(2E,4E,6Z,8E)-9-[(3R)-3-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl]-3,7-dimethylnona-2,4,6,8-tetraenoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: (2E,4E,6Z,8E)-9-[(3R)-3-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl]-3,7-dimethylnona-2,4,6,8-tetraenoic acid
• 化学式: C₂₀H₂₈O₃
• 分子量: 316.441
• InChiKey: KGUMXGDKXYTTEY-OCVCUBBTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  57.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  9-顺式维甲酸 在 CYP₂₆C₁ 、 reductase 作用下， 反应 0.25h， 生成 (2E,4E,6Z,8E)-9-[(3S)-3-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl]-3,7-dimethylnona-2,4,6,8-tetraenoic acid 、 (2E,4E,6Z,8E)-9-[(3R)-3-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl]-3,7-dimethylnona-2,4,6,8-tetraenoic acid 、 4-氧代维甲酸
  参考文献：
  名称：

  CYP26C1 Is a Hydroxylase of Multiple Active Retinoids and Interacts with Cellular Retinoic Acid Binding Proteins

  摘要：

  视黄酸（RA）及其代谢物的清除被认为是由CYP26酶调控的，但CYP26A1、CYP26B1和CYP26C1在清除活性维生素A代谢物中的具体作用尚未明确。本研究的目标是建立CYP26C1的底物特异性，并确定CYP26C1是否与细胞视黄酸结合蛋白（CRABPs）相互作用。研究发现，CYP26C1能够有效地代谢全反式视黄酸（at RA）、9-顺式视黄酸（9-cis-RA）、13-顺式视黄酸和4-氧-全反式视黄酸，其中对9-cis-RA的内源性清除率最高。与CYP26A1和CYP26B1相比，CYP26C1对视黄醇类化合物展现出不同的代谢物谱，提示CYP26C1的活性位点结构与其他CYP26酶存在差异。CYP26C1的同源建模表明，这与视黄醇在CYP26C1活性位点内的不同结合取向有关。与其他CYP26家族成员相比，CYP26C1在清除4-氧-全反式视黄酸方面的效率高达CYP26A1和CYP26B1的10倍（内源性清除率为153 μl/min/pmol），这表明CYP26C1在清除这一活性视黄醇方面可能具有重要意义。支持这一点的是，CRABPs将4-氧-全反式视黄酸和全反式视黄酸输送给CYP26C1进行代谢。尽管4-氧-全反式视黄酸和全反式视黄酸与CRABPs结合紧密，但在生物基质中这些底物与CYP26C1的表观米氏常数（K m）在底物与CRABPs结合时并未增加，这与自由药物假说的预测相反。这些发现共同表明，CYP26C1是一种4-氧-全反式视黄酸羟化酶，可能在调节人类组织中这一活性视黄醇的浓度方面具有重要作用。

  DOI：

  10.1124/mol.117.111039