Fmoc-(3-氨基甲基苯基)乙酸 | 631915-50-9

• 物质功能分类: 生物化工 - 生化试剂 - 氨基酸
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: Fmoc-(3-氨基甲基苯基)乙酸
• 中文别名: FMOC-(3-氨基甲基苯基)乙酸
• 英文名称: Fmoc-3-aminomethylphenylacetic acid
• 英文别名: Fmoc-3-aminomethyl-Phac；Fmoc-3-aminoamethylphenylacetic acid；Fmoc-3-aminomethyl-phenylacetic acid；2-[3-[(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)methyl]phenyl]acetic acid
• CAS: 631915-50-9
• 化学式: C₂₄H₂₁NO₄
• 分子量: 387.435
• InChiKey: YQDLUJIUWRFNCH-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  632.6±43.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.279±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  75.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 危险等级：
  IRRITANT
• 海关编码：
  2922499990
• 危险性防范说明：
  P210,P261,P264,P271,P280,P302+P352,P304+P340,P305+P351+P338,P312,P332+P313,P337+P313,P362,P370+P378,P403+P233,P403+P235,P405,P501
• 危险性描述：
  H315,H319,H335
• 储存条件：
  存储条件：2-8℃，干燥。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-联苯乙酸 、 Fmoc-(3-氨基甲基苯基)乙酸 生成 {3-[(2-Biphenyl-4-yl-acetylamino)-methyl]-phenyl}-acetic acid
  参考文献：
  名称：

  Wavelength dependent photo-controlled differential release of compounds from solid phase resin

  摘要：

  本文介绍了一种利用可调激光与色度正交的可光化连接体相结合，实现光介导的珠基化合物库差异释放的方法。

  DOI：

  10.1039/b304477g
• 作为产物：
  描述：

  氯甲酸-9-芴基甲酯 、 3-氨基甲苯乙酸 在 sodium carbonate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 生成 Fmoc-(3-氨基甲基苯基)乙酸
  参考文献：
  名称：

  Discovery of Novel Nonpeptidic PAR2 Ligands

  摘要：

  Proteinase-activated receptor 2 (PAR2) is a class A G protein-coupled receptor whose activation has been associated with inflammatory diseases and cancer, thus representing a valuable therapeutic target. Pathophysiological roles of PAR2 are often characterized using peptidic PAR2 agonists. Peptidic ligands are frequently unstable in vivo and show poor bioavailability, and only a few approaches toward drug-like nonpeptidic PAR2 ligands have been described. The herein-described ligand 5a (IK187) is a nonpeptidic PAR2 agonist with submicromolar potency in a functional assay reflecting G protein activation. The ligand also showed substantial ss-arrestin recruitment. The development of the compound was guided by the crystal structure of PAR2, when the C-terminal end of peptidic agonists was replaced by a small molecule based on a disubstituted phenylene scaffold. IK187 shows preferable metabolic stability and may serve as a lead compound for the development of nonpeptidic drugs addressing PAR2.

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.0c00154

文献信息

• [EN] RADIOLABELED COMPOUNDS TARGETING THE PROSTATE-SPECIFIC MEMBRANE ANTIGEN<br/>[FR] COMPOSÉS RADIOMARQUÉS CIBLANT L'ANTIGÈNE MEMBRANAIRE SPÉCIFIQUE DE LA PROSTATE
  申请人：PROVINCIAL HEALTH SERVICES AUTHORITY

  公开号：WO2020252598A1

  公开（公告）日：2020-12-24

  A compound comprising a prostate specific membrane antigen (PSMA)-targeting moiety of the following formula or of a salt or a solvate thereof. R0 is O or S. Each of R1a, R1b and R1c may be –CO2H, –SO2H, –SO3H, –PO2H, or –PO3H2, for example. R2 may be methylene or a derivative thereof, propylene or a derivative thereof, or a derivative of ethylene, optionally substituted. R3 is a linker. When the PSMA-targeting moiety is linked to a radiolabeling group, the compound may be used as an imaging agent or therapeutic agent for PSMA-expressing diseases/conditions.

  一种化合物，包括以下结构式或其盐或溶剂化合物的前列腺特异性膜抗原（PSMA）靶向基团。R0为O或S。R1a、R1b和R1c中的每一个可以是-CO2H、-SO2H、-SO3H、-PO2H或-PO3H2，例如。R2可以是亚甲基或其衍生物、丙烯基或其衍生物，或乙烯的衍生物，可选择性地取代。R3是一个连接基。当PSMA靶向基团与放射标记基团连接时，该化合物可用作PSMA表达疾病/病况的成像剂或治疗剂。
• Structure‐Based Macrocyclization of Substrate Analogue NS2B‐NS3 Protease Inhibitors of Zika, West Nile and Dengue viruses
  作者：Niklas J. Braun、Jun P. Quek、Simon Huber、Jenny Kouretova、Dorothee Rogge、Heike Lang‐Henkel、Ezekiel Z. K. Cheong、Bing L. A. Chew、Andreas Heine、Dahai Luo、Torsten Steinmetzer

  DOI：10.1002/cmdc.202000237

  日期：2020.8.5

  compounds inhibit the ZIKV protease with K i values <5 nM. Crystal structures of seven ZIKV protease inhibitor complexes were determined to support the inhibitor design. All the cyclic compounds possess high selectivity against trypsin‐like serine proteases and furin‐like proprotein convertases. Both WNV and DENV4 proteases are inhibited less efficiently. Nonetheless, similar structure‐activity relationships

  已经设计了一系列来自Zika（ZIKV），West Nile（WNV）和Dengue-4（DENV4）病毒的NS2B-NS3蛋白酶的环状活性定点抑制剂。最有效的化合物在P1位置包含反向掺入的d-赖氨酸残基。它的侧链连接到P2主链，其α-氨基被转化为胍基以与S1口袋中的保守Asp129侧链相互作用，并且其C末端通过不同的连接体节段连接到P3残基。最有效的化合物通过K i抑制ZIKV蛋白酶值<5 nM。确定了七个ZIKV蛋白酶抑制剂复合物的晶体结构以支持抑制剂的设计。所有的环状化合物对胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶和弗林蛋白酶样前蛋白转化酶都有很高的选择性。WNV和DENV4蛋白酶的抑制效率均较低。尽管如此，对于这些酶仍观察到相似的构效关系，因此表明它们作为泛黄病毒蛋白酶抑制剂的潜在应用。
• Off-DNA DNA-Encoded Library Affinity Screening
  作者：Amber L. Hackler、Forrest G. FitzGerald、Vuong Q. Dang、Alexander L. Satz、Brian M. Paegel

  DOI：10.1021/acscombsci.9b00153

  日期：2020.1.13

  DNA-encoded library (DEL) technology is emerging as a key element of the small molecule discovery toolbox. Conventional DEL screens (i.e., on-DNA screening) interrogate large combinatorial libraries via affinity selection of DNA-tagged library members that are ligands of a purified and immobilized protein target. In these selections, the DNA tags can materially and undesirably influence target binding

  DNA编码文库（DEL）技术正在成为小分子发现工具箱的关键要素。常规的DEL筛选（即DNA上筛选）通过亲和选择DNA标记的文库成员来查询大型组合文库，这些成员是纯化并固定的蛋白质靶标的配体。在这些选择中，DNA标签会实质性和不希望地影响靶标结合，因此影响实验结果。在这里，我们使用固相DEL和基于液滴的微流体筛选将DEL成员与其DNA标签分离（即脱DNA筛选），用于随后的液滴内激光诱导的荧光偏振（FP）检测靶标结合，避免了DNA标签的干扰。使用受体酪氨酸激酶（RTK）盘状结构域受体1（DDR1）作为液滴规模竞争结合测定中的概念证明目标，我们筛选了67 100个成员的药物样小分子固相DEL用于DDR1的竞争性配体，并鉴定了几种已知的RTK抑制剂药效基团，包括含氮吲哚和喹唑啉酮的单体。带有FP检测的DNA外DEL亲和力筛选可能适用于各种各样的目标类别，包括核酸结合蛋白，难以过表达和纯化的蛋白质或没有已知活性测定的目标。
• Boroleucine‐Derived Covalent Inhibitors of the ZIKV Protease
  作者：Niklas J. Braun、Simon Huber、Luna C. Schmacke、Andreas Heine、Torsten Steinmetzer

  DOI：10.1002/cmdc.202200336

  日期：2023.2

  Numerous peptidic inhibitors of the Zika virus NS2B-NS3 protease with boroleucine as P1 residue were synthesized. A Ki value of 8 nM was determined for the most potent inhibitor of this series. A crystal structure of this compound in complex with the ZIKV protease has proven the covalent binding mode of this inhibitor type and revealed an unexpected orientation of the P3 side chain.

  合成了许多以硼亮氨酸为 P1 残基的寨卡病毒 NS2B-NS3 蛋白酶肽抑制剂。该系列中最有效的抑制剂的 K i值为8 nM。该化合物与 ZIKV 蛋白酶复合的晶体结构证明了该抑制剂类型的共价结合模式，并揭示了 P3 侧链的意外方向。
• Synthesis and structural characterization of new macrocyclic inhibitors of the Zika virus NS2B–NS3 protease
  作者：Simon Huber、Niklas J. Braun、Luna C. Schmacke、Robin Murra、Daniela Bender、Eberhard Hildt、Andreas Heine、Torsten Steinmetzer

  DOI：10.1002/ardp.202400250

  日期：2024.9

  by neutral residues, all of these inhibitors possess Ki values >1 µM. However, it is possible to replace the P2 lysine with the less basic 3-aminomethylphenylalanine, which provides a similarly potent inhibitor of the ZIKV protease (Ki = 2.69 nM). Crystal structure investigations showed that the P2 benzylamine structure forms comparable interactions with the protease as lysine. Twelve additional structures

  合成了三个新系列的寨卡病毒 (ZIKV) NS2B–NS3 蛋白酶大环活性定点抑制剂。首先，尝试用不带电且疏水性更强的残基取代我们之前描述的抑制剂的碱性 P3 赖氨酸残基。这提供了许多抑制常数在 30 至 50 nM 之间的化合物。当 P2 赖氨酸被中性残基取代时，观察到抑制效力有更强烈的降低，所有这些抑制剂都具有 >1 µM 的K值。然而，可以用碱性较低的 3-氨基甲基苯丙氨酸取代 P2 赖氨酸，这提供了类似有效的 ZIKV 蛋白酶抑制剂 ( K = 2.69 nM)。晶体结构研究表明，P2 苄胺结构与蛋白酶形成与赖氨酸相当的相互作用。确定了这些抑制剂与蛋白酶复合物的 12 个附加结构，这解释了本研究中获得的许多（但不是全部）SAR 数据。 P2 或 P3 位点的所有单独修饰都会导致抑制剂在细胞培养物中抗病毒功效较低。因此，合成了第三个具有组合修饰的抑制剂系列；它们都在接头片段中含有更具疏水性的d-环己基丙氨酸。在浓度为