该YDJ
基因簇的测序的80%中发现大肠杆菌的
基因组和人类微
生物等密切相关的物种。基于位于该簇中的酶的注释,预期它们一起催化未知
碳水化合物的分解代谢。这项研究的重点是YdjI,它位于大肠杆菌K-12的ydj
基因簇中。据预测是未知功能的II类
醛缩酶。在这里,我们描述了这种酶的结构和功能表征。YdjI催化亲的氢/
氘交换小号氢在
磷酸二
羟基丙酮酯(
DHAP)的C3。在
DHAP存在下,YdjI催化与多种醛糖的醛醇缩合。YdjI对具有特定羟基立体
化学和带负电荷的末端(
羧酸根或
磷酸根)的高阶(七碳,八碳和九碳)
单糖表现出强烈的偏爱。最好的底物是l-
阿拉伯糖醛酸,表观k cat为3.0 s –1。该产品,升-
甘油基-升-半乳-octuluronate -1-
磷酸,具有ķ猫/ ķ米的2.1×10值3中号-1小号-1与YdjI后向醛醇缩合反应。这是第一次记录合成升-
甘油基-升-半乳-octuluronate -