物的直接芳基化以良好的产率提供了 8-芳基化的 2'-脱氧腺苷衍生物。在显着的反应优化之后，已经确定亚化学计量的哌啶（仲胺）与碳酸铯的组合对于有效的直接芳基化是必要的。一般合成方案允许较低温度的直接芳基化，从而最大限度地减少去糖基化。哌啶效应的起源主要来自原位生成 Pd(OAc) 2 [(CH 2 ) 5 NH] 2. 已经评估了各种铜（I）盐；只有 CuI 能提供良好的 8-芳基化-2'-脱氧腺苷产率。铜 (I) 似乎对 2'-脱氧腺苷具有高结合亲和力，这解释了对这一关键成分的化学计量数量的强制性要求。这些条件与更一般的直接芳基化方案进行比较，例如催化 Pd、配体、酸添加剂，它们不使用铜 (I)。在每种情况下，均未发现可检测到的 2'-脱氧腺苷芳基化。8-芳基-2'-脱氧腺苷产物的构象偏好已通过详细的光谱 (NMR) 和单晶 X 射线衍射研

  DOI：

  10.1021/jo9012282

文献信息

• Pd(0)/Cu(I)-Mediated Direct Arylation of 2′-Deoxyadenosines: Mechanistic Role of Cu(I) and Reactivity Comparisons with Related Purine Nucleosides
  作者：Thomas E. Storr、Christoph G. Baumann、Robert J. Thatcher、Sara De Ornellas、Adrian C. Whitwood、Ian J. S. Fairlamb

  DOI：10.1021/jo9012282

  日期：2009.8.21

  8-arylated-2′-deoxyadenosines. Copper(I) appears to have a high binding affinity for 2′-deoxyadenosine, which explains the mandatory requirement for stoichiometric amounts of this key component. The conditions are compared with more general direct arylation protocols, e.g., catalytic Pd, ligand, acid additives, which do not employ copper(I). In each case, no detectable arylation of 2′-deoxyadenosine was noted

  Pd/Cu 介导的 2'-脱氧腺苷与各种芳基碘化物的直接芳基化以良好的产率提供了 8-芳基化的 2'-脱氧腺苷衍生物。在显着的反应优化之后，已经确定亚化学计量的哌啶（仲胺）与碳酸铯的组合对于有效的直接芳基化是必要的。一般合成方案允许较低温度的直接芳基化，从而最大限度地减少去糖基化。哌啶效应的起源主要来自原位生成 Pd(OAc) 2 [(CH 2 ) 5 NH] 2. 已经评估了各种铜（I）盐；只有 CuI 能提供良好的 8-芳基化-2'-脱氧腺苷产率。铜 (I) 似乎对 2'-脱氧腺苷具有高结合亲和力，这解释了对这一关键成分的化学计量数量的强制性要求。这些条件与更一般的直接芳基化方案进行比较，例如催化 Pd、配体、酸添加剂，它们不使用铜 (I)。在每种情况下，均未发现可检测到的 2'-脱氧腺苷芳基化。8-芳基-2'-脱氧腺苷产物的构象偏好已通过详细的光谱 (NMR) 和单晶 X 射线衍射研
• Efficient One-Step Suzuki Arylation of Unprotected Halonucleosides, Using Water-Soluble Palladium Catalysts
  作者：Elizabeth C. Western、Jonathan R. Daft、Edward M. Johnson、Peter M. Gannett、Kevin H. Shaughnessy

  DOI：10.1021/jo034289p

  日期：2003.8.1

  modification of unprotected halonucleosides is reported herein. Using a catalyst derived from tris(3-sulfonatophenyl)phosphine (TPPTS) and palladium acetate, 8-bromo-2'-deoxyguanosine (8-BrdG) is coupled with arylboronic acids to give 8-aryl-2'-deoxyguanosine adducts (8-ArdG) in excellent yield in a 2:1 water:acetonitrile solvent mixture. The TPPTS ligand was found to be superior to water-soluble alkylphosphines

  修饰核苷以产生药物活性化合物，诱变模型和寡核苷酸结构探针仍然是令人非常感兴趣的。本文报道了未保护的卤代核苷的水相修饰。使用衍生自三（3-磺酰基苯基）膦（TPPTS）和乙酸钯的催化剂，将8-溴2'-脱氧鸟苷（8-BrdG）与芳基硼酸偶合，得到8-芳基-2'-脱氧鸟苷加合物（8 -ArdG）在2：1的水：乙腈溶剂混合物中以优异的收率。对于该偶联反应，发现TPPTS配体优于水溶性烷基膦。偶联化学已扩展到8-溴-2'-脱氧腺苷（8-BrdA）和5-碘-2'-脱氧尿苷（5-IdU），以及核糖核苷8-溴鸟苷和8-溴腺苷。在所有情况下均获得芳基化加合物的良好至优异的收率。使用三（4,6-二甲基-3-磺酰基苯基）膦（TXPTS），可以在室温下不到1小时的时间内完成8-BrdA和5-IdU的Suzuki偶联。该方法学代表了不需要预先保护核苷的卤代核苷芳基化的有效且通用的方法。
• 8-(p-CF3-cinnamyl)-modified purine nucleosides as promising fluorescent probes
  作者：Lital Zilbershtein、Alon Silberman、Bilha Fischer

  DOI：10.1039/c1ob05681f

  日期：——

  Natural nucleotides are not useful as fluorescent probes because of their low quantum yields. Therefore, a common methodology for the detection of RNA and DNA is the application of extrinsic fluorescent dyes coupled to bases in oligonucleotides. To overcome the many limitations from which fluorescent nucleotide–dye conjugates suffer, we have developed novel purine nucleosides with intrinsic fluorescence to be incorporated into oligonucleotide probes. For this purpose we synthesized adenosine and guanosine fluorescent analogues 7–25, conjugated at the C8 position with aryl/heteroaryl moieties either directly, or via alkenyl/alkynyl linkers. Directly conjugated analogues 7–14, exhibited high quantum yields, ϕ >0.1, and short λem (<385 nm). Alkynyl conjugated analogues 22–25, exhibited low quantum yields, ϕ <0.075, and λem<385 nm. The alkenyl conjugated analogues 15–21, exhibited λem 408–459 nm. While analogues 15,16, and 20 bearing an EDG on the aryl moiety, exhibited ϕ <0.02, analogues 17, and 21 with EWG on the aryl moiety, exhibited extremely high quantum yields, ϕ ≈ 0.8, suggesting better intramolecular charge transfer. We determined the conformation of selected adenosine analogues. Directly conjugated analogue 8 and alkynyl conjugated analogue 22, adapted the syn conformation, whereas alkenyl conjugated analogue 15 adapted the anti conformation. Based on the long emission wavelengths, high quantum yields, anti conformation and base-paring compatibility, we suggest analogues 17 and 21 for further development as fluorescent probes for the sensitive detection of genetic material.

  天然核苷酸由于量子产率低，不能用作荧光探针。因此，检测 RNA 和 DNA 的常用方法是应用与寡核苷酸中碱基偶联的外在荧光染料。为了克服荧光核苷酸-染料共轭物所受到的诸多限制，我们开发了具有内在荧光的新型嘌呤核苷，并将其加入寡核苷酸探针中。为此，我们合成了腺苷和鸟苷荧光类似物 7-25，它们在 C8 位直接或通过烯基/炔基连接物与芳基/杂芳基共轭。直接共轭的类似物 7-14 显示出较高的量子产率，ϕ>0.1，λem 较短（<385 nm）。炔基共轭类似物 22-25 的量子产率较低，j <0.075，λem <385 nm。烯基共轭类似物 15-21 的 λem 波长为 408-459 纳米。芳基上带有 EDG 的类似物 15、16 和 20 的 ϕ <0.02，而芳基上带有 EWG 的类似物 17 和 21 的量子产率极高，ϕ ≈ 0.8，表明分子内电荷转移更好。我们测定了部分腺苷类似物的构象。直接共轭类似物 8 和炔基共轭类似物 22 呈合构象，而烯基共轭类似物 15 呈反构象。由于类似物 17 和 21 具有发射波长长、量子产率高、反构象和碱基相容等特点，我们建议将它们进一步开发为荧光探针，用于灵敏地检测遗传物质。
• Formation and propagation of well-defined Pd nanoparticles (PdNPs) during C–H bond functionalization of heteroarenes: are nanoparticles a moribund form of Pd or an active catalytic species?
  作者：Christoph G. Baumann、Sara De Ornellas、Jonathan P. Reeds、Thomas E. Storr、Thomas J. Williams、Ian J.S. Fairlamb

  DOI：10.1016/j.tet.2014.06.002

  日期：2014.9

  benzimidazole and purine derivatives) mediated by Pd(OAc)2, a commonly used C–H bond functionalization catalyst, reveals that well-defined Pd nanoparticles (PdNPs) are rapidly formed under working catalyst conditions. The PdNPs can be characterized ex situ after entrapment in a polymer matrix (polyvinylpyrrolidinone, PVP). Independently synthesized Pd(PVP)NPs are catalytically competent species, exhibiting catalyst

  对常用芳烃键官能化催化剂Pd（OAc）2介导的杂芳烃（例如，吲哚，苯并恶唑，苯并噻唑，苯并咪唑和嘌呤衍生物）的一系列CH键官能化反应的研究表明，定义明确的钯纳米粒子（PdNPs）在工作催化剂条件下迅速形成。PdNPs可以在包裹在聚合物基质（聚乙烯吡咯烷酮，PVP）中后异位表征。独立合成的Pd（PVP）NPs是具有催化作用的物质，其催化活性与Pd（OAc）2相称在几个CH键的官能化反应中。在一系列反应中，Pd浓度是一个共同变量，可以使用极性溶剂（例如DMF，DMSO和乙酸）在工作催化条件下与PdNP的扩散相关。