benzyl (2S)-2-hydroxy-4-methylpentanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: benzyl (2S)-2-hydroxy-4-methylpentanoate
• 英文别名: (S)-benzyl 2-hydroxy-4-methylpentanoate；benzyl (S)-2-hydroxy-4-methylpentanoate；benzyl (S)-(-)-2-hydroxyisocaproate；benzyl (-)-2-hydroxyisocaproate；benzyl (2S)-2-hydroxy-4-methylvalerate
• 化学式: C₁₃H₁₈O₃
• 分子量: 222.284
• InChiKey: LNYCLASVFGVAII-LBPRGKRZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  46.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl (2S)-2-hydroxy-4-methylpentanoate 在 palladium on activated charcoal 4-二甲氨基吡啶 、 五氟苯基二苯基磷酸酯 、 氢气 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 间氯过氧苯甲酸 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 46.5h， 生成 cryptophycin 52
  参考文献：
  名称：

  对映体合成有效的抗有丝分裂抗肿瘤药（+）-隐霉素52（LY355703）。

  摘要：

  描述了隐藻霉素52（2）的高度对映选择性和聚合反应，这是一种非常有效的细胞毒剂。隐藻霉素家族的一种合成变体-隐藻霉素52，目前正在临床试验中。合成是收敛的，涉及三个片段的组装，苯基己烯醛3，d-酪氨酸膦酸酯4和受保护的β-氨基酸衍生物5。片段3的合成涉及C-3和C3的两个立体发生中心的有效和立体控制的构建。通过酰基氧碳鎓离子中间体裂解取代的四氢呋喃环而得到C-4。这两个立体生成中心均来自光学活性的4-苯基丁内酯，其是通过Corey-Bakshi-Shibata还原对映选择性合成的。

  DOI：

  10.1021/jo035077v
• 作为产物：
  描述：

  L-亮氨酸 在 硫酸 、 水 、 三乙胺 、 sodium nitrite 作用下， 以 丙酮 为溶剂， 反应 81.0h， 生成 benzyl (2S)-2-hydroxy-4-methylpentanoate
  参考文献：
  名称：

  通过系统置换酰胺获得的一系列线性亮氨酸脑啡肽类似物的 Delta 阿片受体的制备和评价

  摘要：

  使用经典有机化学和固相肽合成 (SPPS) 制备亮氨酸脑啡肽类似物，其中酰胺键被酯或N-甲基酰胺键顺序和系统地取代。使用竞争结合、ERK1/2 磷酸化、受体内化和收缩性测定来表征肽模拟物，以评估它们对 delta 阿片受体 (DOPr) 的药理学特征。还测量了活性类似物的亲脂性(LogD 7.4 )和血浆稳定性。我们的结果表明，最后一个酰胺键可以被酯或N成功取代与亮氨酸脑啡肽相比，-甲基酰胺键不会显着降低相应类似物的生物活性。发现在残基 Phe 和 Leu 之间具有N-甲基酰胺功能的肽模拟物比 Leu-脑啡肽更亲脂且更稳定。本研究的结果进一步表明，亮氨酸脑啡肽的第四个酰胺的氢键供体性质对其对 DOPr 的生物活性并不重要。我们的结果表明，用等排功能系统地替换酰胺键代表了一种设计和合成具有增强稳定性的新型肽类似物的有效方法。我们的研究结果进一步表明，这种策略也可用于研究酰胺键的生物学作用。

  DOI：

  10.1021/cn4000583

文献信息

• Design of Gallinamide A Analogs as Potent Inhibitors of the Cysteine Proteases Human Cathepsin L and <i>Trypanosoma cruzi</i> Cruzain
  作者：Paul D. Boudreau、Bailey W. Miller、Laura-Isobel McCall、Jehad Almaliti、Raphael Reher、Ken Hirata、Thu Le、Jair L. Siqueira-Neto、Vivian Hook、William H. Gerwick

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00294

  日期：2019.10.24

  reisolated and characterized as a potent, selective, and irreversible inhibitor of the human cysteine protease cathepsin L. Molecular docking identified potential modifications to improve binding, which were synthesized as a suite of analogs. Resultingly, this current study produced the most potent gallinamide analog yet tested against cathepsin L (10, Ki = 0.0937 ± 0.01 nM and kinact/Ki = 8 730 000). From a

  最初分离出具有适度抗疟疾活性的Gallinamide A，随后被重新分离，并表征为人半胱氨酸蛋白酶组织蛋白酶L的强效，选择性和不可逆抑制剂。分子对接鉴定出潜在的修饰以改善结合，将其合成为一组类似物。结果，该当前研究产生了针对组织蛋白酶L进行测试的最有效的没食子酰胺类似物（10，Ki = 0.0937±0.01 nM和kinact / Ki = 8 730 000）。从蛋白质结构和底物偏爱的角度来看，克鲁萨因是一种必需的锥虫克鲁兹半胱氨酸蛋白酶，具有高度同源性。我们的研究表明，没食子酰胺及其类似物在细胞内的鞭毛虫阶段中有效抑制克鲁萨因并对克鲁维氏酵母具有极强的毒性。活性最高的化合物5的IC50 = 5.1±1。
• Potent Anti-SARS-CoV-2 Activity by the Natural Product Gallinamide A and Analogues via Inhibition of Cathepsin L
  作者：Anneliese S. Ashhurst、Arthur H. Tang、Pavla Fajtová、Michael C. Yoon、Anupriya Aggarwal、Max J. Bedding、Alexander Stoye、Laura Beretta、Dustin Pwee、Aleksandra Drelich、Danielle Skinner、Linfeng Li、Thomas D. Meek、James H. McKerrow、Vivian Hook、Chien-Te Tseng、Mark Larance、Stuart Turville、William H. Gerwick、Anthony J. O’Donoghue、Richard J. Payne

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c01494

  日期：2022.2.24

  SARS-CoV-2. The marine natural product gallinamide A and several synthetic analogues were identified as potent inhibitors of cathepsin L with IC50 values in the picomolar range. Lead molecules possessed selectivity over other cathepsins and alternative host proteases involved in viral entry. Gallinamide A directly interacted with cathepsin L in cells and, together with two lead analogues, potently inhibited

  组织蛋白酶 L 是冠状病毒用于进入细胞的关键宿主半胱氨酸蛋白酶，也是新型抗 SARS-CoV-2 病毒药物的一个有前景的药物靶点。海洋天然产物 Gallinamide A 和几种合成类似物被鉴定为组织蛋白酶 L 的有效抑制剂，IC 50值在皮摩尔范围内。先导分子比参与病毒进入的其他组织蛋白酶和替代宿主蛋白酶具有选择性。 Gallinamide A 直接与细胞中的组织蛋白酶 L 相互作用，并与两种先导类似物一起在体外有效抑制 SARS-CoV-2 感染，EC 50值在纳摩尔范围内。在过表达跨膜蛋白酶丝氨酸 2 (TMPRSS2) 的细胞中观察到抗病毒活性降低；然而，当与 TMPRSS2 抑制剂联合使用时，可以实现抗病毒活性的协同改善。这些数据凸显了组织蛋白酶 L 作为 COVID-19 药物靶点的潜力，以及可能需要抑制多种病毒进入途径才能发挥功效。
• Learning from Peptides to Access Functional Precision Polymer Sequences
  作者：Eva Maron、Jordan H. Swisher、Joris J. Haven、Tara Y. Meyer、Tanja Junkers、Hans G. Börner

  DOI：10.1002/anie.201902217

  日期：2019.7.29

  Functional precision polymers based on monodisperse oligo(N‐substituted acrylamide)s and oligo(2‐substituted‐α‐hydroxy acid)s have been synthesized. The discrete sequences originate from a direct translation of side‐chain functionality sequences of a peptide with well‐studied properties. The peptide was previously selected to solubilize the photosensitizer meta‐tetra(hydroxyphenyl)chlorin. The resulting

  合成了基于单分散低聚（N-取代的丙烯酰胺）和低聚（2-取代-α-羟基酸）的功能精密聚合物。离散序列源自具有良好研究性质的肽的侧链功能序列的直接翻译。先前已选择该肽来增溶光敏剂间四（羟苯基）二氢卟酚。所得拟肽制剂添加剂保留了母体肽的药物增溶和释放特性。在某些情况下，可以获得卓越的性能，可将最高有效负载量提高40％，并将初始药物释放速度提高27倍。
• Syntheses of depsipeptide analogues of the insect neuropeptide proctolin
  作者：Jürgen Scherkenbeck、Andrew Plant、Frank Stieber、Peter Lösel、Hubert Dyker

  DOI：10.1016/s0960-894x(02)00214-7

  日期：2002.6

  Four depsipeptide analogues of the insect neuropeptide proctolin (H-Arg-Tyr-Leu-Pro-Thr-OH) have been prepared, containing a single ester linkage between Arg(1) and Tyr(2), Tyr(2) and Leu(3), and between Pro(4) and Thr(5), respectively. A didepsipentapeptide containing an ester linkage between Tyr(2) and Leu(3) and between Pro(4) and Thr(5), has also been prepared. The depsipeptide 4 is the first example

  已经制备了昆虫神经肽proctolin（H-Arg-Tyr-Leu-Pro-Thr-OH）的四种depsipeptide类似物，在Arg（1）和Tyr（2），Tyr（2）和Leu（ 3），以及分别在Pro（4）和Thr（5）之间。还准备了在Tyr（2）和Leu（3）之间以及Pro（4）和Thr（5）之间包含酯键的二肽五肽。十肽4是骨架修饰的proctolin类似物的第一个实例，其显示出完全的肌活性。
• A Versatile Chemoenzymatic Synthesis for the Discovery of Potent Cryptophycin Analogs
  作者：Jennifer J. Schmidt、Yogan Khatri、Scott I. Brody、Catherine Zhu、Halina Pietraszkiewicz、Frederick A. Valeriote、David H. Sherman

  DOI：10.1021/acschembio.9b00998

  日期：2020.2.21

  demonstrated the exceptional flexibility of this enzyme. Semipreparative scale reactions were conducted for isolation and structural characterization of new cryptophycins. Each was then evaluated as a substrate for CrpE P450 and its ability to generate the epoxidized products from these substrates that possess altered electronics at the unit A styrenyl double bond position. Finally, biological evaluation of

  隐藻霉素是大环二肽天然产物的家族，对抗药性癌症显示出异常有效的抗增殖活性。复杂分子的合成和衍生化所面临的独特挑战促使我们研究化学酶法合成方法，该方法旨在获得用于生物学评估的新类似物。隐藻霉素硫酯酶（CrpTE）和隐霉素环氧化酶（CrpE）是一组通用的酶，可催化20多种天然隐藻毒素代谢产物的大环化和环氧化。因此，我们设想了一种药物开发策略，其中涉及将它们用作生产非天然衍生物的独立生物催化剂。在这里 我们开发了12种新的ABCD线性链伸长中间体的可扩展合成方法，该中间体包含杂环芳族基团作为天然A苄基的替代品。使用野生型CrpTE评估了每种中间体的N-乙酰半胱胺活化形式向大环产物的转化，这证明了该酶的出色灵活性。进行了半制备规模的反应，用于新隐藻霉素的分离和结构表征。然后评估每种化合物作为CrpE P450的底物，以及它们从这些底物生成环氧化产物的能力，这些底物在单元A苯乙烯基双键位置具有改变的