(1S)-N-tert-butoxycarbonyl-5-O-tert-butyldimethylsilyl-1-C-(1-cyano-2-hydroxyethenyl)-1,4-dideoxy-1,4-imino-2,3-O-isopropylidene-D-ribitol | 284490-14-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯烷类
• 英文名称: (1S)-N-tert-butoxycarbonyl-5-O-tert-butyldimethylsilyl-1-C-(1-cyano-2-hydroxyethenyl)-1,4-dideoxy-1,4-imino-2,3-O-isopropylidene-D-ribitol
• 英文别名: 1,1-Dimethylethyl (3aS,4S,6R,6aR)-4-[(1Z)-1-cyano-2-hydroxyethenyl]-6-[[[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]oxy]methyl]tetrahydro-2,2-dimethyl-5H-1,3-dioxolo[4,5-c]pyrrole-5-carboxylate；tert-butyl (3aS,4S,6R,6aR)-6-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-[(Z)-1-cyano-2-hydroxyethenyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydro-[1,3]dioxolo[4,5-c]pyrrole-5-carboxylate
• CAS: 284490-14-8
• 化学式: C₂₂H₃₈N₂O₆Si
• 分子量: 454.639
• InChiKey: JXRVZIDPWUDVAH-XHCSWFMASA-N

物化性质

• 沸点：
  543.6±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.085±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.48
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  101
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1S)-N-tert-butoxycarbonyl-5-O-tert-butyldimethylsilyl-1-C-(1-cyano-2-hydroxyethenyl)-1,4-dideoxy-1,4-imino-2,3-O-isopropylidene-D-ribitol 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 sodium acetate 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 39.0h， 生成 7-[(2S,3S,4R,5R)-3,4-二羟基-5-(羟甲基)-2-吡咯烷基]-3,5-二氢-4H-吡咯并[3,2-D]嘧啶-4-酮
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Transition State Analogue Inhibitors for Purine Nucleoside Phosphorylase and N-Riboside Hydrolases

  摘要：

  Syntheses of the 'Immucillins', potent aza-C-nncleoside inhibitors of purine nucleoside phosphorylase are reported as well as those of 5-deoxy-, 5-deoxyfluoro- and 2-deoxy- analogues and others having modified bases. (C) 2000 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(00)00194-0
• 作为产物：
  描述：

  2-[2-[[5-亚氨基-3-甲基-1-(8-磺酸根-2-萘基)-4H-吡唑-4-基]偶氮]-5-[4-[[5-亚氨基-3-甲基-1-(8-磺酸根-2-萘基)-4H-吡唑-4-基]偶氮]-3-(2-羟基-2-羰基-乙氧基)苯基]苯氧基]乙酸四钠 在 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 (1S)-N-tert-butoxycarbonyl-5-O-tert-butyldimethylsilyl-1-C-(1-cyano-2-hydroxyethenyl)-1,4-dideoxy-1,4-imino-2,3-O-isopropylidene-D-ribitol
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Transition State Analogue Inhibitors for Purine Nucleoside Phosphorylase and N-Riboside Hydrolases

  摘要：

  Syntheses of the 'Immucillins', potent aza-C-nncleoside inhibitors of purine nucleoside phosphorylase are reported as well as those of 5-deoxy-, 5-deoxyfluoro- and 2-deoxy- analogues and others having modified bases. (C) 2000 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(00)00194-0

文献信息

• Transition-State Interactions Revealed in Purine Nucleoside Phosphorylase by Binding Isotope Effects
  作者：Andrew S. Murkin、Peter C. Tyler、Vern L. Schramm

  DOI：10.1021/ja7104398

  日期：2008.2.1

  The binding of [5‘-3H]inosine to human purine nucleoside phosphorylase results in an equilibrium binding isotope effect (BIE) of 1.5%, and transition state formation causes an intrinsic KIE of 4.7%. These values reflect atomic vibrational distortions in the 5‘-C−H bonds upon formation of the Michaelis complex and transition state. The degree of atomic distortion for catalysis is compared to that for

  [5'-3H] 肌苷与人嘌呤核苷磷酸化酶的结合导致 1.5% 的平衡结合同位素效应 (BIE)，过渡态形成导致 4.7% 的内在 KIE。这些值反映了 Michaelis 配合物和过渡态形成后 5'-C-H 键中的原子振动畸变。将催化的原子畸变程度与过渡态类似物的结合程度进行比较。过渡态类似物 ImmH 和 DADMe-ImmH 的类似放射性标记形式分别产生 12.6% 和 29.2% 的大 5'-3H BIE。与过渡态类似物形成复合物时发生更大的键扭曲，在过渡态支持比与过渡态类似物形成复合物时更弱的扭曲力。