Binding and Action of Amino Acid Analogs of Chloramphenicol upon the Bacterial Ribosome
作者:Andrey G. Tereshchenkov、Malgorzata Dobosz-Bartoszek、Ilya A. Osterman、James Marks、Vasilina A. Sergeeva、Pavel Kasatsky、Ekaterina S. Komarova、Andrey N. Stavrianidi、Igor A. Rodin、Andrey L. Konevega、Petr V. Sergiev、Natalia V. Sumbatyan、Alexander S. Mankin、Alexey A. Bogdanov、Yury S. Polikanov
DOI:10.1016/j.jmb.2018.01.016
日期:2018.3
bacterial ribosome and inhibits peptide bond formation. As an approach for modifying and potentially improving properties of this inhibitor, we explored ribosome binding and inhibitory activity of a number of amino acid analogs of CHL. The L-histidyl analog binds to the ribosome with the affinity exceeding that of CHL by 10 fold. Several of the newly synthesized analogs were able to inhibit protein synthesis
抗生素氯霉素(CHL)以中等亲和力结合在细菌核糖体的肽基转移酶中心,并抑制肽键的形成。作为修饰和潜在改善该抑制剂性质的方法,我们探索了核糖体结合和许多CHL氨基酸类似物的抑制活性。L-组氨酸类似物以超过CHL十倍的亲和力与核糖体结合。一些新合成的类似物能够抑制蛋白质合成,并表现出不同于CHL的作用方式。然而,半合成CHL类似物的抑制特性与其亲和力不相关,并且一般而言,与原始抗生素相比,CHL的氨基酸类似物是不太有效的翻译抑制剂。与三个半合成类似物复合的嗜热栖热菌70S核糖体显示,CHL衍生物在肽基转移酶中心结合,在那里被测化合物的氨酰基部分与rRNA建立了特异相互作用。尽管仍然是效率低下的翻译抑制剂,但合成的化合物仍代表着有前途的化学支架,其靶向核糖体的肽基转移酶中心,并可能适合进一步研究。