Supramolecular architecture of 5-bromo-7-methoxy-1-methyl-1H-benzoimidazole.3H2O: Synthesis, spectroscopic investigations, DFT computation, MD simulations and docking studies
作者:P. Krishna Murthy、M. Smitha、Y. Sheena Mary、Stevan Armaković、Sanja J. Armaković、R. Sreenivasa Rao、P.A. Suchetan、L. Giri、Rani Pavithran、C. Van Alsenoy
DOI:10.1016/j.molstruc.2017.08.038
日期:2017.12
interaction with water (hydrolysis) by using bond dissociation energies (BDE) and radial distribution functions (RDF), respectively after MD simulations. In order to identify molecule's most important reactive spots we have used a combination of DFT calculations and MD simulations. Reactivity study encompassed calculations of a set of quantities such as: HOMO-LUMO gap, MEP and ALIE surfaces, Fukui functions
摘要 新合成化合物5-溴-7-甲氧基-1-甲基-1H-苯并咪唑(BMMBI)的晶体和分子结构已通过单晶X射线衍射、FT-IR、FT-Raman、1 H NMR鉴定, 13 C NMR 和紫外-可见光谱技术;编译实验和理论结果,这些结果是通过 DFT/B3LYP/6-311++G(d,p) 方法在气相基态下进行的。通过使用一组图形工具 3D-Hirshfeld 曲面和 2D 指纹图分析,已经研究了分子间相互作用的可视化性质和类型以及这些相互作用在超分子结构中的关键作用。标题化合物通过强分子间氢键 N⋯H2O 和 O⋯HO 稳定,d 范数映射表面上的深红色斑点和 d 范数映射表面上的红点设想的弱 Br⋯Br 接触设想了这些。通过使用 GAR2PED 程序进行的势能分布 (PED) 分析有助于波数的详细基本振动分配,并显示出与实验值的良好一致性。除了前沿轨道分析外,全局反应性描述符、自然键轨道和