(2S,3R,4E)-3-(tert-butoxycarbonyl)-4-(1-hydroxy-hexadec-2-enyl)-2,2-dimethyloxazolidine | 115464-03-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑烷类
• 英文名称: (2S,3R,4E)-3-(tert-butoxycarbonyl)-4-(1-hydroxy-hexadec-2-enyl)-2,2-dimethyloxazolidine
• 英文别名: (S)-tert-butyl 4-((R,E)-1-hydroxyhexadec-2-en-1-yl)-2,2-dimethyloxazolidine-3-carboxylate；tert-butyl (4S)-4-[(E,1R)-1-hydroxyhexadec-2-enyl]-2,2-dimethyl-1,3-oxazolidine-3-carboxylate
• CAS: 115464-03-4
• 化学式: C₂₆H₄₉NO₄
• 分子量: 439.679
• InChiKey: YYVXKEWHFAMEKF-DWVLVAQTSA-N

物化性质

• 沸点：
  519.8±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  0.967±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.1
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.88
• 拓扑面积：
  59
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S,3R,4E)-3-(tert-butoxycarbonyl)-4-(1-hydroxy-hexadec-2-enyl)-2,2-dimethyloxazolidine 在 Rh/Al₂O₃ 、 氢气 、 对甲苯磺酸 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 N-叔-丁基氧羰基-D-赤式-二氢-D-鞘氨醇
  参考文献：
  名称：

  稳定的反应中间体和立体定义的叠氮基磷酸酯对鞘氨醇-1-磷酸裂合酶的抑制作用研究

  摘要：

  已经设计了两种PLP依赖性酶鞘氨醇-1-磷酸裂解酶抑制剂，并在细菌（StS1PL）和人（hS1PL）酶上进行了测试。氨基磷酸盐1，12，和32，模仿催化过程的中间醛亚胺，分别在两个酶来源弱抑制剂。另一方面，通过用叠氮基团取代天然底物的氨基而产生的一系列立体定义的叠氮基磷酸酯，在两种酶源上均提供了低微摩尔范围内的竞争性抑制剂。这种相似的行为代表了两种酶在其活性位点水平上报道的结构相似性的实验证据。有趣的是，反-非天然对映异构体系列的异构体，是hS1PL上最有效的抑制剂。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2016.08.008
• 作为产物：
  描述：

  1-十五醇 在 三丁基膦 、 双氧水 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 168.0h， 生成 (2S,3R,4E)-3-(tert-butoxycarbonyl)-4-(1-hydroxy-hexadec-2-enyl)-2,2-dimethyloxazolidine
  参考文献：
  名称：

  神经酰胺 [NS] 的鞘氨醇和酰基链显示出非常不同的结构和动力学，这挑战了我们对皮肤屏障的理解。

  摘要：

  人类皮肤最上层的脂质相被认为包含处于正交相状态的高刚性脂质，以保护身体免受环境影响。通过合成鞘氨醇-d 28氘代 N-lignoceroyl - d -erythro -sphingosine（神经酰胺 [NS]），我们使用 X 射线衍射比较了该脂质在生物学相关混合物中的两条链的结构和动力学，2H NMR分析和红外光谱。我们的结果揭示了在生理温度下处于流体和动态相状态的大部分鞘氨醇链。这些发现促使我们修改了我们目前对皮肤脂质屏障的理解，其中首选扩展的神经酰胺 [NS] 构象，并提出了可能的域结构。移动脂质链可能对皮肤弹性和生理上重要分子的易位至关重要。

  DOI：

  10.1002/anie.202003375

文献信息

• Practical Syntheses of Sphingosine-1-Phosphate and Analogues
  作者：Hans-Ulrich Reissig、Virginie Blot、Ulrich Jacquemard、Burkhard Kleuser

  DOI：10.1055/s-0028-1083373

  日期：——

  including proliferation, survival, and migration. For this reason the stereoselective syntheses of S1P and analogues are of great interest. Based on l-serine as source of chirality we achieved practical routes to prepare S1P (1) and the aryl group containing analogues 3 and 4 in fair amounts. The crucial stages of the syntheses are: introduction of the required side chain by addition of appropriate organometallics

  鞘氨醇-1-磷酸酯（S1P，1）是一种生物活性鞘脂代谢产物，涉及多种关键细胞过程，包括增殖，存活和迁移。因此，S1P及其类似物的立体选择性合成引起人们极大的兴趣。基于1-丝氨酸作为手性来源，我们获得了制备S1P（1）和含有相当量类似物3和4的芳基的实用途径。合成的关键步骤是：通过向Garner醛中添加适当的有机金属来引入所需的侧链，并将伯醇转化为相应的磷酸盐。 磷酸盐-氨基醇-脂质-有机金属试剂-鞘氨醇衍生物
• Synthesis of a Panel of Carbon-13-Labelled (Glyco)Sphingolipids
  作者：Patrick Wisse、Henrik Gold、Mina Mirzaian、Maria J. Ferraz、Ginger Lutteke、Richard J. B. H. N. van den Berg、Hans van den Elst、Johan Lugtenburg、Gijsbert A. van der Marel、Johannes M. F. G. Aerts、Jeroen D. C. Codée、Herman S. Overkleeft

  DOI：10.1002/ejoc.201500025

  日期：2015.4

  The synthesis of a focussed library of sphingolipids differing in the number and position of C-13 labels is described. The synthesised sphingolipids differ in substitution at both the sphingosine amine (either palmitoylated or unmodified) and the sphingosine primary hydroxyl (unmodified or glycosylated). Moreover, C-13 atoms are incorporated into either the sphingosine or the palmitate moiety, or both

  描述了在 C-13 标签的数量和位置上不同的鞘脂集中库的合成。合成的鞘脂在鞘氨醇胺（棕榈酰化或未修饰）和鞘氨醇伯羟基（未修饰或糖基化）处的取代不同。此外，C-13 原子被并入鞘氨醇或棕榈酸酯部分或两者中。这组化合物旨在用于相对定量脂质组学研究，以深入了解健康和患病（溶酶体贮积症）患者和动物模型中的鞘脂代谢
• Synthesis of Gb ₃ Glycosphingolipids with Labeled Head Groups: Distribution in Phase‐Separated Giant Unilamellar Vesicles
  作者：Jeremias Sibold、Katharina Kettelhoit、Loan Vuong、Fangyuan Liu、Daniel B. Werz、Claudia Steinem

  DOI：10.1002/anie.201910148

  日期：2019.12.2

  sphingosine backbone. The synthetic Gb3 glycosphingolipids were reconstituted into coexisting liquid-ordered (lo )/liquid-disordered (ld ) giant unilamellar vesicles (GUVs), and STx binding was verified by fluorescence microscopy. Gb3 with the C24:0 fatty acid partitioned mostly in the lo phase, while the unsaturated C24:1 fatty acid distributes more into the ld phase. The α-hydroxylation does not influence

  受体脂质Gb3负责将志贺毒素（STx）特异性内化到细胞中。Gb3的头基定义了STx结合的特异性，并且具有不同脂肪酸的主链有望影响其在膜内的定位，从而影响膜的组织和蛋白质的内在化。为了研究这种影响，合成了一组标有BODIPY荧光团标记在头部基团上的Gb3糖鞘脂。将C24脂肪酸，饱和的，不饱和的，α-羟基化的衍生物及其组合连接至鞘氨醇主链。合成的Gb3糖鞘脂被重构为共存的液体有序（lo）/液体无序（ld）巨型单层囊泡（GUVs），并通过荧光显微镜验证了STx的结合。带有C24的Gb3：0脂肪酸主要在lo相中分配，而不饱和C24：1脂肪酸则更多地分配到ld相中。α-羟基化不影响其分配。
• Chiral combinatorial preparation and biological evaluation of unique ceramides for inhibition of sphingomyelin synthase
  作者：Sajeer Koolath、Yuta Murai、Yoshiko Suga、Kenji Monde

  DOI：10.1002/chir.23179

  日期：2020.3

  Enantiomers or diastereomers of chiral bioactive compounds often exhibit different biological and toxicological properties. Here, we report the efficient synthesis of four stereoisomers of sphingosine and derivatization of unique chiral ceramides through a combinatorial chemistry by solid‐phase activated resin ester. In addition, to test the effectivity of stereochemistry of ceramide, we demonstrated

  手性生物活性化合物的对映异构体或非对映异构体通常表现出不同的生物学和毒理学性质。在这里，我们报告了鞘氨醇的四种立体异构体的有效合成，以及通过固相活化树脂酯的组合化学，将独特的手性神经酰胺衍生化。此外，为了测试神经酰胺的立体化学的有效性，我们证明了在手性独特神经酰胺存在下基于神经鞘磷脂合成酶抑制的细胞测定，这表明此类文库将是生物活性合成分子的丰富来源。
• Chemoenzymatic Total Synthesis of GM3 Gangliosides Containing Different Sialic Acid Forms and Various Fatty Acyl Chains
  作者：Hai Yu、Madhusudhan Reddy Gadi、Yuanyuan Bai、Libo Zhang、Lei Li、Jun Yin、Peng G. Wang、Xi Chen

  DOI：10.1021/acs.joc.1c00450

  日期：2021.7.2

  diverse GM3 gangliosides containing various sialic acid forms and different fatty acyl chains in low cost, an improved process was developed to chemically synthesize lactosyl sphingosine from an inexpensive l-serine derivative. It was then used to obtain GM3 sphingosines from diverse modified sialic acid precursors by an efficient one-pot multienzyme sialylation system containing Pasteurella multocida

  神经节苷脂是一种含唾液酸的鞘糖脂，已在所有脊椎动物的细胞膜中发现。它们的重要生物学功能由聚糖和神经酰胺脂质成分共同贡献。GM3 是一种主要的神经节苷脂，也是许多其他更复杂的神经节苷脂的前体。为了以低成本获得结构多样的含有各种唾液酸形式和不同脂肪酰基链的 GM3 神经节苷脂，开发了一种改进的工艺，以从廉价的l-丝氨酸衍生物化学合成乳糖基鞘氨醇。然后将其用于通过有效的一锅多酶唾液酸化系统从多种修饰的唾液酸前体中获得 GM3 鞘氨醇，该系统含有多杀性巴氏杆菌唾液酸转移酶 3 (PmST3 )糖核苷酸的产生。然后使用高效的化学酰化和简便的 C18 滤芯纯化工艺来安装不同长度和不同修饰的脂肪酰基链。化学酶法代表了一种强大的全合成策略，可以访问结构定义的 GM3 神经节苷脂库以探索其功能。