ethyl (2S,3R)-2-hydroxy-3-(3-indolyl)butanoate | 150131-72-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: ethyl (2S,3R)-2-hydroxy-3-(3-indolyl)butanoate
• 英文别名: ethyl (2S,3R)-2-hydroxy-3-(1H-indol-3-yl)butanoate
• CAS: 150131-72-9
• 化学式: C₁₄H₁₇NO₃
• 分子量: 247.294
• InChiKey: BIFYNMVQOPJLSO-RNCFNFMXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  62.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl (2S,3R)-2-hydroxy-3-(3-indolyl)butanoate 在 potassium tert-butylate 作用下， 以 水 、 叔丁醇 为溶剂， 生成 (-)-吲哚霉素
  参考文献：
  名称：

  用于生产卤代吲哚霉素抗生素的工程生物合成合成平台

  摘要：

  Indolmycin 是一种来自灰色链霉菌ATCC 12648 的抗生素，具有对抗幽门螺杆菌、恶性疟原虫和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的活性。在这里，我们描述了利用大肠杆菌中的吲哚霉素生物合成基因来制造吲哚霉素酸，吲哚霉素生物合成中的手性中间体，然后可以通过三步合成将其转化为吲哚霉素。为了扩大吲哚霉素结构多样性，我们将混杂的色氨酸-tRNA合成酶基因（ trpS ）引入大肠杆菌生产系统中，并喂入卤化吲哚以生成相应的吲哚霉素酸，最终使我们能够通过合成获得吲哚霉素衍生物。针对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的生物活性测试显示，5-、6-和7-氟吲哚霉素具有适度的抗生素活性。

  DOI：

  10.1039/d0sc05843b
• 作为产物：
  描述：

  丁酸,2-氯-3-羟基-,乙基酯,(2R,3R)- 在 sodium ethanolate 、 四氯化锡 作用下， 以 四氯化碳 、 乙醇 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 ethyl (2S,3R)-2-hydroxy-3-(3-indolyl)butanoate
  参考文献：
  名称：

  Practical Synthesis of Optically Pure Methyl (2R,3S)-2,3-Epoxybutanoate via Microbial Asymmetric Reduction of α-Chloroacetoacetate

  摘要：

  用贝克酵母不对称还原δ-氯乙酰乙酸乙酯（3），然后用乙醇钠处理，得到(2R,3S)-( 8)和(2S,3S)-2,3-环氧丁酸乙酯（9）的混合物（8/9，85：通过对相应环氧酸非对映异构体混合物的布鲁氨酸盐进行一次重结晶，可将其转化为光学纯度较高的 (2R,3S)-2,3-环氧丁酸甲酯 (25)。

  DOI：

  10.1055/s-1993-25895

文献信息

• Investigate Natural Product Indolmycin and the Synthetically Improved Analogue Toward Antimycobacterial Agents
  作者：Yuhong Yang、Yuanyuan Xu、Yuan Yue、Heng Wang、Yumeng Cui、Miaomiao Pan、Xi Zhang、Lin Zhang、Haitao Li、Min Xu、Yefeng Tang、Shawn Chen

  DOI：10.1021/acschembio.1c00394

  日期：2022.1.21

  Indolmycin (IND) is a microbial natural product that selectively inhibits bacterial tryptophanyl-tRNA synthetase (TrpRS). The tryptophan biosynthesis pathway was recently shown to be an important target for developing new antibacterial agents against Mycobacterium tuberculosis (Mtb). We investigated the antibacterial activity of IND against several mycobacterial model strains. A TrpRS biochemical assay

  吲哚霉素 (IND) 是一种微生物天然产物，可选择性抑制细菌色氨酸-tRNA 合成酶 (TrpRS)。色氨酸生物合成途径最近被证明是开发针对结核分枝杆菌(Mtb) 的新型抗菌剂的重要目标。我们研究了 IND 对几种分枝杆菌模型菌株的抗菌活性。开发了一种 TrpRS 生化试验来分析合成 IND 类似物的文库。4″-甲基化 IND 化合物 Y-13 显示出改善的抗 Mtb 活性，最小抑制浓度 (MIC) 为 1.88 μM (~0.5 μg/mL)。当在基因工程替代牛分枝杆菌中诱导 TrpRS 过表达时，MIC 显着增加卡介苗。Mtb TrpRS 与 IND 和 ATP 复合的共晶结构表明氨基酸袋处于 apo 蛋白的开放形式和与反应中间体的封闭复合物之间的状态。在基于全细胞的实验中，我们研究了 Y-13 与不同抗菌剂的组合效果。我们通过基因组测序评估了杀伤动力学、对 IND 的抗性频率以及 IND
• Development of a Stereoselective Practical Synthetic Route to Indolmycin, a Candidate Anti-H. pylori Agent.
  作者：Atsushi HASUOKA、Yutaka NAKAYAMA、Mari ADACHI、Hidenori KAMIGUCHI、Keiji KAMIYAMA

  DOI：10.1248/cpb.49.1604

  日期：——

  A stereoselective practical synthetic route to indolmycin is described. The route is composed of the regioselective coupling of indolyl magnesium halide with a trans-epoxy ester, diastereoselective oxazolone ring formation with guanidine and amine exchange reaction with methylamine. In the coupling step, use of dichloromethane as co-solvent and conversion of the resulting hydroxy ester to the hydroxy

  描述了向吲哚霉素的立体选择性实用合成途径。该途径由吲哚基卤化镁与反式环氧酯的区域选择性偶联，与胍的非对映选择性恶唑酮环形成以及与甲胺的胺交换反应组成。在偶联步骤中，使用二氯甲烷作为助溶剂并将所得的羟基酯转化为用于纯化的羟基酸使该方法有效和实用。通过在室温下用胍和叔丁醇钾在叔丁醇中的处理，以良好的产率形成恶唑酮环，而在C5位没有差向异构。在最后一步中，将氨基在5℃的甲胺水溶液中有效地转化为甲基氨基。吲哚霉素是由旋光反式环氧酯立体选择性合成的，总产率为22％。该途径用于吲哚霉素的代谢产物的制备。
• ISHIZUKA, NATSUKI, J. CHEM. SOC. PT 1. PERKIN TRANS.,(1990) N, C. 813-826
  作者：ISHIZUKA, NATSUKI

  DOI：——

  日期：——
• An engineered biosynthetic–synthetic platform for production of halogenated indolmycin antibiotics
  作者：Elesha R. Hoffarth、Sunnie Kong、Hai-Yan He、Katherine S. Ryan

  DOI：10.1039/d0sc05843b

  日期：——

  tryptophanyl-tRNA synthetase gene (trpS) into our E. coli production system and feed halogenated indoles to generate the corresponding indolmycenic acids, ultimately allowing us to access indolmycin derivatives through synthesis. Bioactivity testing against methicillin-resistant Staphylococcus aureus showed modest antibiotic activity for 5-, 6-, and 7-fluoro-indolmycin.

  Indolmycin 是一种来自灰色链霉菌ATCC 12648 的抗生素，具有对抗幽门螺杆菌、恶性疟原虫和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的活性。在这里，我们描述了利用大肠杆菌中的吲哚霉素生物合成基因来制造吲哚霉素酸，吲哚霉素生物合成中的手性中间体，然后可以通过三步合成将其转化为吲哚霉素。为了扩大吲哚霉素结构多样性，我们将混杂的色氨酸-tRNA合成酶基因（ trpS ）引入大肠杆菌生产系统中，并喂入卤化吲哚以生成相应的吲哚霉素酸，最终使我们能够通过合成获得吲哚霉素衍生物。针对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的生物活性测试显示，5-、6-和7-氟吲哚霉素具有适度的抗生素活性。
• Practical Synthesis of Optically Pure Methyl (2<i>R</i>,3<i>S</i>)-2,3-Epoxybutanoate via Microbial Asymmetric Reduction of α-Chloroacetoacetate
  作者：Hiroyuki Akita、Reiko Todoroki、Hiroshi Endo、Yoshinobu Ikari、Takeshi Oishi

  DOI：10.1055/s-1993-25895

  日期：——

  Asymmetric reduction of ethyl α-chloroacetoacetate (3) with Baker's yeast followed by treatment with sodium ethoxide afforded a mixture of ethyl (2R,3S)-( 8) and (2S,3S)-2,3-epoxybutanoate (9) (8/9, 85:15), which could be converted into the optically pure methyl (2R,3S)-2,3-epoxybutanoate (25) via one recrystallization of the brucine salt of the diastereomeric mixture of the corresponding epoxy acid.

  用贝克酵母不对称还原δ-氯乙酰乙酸乙酯（3），然后用乙醇钠处理，得到(2R,3S)-( 8)和(2S,3S)-2,3-环氧丁酸乙酯（9）的混合物（8/9，85：通过对相应环氧酸非对映异构体混合物的布鲁氨酸盐进行一次重结晶，可将其转化为光学纯度较高的 (2R,3S)-2,3-环氧丁酸甲酯 (25)。