已经设计了一系列来自Zika(ZIKV),West Nile(WNV)和Dengue-4(DENV4)病毒的NS2B-
NS3蛋白酶的环状活性定点
抑制剂。最有效的化合物在P1位置包含反向掺入的d-赖
氨酸残基。它的侧链连接到P2主链,其α-
氨基被转化为
胍基以与S1口袋中的保守Asp129侧链相互作用,并且其C末端通过不同的连接体节段连接到P3残基。最有效的化合物通过K i抑制ZIKV
蛋白酶值<5 nM。确定了七个ZIKV蛋白酶抑制剂复合物的晶体结构以支持抑制剂的设计。所有的环状化合物对胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶和弗林蛋白酶样前蛋白转化酶都有很高的选择性。WNV和DENV4
蛋白酶的抑制效率均较低。尽管如此,对于这些酶仍观察到相似的构效关系,因此表明它们作为泛黄病毒蛋白酶抑制剂的潜在应用。