Development of novel conformationally restricted selective Clk1/4 inhibitors through creating an intramolecular hydrogen bond involving an imide linker
作者:Dalia S. El-Gamil、Ahmed K. ElHady、Po-Jen Chen、Tsong-Long Hwang、Ashraf H. Abadi、Mohammad Abdel-Halim、Matthias Engel
DOI:10.1016/j.ejmech.2022.114411
日期:2022.8
novel series of N-aroylated 5-methoxybenzothiophene-2-carboxamides (imides) as potent and selective Clk1/4 inhibitors. Potency of this series was found to be mainly dependent on the presence of an intramolecular H-bond between an ortho-methoxy group and the imide NH, that stabilizes a nearly coplanar conformation of high affinity to the ATP binding pocket(s) of Clk1/4. The two most potent hits in this
作为前 mRNA 可变剪接的主要调节因子,发现不同的 Clk 同种型在各种肿瘤类型中过度表达,并且最近作为癌症治疗的潜在靶标受到了广泛关注。几项研究报告了有效的小分子 Clk1/4 抑制剂,具有良好的细胞抗癌活性;然而,它们的临床应用通常受到其对脱靶(主要是 Clk2 和 Dyrk1A)的选择性受损的阻碍。在这项研究中,我们提出了一系列新的N-芳酰化 5-甲氧基苯并噻吩-2-羧酰胺 (酰亚胺) 作为有效和选择性的 Clk1/4 抑制剂。发现该系列的效力主要取决于邻位之间存在分子内氢键-甲氧基和亚胺 NH,可稳定对 Clk1/4 的 ATP 结合口袋具有高亲和力的几乎共面的构象。该系列中最有效的两个产品,化合物20(4-氟-2-甲氧基)和31(5-氯-2-甲氧基)的无细胞 Clk1 IC 50分别为 4 和 9.7 nM,此外还具有前所未有的选择性与 Clk2 相比,对 Clk1 的亲和力分别高