4-(2-pyrrolidinylethoxy)quinolin-2-ylamine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: 4-(2-pyrrolidinylethoxy)quinolin-2-ylamine
• 英文别名: 4-(2-Pyrrolidinyl-ethoxy)-quinolin-2-ylamine；4-(2-pyrrolidin-1-ylethoxy)quinolin-2-amine
• 化学式: C₁₅H₁₉N₃O
• 分子量: 257.335
• InChiKey: YWMHKHMYGARJMV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  51.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(2-pyrrolidinylethoxy)quinolin-2-ylamine 在 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 1-氯-N,N,2-三甲基丙烯胺 、 sodium ascorbate 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 3.17h， 生成
  参考文献：
  名称：

  通过原位点击化学选择性 RNA 与 DNA G-四链体靶向

  摘要：

  一切都按部就班：通过使用由非沃森-克里克 DNA 二级结构催化的一系列炔烃和叠氮化物构件的无铜 1,3-偶极环加成，已经鉴定出一种有效的端粒靶向小分子（参见图片）。这种方法可以快速识别出意想不到的有效小分子探针，以选择性地靶向给定的 RNA 或 DNA。

  DOI：

  10.1002/anie.201206281
• 作为产物：
  描述：

  C₁₇H₂₁N₃O₂ 在 一水合肼 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 生成 4-(2-pyrrolidinylethoxy)quinolin-2-ylamine
  参考文献：
  名称：

  Pyridostatin 及其与 G-四链体特异性结合的衍生物的结构基础

  摘要：

  核酸 G-四链体 (G4) 已成为癌症和神经退行性疾病等多种疾病的有希望的治疗靶点。在小分子 G4 结合剂中，pyridostatin (PDS) 及其衍生物 (例如PyPDS) 对 G4 表现出高度特异性，但它们特异性识别 G4 的结构基础仍然未知。在这里，我们提出了 PyPDS 和 PDS 的两种解决方案结构，具有四重-双重混合。结构表明，通过柔性酰胺键连接的 PyPDS/PDS 的刚性芳环与 G-四联体平面自适应匹配，增强了 π-π 堆叠并实现了对 G4s 的特异性识别。PyPDS/PDS 的脂肪胺侧链通过调节构象与磷酸骨架相互作用氢键和静电相互作用，增加对 G4 的亲和力。此外，PyPDS/PDS 酰胺键的 N-H通过氢键与 G-四联体鸟嘌呤的两个 O 6 s 相互作用，进一步提高了对 G4s 的亲和力，这与大多数 G4 配体不同。我们的研究结果从结构的角度揭示了配体中刚性和柔性结

  DOI：

  10.1021/jacs.2c04775

文献信息

• Pyridostatin analogues promote telomere dysfunction and long-term growth inhibition in human cancer cells
  作者：Sebastian Müller、Deborah A. Sanders、Marco Di Antonio、Stephanos Matsis、Jean-François Riou、Raphaël Rodriguez、Shankar Balasubramanian

  DOI：10.1039/c2ob25830g

  日期：——

  The synthesis, biophysical and biological evaluation of a series of G-quadruplex interacting small molecules based on a N,N′-bis(quinolinyl)pyridine-2,6-dicarboxamide scaffold is described. The synthetic analogues were evaluated for their ability to stabilize telomeric G-quadruplex DNA, some of which showed very high stabilization potential associated with high selectivity over double-stranded DNA. The compounds exhibited growth arrest of cancer cells with detectable selectivity over normal cells. Long-time growth arrest was accompanied by senescence, where telomeric dysfunction is a predominant mechanism together with the accumulation of restricted DNA damage sites in the genome. Our data emphasize the potential of a senescence-mediated anticancer therapy through the use of G-quadruplex targeting small molecules based on the molecular framework of pyridostatin.

  描述了一系列基于N,N′-双(喹啉基)吡啶-2,6-二羧酰胺支架的G-四链体相互作用小分子的合成、生物物理和生物学评估。这些合成的类似物被评估了其稳定端粒G-四链体DNA的能力，其中一些显示出很高的稳定潜力，并对双链DNA表现出很高的选择性。这些化合物在抑制癌细胞生长方面表现出可检测的选择性，且相对于正常细胞具有显著性。长期的生长抑制伴随着细胞衰老，其中端粒功能障碍是主要机制，同时伴有基因组内限制性DNA损伤位点的积累。我们的数据强调了通过使用基于吡啶斯塔丁分子框架的G-四链体靶向小分子，实施衰老介导的抗癌治疗的潜力。
• Controlled-folding of a small molecule modulates DNA G-quadruplex recognition
  作者：Sebastian Müller、G. Dan Pantoş、Raphaël Rodriguez、Shankar Balasubramanian

  DOI：10.1039/b816861j

  日期：——

  Differential recognition of diverse G-quadruplex structures can be achieved by controlling the folding of a small molecule.

  通过控制小分子的折叠，可以实现对不同 G- 四叉结构的差异化识别。
• Selective RNA Versus DNA G-Quadruplex Targeting by In Situ Click Chemistry
  作者：Marco Di Antonio、Giulia Biffi、Angelica Mariani、Eun-Ang Raiber、Raphaël Rodriguez、Shankar Balasubramanian

  DOI：10.1002/anie.201206281

  日期：2012.10.29

  It all clicks into place: A potent telomere‐targeting small molecule has been identified by using the copper‐free 1,3‐dipolar cycloaddition of a series of alkyne and azide building blocks catalyzed by a non‐Watson–Crick DNA secondary structure (see picture). This method rapidly identifies, otherwise unanticipated, potent small‐molecule probes to selectively target a given RNA or DNA.

  一切都按部就班：通过使用由非沃森-克里克 DNA 二级结构催化的一系列炔烃和叠氮化物构件的无铜 1,3-偶极环加成，已经鉴定出一种有效的端粒靶向小分子（参见图片）。这种方法可以快速识别出意想不到的有效小分子探针，以选择性地靶向给定的 RNA 或 DNA。
• Structural Basis of Pyridostatin and Its Derivatives Specifically Binding to G-Quadruplexes
  作者：Liu-Yi Liu、Tian-Zhu Ma、You-Liang Zeng、Wenting Liu、Zong-Wan Mao

  DOI：10.1021/jacs.2c04775

  日期：2022.7.6

  the structural basis for their specific recognition of G4s remains unknown. Here, we presented two solution structures of PyPDS and PDS with a quadruplex–duplex hybrid. The structures indicate that the rigid aromatic rings of PyPDS/PDS linked by flexible amide bonds match adaptively with G-tetrad planes, enhancing π–π stacking and achieving specific recognition of G4s. The aliphatic amine side chains

  核酸 G-四链体 (G4) 已成为癌症和神经退行性疾病等多种疾病的有希望的治疗靶点。在小分子 G4 结合剂中，pyridostatin (PDS) 及其衍生物 (例如PyPDS) 对 G4 表现出高度特异性，但它们特异性识别 G4 的结构基础仍然未知。在这里，我们提出了 PyPDS 和 PDS 的两种解决方案结构，具有四重-双重混合。结构表明，通过柔性酰胺键连接的 PyPDS/PDS 的刚性芳环与 G-四联体平面自适应匹配，增强了 π-π 堆叠并实现了对 G4s 的特异性识别。PyPDS/PDS 的脂肪胺侧链通过调节构象与磷酸骨架相互作用氢键和静电相互作用，增加对 G4 的亲和力。此外，PyPDS/PDS 酰胺键的 N-H通过氢键与 G-四联体鸟嘌呤的两个 O 6 s 相互作用，进一步提高了对 G4s 的亲和力，这与大多数 G4 配体不同。我们的研究结果从结构的角度揭示了配体中刚性和柔性结