3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-cyanomethyl-4-O-(2,6-dichlorophenyl)uridine | 223250-67-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-cyanomethyl-4-O-(2,6-dichlorophenyl)uridine
• 英文别名: 3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxan-13-diyl)-2'-O-cyanomethyl-4-O-(2,6-dichlorophenyl)uridine；2-[[(6aR,8R,9R,9aR)-8-[4-(2,6-dichlorophenoxy)-2-oxopyrimidin-1-yl]-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-9-yl]oxy]acetonitrile
• CAS: 223250-67-7
• 化学式: C₂₉H₄₁Cl₂N₃O₇Si₂
• 分子量: 670.737
• InChiKey: PSHZZYMXHXUZHP-NHMNHLDDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.1
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  112
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-cyanomethyl-4-O-(2,6-dichlorophenyl)uridine 在 吡啶 、 sodium azide 、 四丁基氟化铵 、 苯硫酚 、 三乙胺 、 tin(ll) chloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 8.58h， 生成 4-N-benzoyl-2'-O-cyanomethylcytidine
  参考文献：
  名称：

  2′- O-（氨基甲酰基甲基）寡核糖核苷酸

  摘要：

  使用受保护的2' - O-氰基甲基核糖核苷-3'- O-亚磷酰胺基结构单元，在自动化DNA合成仪上合成了包含2'- O-氰基甲基核糖核苷酸的完全修饰寡核苷酸。2'- Ô -cyanomethyloligoribonucleotides进行合成后变换成2'- ö期间用氨水标准的脱保护条件-carbamoylmethyloligoribonucleotides。使用最终低聚物的离子交换HPLC和MALDI质谱法证明了完全转化。2′- O-氨基甲酰基甲基核糖核苷酸显示，相对于相应的RNA同双链体，具有互补RNA的双链体的解链温度（Tm）大大提高。因此，这些类似物应被证明可用于多种反义应用。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(99)00126-x
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-4-O-(2,6-dichlorophenyl)uridine 、 溴乙腈 在 2-叔丁基亚氨基-2-二乙基氨基-1,3-二甲基全氢-1,3,2-二氮杂磷 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 以64.1%的产率得到3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-cyanomethyl-4-O-(2,6-dichlorophenyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  2′- O-（氨基甲酰基甲基）寡核糖核苷酸

  摘要：

  使用受保护的2' - O-氰基甲基核糖核苷-3'- O-亚磷酰胺基结构单元，在自动化DNA合成仪上合成了包含2'- O-氰基甲基核糖核苷酸的完全修饰寡核苷酸。2'- Ô -cyanomethyloligoribonucleotides进行合成后变换成2'- ö期间用氨水标准的脱保护条件-carbamoylmethyloligoribonucleotides。使用最终低聚物的离子交换HPLC和MALDI质谱法证明了完全转化。2′- O-氨基甲酰基甲基核糖核苷酸显示，相对于相应的RNA同双链体，具有互补RNA的双链体的解链温度（Tm）大大提高。因此，这些类似物应被证明可用于多种反义应用。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(99)00126-x

文献信息

• 2′-O-(carbamoylmethyl)oligoribonucleotides
  作者：Morten Grøtli、Barbro Beijer、Brian Sproat

  DOI：10.1016/s0040-4020(99)00126-x

  日期：1999.4

  Fully modified oligonucleotides containing 2′-O-cyanomethylribonucleotides were synthesised on automated DNA synthesisers using protected 2′-O-cyanomethylribonucleoside-3′-O-phosphoramidite building blocks. The 2′-O-cyanomethyloligoribonucleotides were post-synthetically converted into 2′-O-carbamoylmethyloligoribonucleotides during standard deprotection conditions with aqueous ammonia. The complete

  使用受保护的2' - O-氰基甲基核糖核苷-3'- O-亚磷酰胺基结构单元，在自动化DNA合成仪上合成了包含2'- O-氰基甲基核糖核苷酸的完全修饰寡核苷酸。2'- Ô -cyanomethyloligoribonucleotides进行合成后变换成2'- ö期间用氨水标准的脱保护条件-carbamoylmethyloligoribonucleotides。使用最终低聚物的离子交换HPLC和MALDI质谱法证明了完全转化。2′- O-氨基甲酰基甲基核糖核苷酸显示，相对于相应的RNA同双链体，具有互补RNA的双链体的解链温度（Tm）大大提高。因此，这些类似物应被证明可用于多种反义应用。