6-amino-2-butylsulfonyl-4-cyclohexylmethoxypyrimidine | 651733-96-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 6-amino-2-butylsulfonyl-4-cyclohexylmethoxypyrimidine
• 英文别名: 2-(n-butane-1-sulfonyl)-4-cyclohexylmethoxypyrimidin-6-ylamine；4-cyclohexylmethoxy-2-n-butylsulfonylpyrimidin-6-amine；2-butylsulfonyl-6-(cyclohexylmethoxy)pyrimidin-4-amine；2-(Butane-1-sulfonyl)-6-(cyclohexylmethoxy)pyrimidin-4-amine
• CAS: 651733-96-9
• 化学式: C₁₅H₂₅N₃O₃S
• 分子量: 327.448
• InChiKey: ZAKXYNYWFRXIIU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  104
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-amino-2-butylsulfonyl-4-cyclohexylmethoxypyrimidine 在 三氟乙酸 sodium nitrite 作用下， 以 2,2,2-三氟乙醇 、 水 、 溶剂黄146 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 2-Arylamino-pyrimidine deriv. 9c
  参考文献：
  名称：

  Structure-based design of 2-arylamino-4-cyclohexylmethoxy-5-nitroso-6-aminopyrimidine inhibitors of cyclin-dependent kinase 2

  摘要：

  我们开发了一种从 6-氨基-2-巯基嘧啶-4-醇高效合成 2-取代 O4-环己基甲基-5-亚硝基-6-氨基嘧啶的方法，并将其用于制备一系列衍生物，以评估其作为细胞周期蛋白依赖性激酶 2（CDK2）抑制剂的效果。其结构-活性关系（SAR）与相应的 O6-环己基甲氧基嘌呤系列相似，其中 2-芳基磺酰胺和 2-芳基甲酰胺衍生物显示出卓越的效力。其中 4-(6-氨基-4-环己基甲氧基-5-亚硝基嘧啶-2-基氨基)-N-(2-羟乙基)苯磺酰胺（7q）和 4-(6-氨基-4-环己基甲氧基-5-亚硝基嘧啶-2-基氨基)-N-(2,3-二羟基丙基)苯磺酰胺（7s）这两种化合物的药效最强，IC50 值分别为 0.对 CDK2 的 IC50 值分别为 0.7 ± 0.1 和 0.8 ± 0.0 nM。本研究中确定的 SARs 参照了与磷酸化 CDK2/cyclin A 结合的 4-(6-氨基-4-环己基甲氧基-5-亚硝基嘧啶-2-基氨基)-N-(2,3-二羟基丙基)苯磺酰胺（7j）的晶体结构进行了讨论。

  DOI：

  10.1039/b703241b
• 作为产物：
  描述：

  6-氨基-2-(丁基硫代)嘧啶-4-醇 在 间氯过氧苯甲酸 、 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 41.0h， 生成 6-amino-2-butylsulfonyl-4-cyclohexylmethoxypyrimidine
  参考文献：
  名称：

  Structure-based design of 2-arylamino-4-cyclohexylmethoxy-5-nitroso-6-aminopyrimidine inhibitors of cyclin-dependent kinase 2

  摘要：

  我们开发了一种从 6-氨基-2-巯基嘧啶-4-醇高效合成 2-取代 O4-环己基甲基-5-亚硝基-6-氨基嘧啶的方法，并将其用于制备一系列衍生物，以评估其作为细胞周期蛋白依赖性激酶 2（CDK2）抑制剂的效果。其结构-活性关系（SAR）与相应的 O6-环己基甲氧基嘌呤系列相似，其中 2-芳基磺酰胺和 2-芳基甲酰胺衍生物显示出卓越的效力。其中 4-(6-氨基-4-环己基甲氧基-5-亚硝基嘧啶-2-基氨基)-N-(2-羟乙基)苯磺酰胺（7q）和 4-(6-氨基-4-环己基甲氧基-5-亚硝基嘧啶-2-基氨基)-N-(2,3-二羟基丙基)苯磺酰胺（7s）这两种化合物的药效最强，IC50 值分别为 0.对 CDK2 的 IC50 值分别为 0.7 ± 0.1 和 0.8 ± 0.0 nM。本研究中确定的 SARs 参照了与磷酸化 CDK2/cyclin A 结合的 4-(6-氨基-4-环己基甲氧基-5-亚硝基嘧啶-2-基氨基)-N-(2,3-二羟基丙基)苯磺酰胺（7j）的晶体结构进行了讨论。

  DOI：

  10.1039/b703241b

文献信息

• Facilitation of addition–elimination reactions in pyrimidines and purines using trifluoroacetic acid in trifluoroethanol
  作者：Hayley J. Whitfield、Roger J. Griffin、Ian R. Hardcastle、Andrew Henderson、Jerome Meneyrol、Veronique Mesguiche、Kerry L. Sayle、Bernard T. Golding

  DOI：10.1039/b308948g

  日期：——

  SNAr displacement reactions of 6-cyclohexylmethoxy-2-fluoropurine, 6-amino-2-butylsulfonyl-4-cyclohexylmethoxypyrimidine and 2-amino-6-chloropurine with substituted anilines (e.g. the weakly nucleophilic 4-aminobenzenesulfonamide) are dramatically accelerated in the presence of trifluoroacetic acid and occur especially efficiently in 2,2,2-trifluoroethanol solvent.

  6-环己基甲氧基-2-氟嘌呤、6-氨基-2-丁基磺酰基-4-环己基甲氧基嘧啶和 2-氨基-6-氯嘌呤与取代苯胺（如弱亲核的 4-氨基苯磺酰胺）的 SNAr 置换反应在三氟乙酸存在下显著加快，在 2,2,2-三氟乙醇溶剂中发生的反应尤其有效。
• Synthesis and biological evaluation of 5-substituted O4-alkylpyrimidines as CDK2 inhibitors
  作者：Francesco Marchetti、Céline Cano、Nicola J. Curtin、Bernard T. Golding、Roger J. Griffin、Karen Haggerty、David R. Newell、Rachel J. Parsons、Sara L. Payne、Lan Z. Wang、Ian R. Hardcastle

  DOI：10.1039/b925481a

  日期：——

  CDK2 inhibitory structure–activity relationships have been explored for a range of 5-substituted O4-alkylpyrimidines. Variation of the 5-substituent in the 2,6-diaminopyrimidine series confirmed the 5-nitroso substituent as optimal, and showed that 5-formyl and 5-acetyl substituents were also tolerated at this position. A series of O4-alkyl-N2-aryl-5-substituted-6-aminopyrimidines revealed interesting structure–activity relationships. In the 5-nitroso series, the optimum O4-alkyl substituents were cyclohexylmethyl or sec-butyl, combined with a 2-sulfanilyl group. By contrast, in the N2-arylsulfonamido-5-formyl series, the cyclohexylmethyl compound showed relatively poor activity compared with the sec-butyl derivative (22j, (R)-4-(4-amino-6-sec-butoxy-5-formylpyrimidin-2-ylamino)benzenesulfonamide; CDK2 IC50 = 0.8 nM). Similarly, in the N2-arylsulfonamido-5-(hydroxyiminomethyl) series the O4-sec-butyl substituent conferred greater potency than the cyclohexylmethyl (23c, (rac)-4-(4-amino-6-sec-butoxy-5-(hydroxyiminomethyl)pyrimidin-2-ylamino)benzenesulfonamide; CDK2 IC50 = 7.4 nM). The 5-formyl derivatives show selectivity for CDK2 over other CDK family members, and are growth inhibitory in tumour cells (e.g.22j, GI50 = 0.57 μM).

  我们对一系列 5-取代的 O4-烷基嘧啶的 CDK2 抑制结构-活性关系进行了探索。在 2,6-二氨基嘧啶系列中，5-取代基的变化证实了 5-亚硝基取代基是最佳的，并表明 5-甲酰基和 5-乙酰基取代基在该位置上也是可以容忍的。一系列 O4-烷基-N2-芳基-5-取代的 6-氨基嘧啶揭示了有趣的结构-活性关系。在 5-亚硝基系列中，最佳的 O4-烷基取代基是环己基甲基或仲丁基，再加上一个 2-甲磺酰基。相比之下，在 N2-芳基磺酰胺-5-甲酰基系列中，环己基甲基化合物的活性相对低于仲丁基衍生物（22j，(R)-4-(4-氨基-6-仲丁氧基-5-醛基嘧啶-2-基氨基)苯磺酰胺；CDK2 IC50 = 0.8 nM）。同样，在 N2-芳基磺酰胺-5-（羟基亚氨基甲基）系列中，O4-仲丁基取代基比环己基甲基取代基具有更强的效力（23c，(rac)-4-(4-氨基-6-仲丁氧基-5-(羟基亚氨基甲基)嘧啶-2-基氨基)苯磺酰胺；CDK2 IC50 = 7.4 nM）。5- 甲酰基衍生物对 CDK2 的选择性高于 CDK 家族的其他成员，对肿瘤细胞具有生长抑制作用（例如 22j，GI50 = 0.57 μM）。
• Trifluoroacetic Acid in 2,2,2-Trifluoroethanol Facilitates S_NAr Reactions of Heterocycles with Arylamines
  作者：Benoit Carbain、Christopher R. Coxon、Honorine Lebraud、Kristopher J. Elliott、Christopher J. Matheson、Elisa Meschini、Amy R. Roberts、David M. Turner、Christopher Wong、Celine Cano、Roger J. Griffin、Ian R. Hardcastle、Bernard T. Golding

  DOI：10.1002/chem.201304336

  日期：2014.2.17

  explore diverse sets of reaction conditions, and problems with product purification. In contrast, product isolation from TFA‐TFE reactions is straightforward: evaporation of the reaction mixture, basification and chromatography affords analytically pure material. A total of 45 examples are described with seven discrete heterocyclic scaffolds and 2‐, 3‐ and 4‐substituted anilines giving product yields

  小分子药物的发现需要可靠的合成方法，以将氨基化合物连接到杂环支架上。三氟乙酸-2,2,2-三氟乙醇（TFA-TFE）是实现S N的有效组合苯胺与杂环（例如嘌呤和嘧啶）之间的Ar反应被离去基团（氟，氯，溴或烷基磺酰基）取代。该方法提供了多种化合物，这些化合物含有与激酶有效抑制有关的“激酶特权片段”。TFE由于其低亲核性，易于去除和溶解极性底物的能力而成为有利的溶剂。此外，TFE可以通过使离去基团溶剂化来协助Meisenheimer-Jackson中间体的分解。TFA是必要且有效的酸性催化剂，它可以通过N质子化作用活化杂环，而不会通过转化为苯胺类物质而使苯胺失活。TFA-TFE方法与各种官能团兼容，并补充了有机金属替代品，由于试剂的昂贵，经常需要探索各种反应条件以及产物纯化的问题，这通常是不利的。相比之下，从TFA-TFE反应中分离产物非常简单：反应混合物的蒸发，碱化和色谱分离得到分析纯的物质
• 6-Cyclohexylmethoxy-5-(cyano-NNO-azoxy)pyrimidine-4-amine: A new scaffold endowed with potent CDK2 inhibitory activity
  作者：Donatella Boschi、Paolo Tosco、Naveen Chandra、Shilpi Chaurasia、Roberta Fruttero、Roger Griffin、Lan-Zhen Wang、Alberto Gasco

  DOI：10.1016/j.ejmech.2013.07.031

  日期：2013.10

  Substitution of the cyano-NNO-azoxy moiety (NC-N=(O)N-) for the nitroso group in NU6027, a potent and selective CDK2 inhibitor, affords a compound with slightly improved potency and comparable selectivity profile. A molecular modelling study indicates for this new scaffold a binding mode similar to the one adopted by other purine and pyrimidine analogues, and suggests a relevant role for a conserved water molecule in stabilizing the bioactive pose of this and other pyrimidine ligands. The introduction of aminosulfonylphenyl substituents on the 2-amino group of the pyrimidine increased the CDK2 inhibitory potency by two orders of magnitude, while maintaining the same degree of selectivity. (C) 2013 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.
• Structure-Based design of 2-Arylamino-4-cyclohexylmethyl-5-nitroso-6-aminopyrimidine inhibitors of cyclin-Dependent kinases 1 and 2
  作者：Kerry L. Sayle、Johanne Bentley、F.Thomas Boyle、A.Hilary Calvert、Yuzhu Cheng、Nicola J. Curtin、Jane A. Endicott、Bernard T. Golding、Ian R. Hardcastle、Philip Jewsbury、Veronique Mesguiche、David R. Newell、Martin E.M. Noble、Rachel J. Parsons、David J. Pratt、Lan Z. Wang、Roger J. Griffin

  DOI：10.1016/s0960-894x(03)00651-6

  日期：2003.9

  A series of O(4)-cyclohexylmethyl-5-nitroso-6-aminopyrimidines bearing 2-arylamino substituents was synthesised and evaluated for CDK1 and CDK2 inhibitory activity. Consistent with analogous studies with O(6)-cyclohexylmethylpurines, 2-arylaminopyrimidines with a sulfonamide or carboxamide group at the 4'-position were potent inhibitors, with IC(50) values against CDK2 of 1.1+/-0.3 and 34+/-8 nM, respectively. The crystal structure of the 4'-carboxamide derivative, in complex with phospho-Thr160 CDK2/cyclin A, confirmed the expected binding mode of the inhibitor, and revealed an additional interaction between the carboxamide function and an aspartate residue.