1-[2,3,5-tris-O-(triethylsilyl)-4-thio-β-D-ribofuranosyl]uracil

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: 1-[2,3,5-tris-O-(triethylsilyl)-4-thio-β-D-ribofuranosyl]uracil
• 英文别名: 2',3',5'-tris-O-(triethylsilyl)-4'-deoxy-4'-thiouridine；1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-bis(triethylsilyloxy)-5-(triethylsilyloxymethyl)thiolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₂₇H₅₄N₂O₅SSi₃
• 分子量: 603.059
• InChiKey: ADYJEJMPEGWBCZ-VNSJUHMKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.95
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.85
• 拓扑面积：
  102
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[2,3,5-tris-O-(triethylsilyl)-4-thio-β-D-ribofuranosyl]uracil 在 四丁基氟化铵 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 0.5h， 以78%的产率得到2',3'-bis-O-(triethylsilyl)-4'-deoxy-4'-thiouridine
  参考文献：
  名称：

  白霉素核苷抗生素硫庚糖核中非典型立体化学的生物合成起源

  摘要：

  白霉素是肽基硫代核苷天然产物，对临床上重要的病原体显示出抗菌活性。它们的结构以具有非典型立体化学的硫庚糖为特征，包括用 d-氨基酸部分修饰的 d-呋喃木糖环。在本文中证明，AbmH 是一种依赖于 5'-磷酸 (PLP) 的吡哆醛转醛缩酶，其催化苏式选择性醛醇型反应以生成具有 d-呋喃核糖环和 l-氨基酸部分的硫庚糖核心。L-氨基酸构型向d-氨基酸构型的转化由PLP依赖性差向异构酶AbmD催化。根据基因缺失实验，硫代呋喃糖环从 d-核糖到 d-木糖的转化似乎是由 AbmJ 介导的，AbmJ 被注释为自由基 S-腺苷-l-甲硫氨酸 (SAM) 酶。

  DOI：

  10.1021/jacs.8b12565
• 作为产物：
  描述：

  tert-Butyl-((3aS,4R,6aR)-2,2-dimethyl-5-oxo-tetrahydro-5λ⁴-thieno[3,4-d][1,3]dioxol-4-ylmethoxy)-dimethyl-silane 在 咪唑 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 11.0h， 生成 1-[2,3,5-tris-O-(triethylsilyl)-4-thio-β-D-ribofuranosyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  白霉素核苷抗生素硫庚糖核中非典型立体化学的生物合成起源

  摘要：

  白霉素是肽基硫代核苷天然产物，对临床上重要的病原体显示出抗菌活性。它们的结构以具有非典型立体化学的硫庚糖为特征，包括用 d-氨基酸部分修饰的 d-呋喃木糖环。在本文中证明，AbmH 是一种依赖于 5'-磷酸 (PLP) 的吡哆醛转醛缩酶，其催化苏式选择性醛醇型反应以生成具有 d-呋喃核糖环和 l-氨基酸部分的硫庚糖核心。L-氨基酸构型向d-氨基酸构型的转化由PLP依赖性差向异构酶AbmD催化。根据基因缺失实验，硫代呋喃糖环从 d-核糖到 d-木糖的转化似乎是由 AbmJ 介导的，AbmJ 被注释为自由基 S-腺苷-l-甲硫氨酸 (SAM) 酶。

  DOI：

  10.1021/jacs.8b12565

文献信息

• Stereoselective Synthesis of the β-Anomer of 4‘-Thionucleosides Based on Electrophilic Glycosidation to 4-Thiofuranoid Glycals
  作者：Kazuhiro Haraguchi、Haruhiko Takahashi、Noriaki Shiina、Chikafumi Horii、Yuichi Yoshimura、Ayako Nishikawa、Eiko Sasakura、Kazuo T. Nakamura、Hiromichi Tanaka

  DOI：10.1021/jo020037x

  日期：2002.8.1

  suitable for the preparation of 3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl) (9) and 3,5-O-(di-tert-butylsilylene) (11) 4-thioglycals. The glycosidation reactions of these 4-thioglycals were carried out, in the presence of either PhSeCl or NIS, by using silylated derivatives of uracil, thymine, cytosine, and N(6)-benzoyladenine. Among the three 4-thioglycals, 11 was found to be an excellent glycosyl donor, forming

  制备了具有不同3,5-O-甲硅烷基保护基的三种类型的4-硫呋喃基糖，并对其亲电性进行了研究。3,5-双-O-（叔丁基二甲基甲硅烷基）-4-硫呋喃类化合物糖基（5）是通过将2-脱氧-4-硫代-D-赤型戊呋喃糖（4）进行甲磺酸化并随后进行碱促进的消除反应而获得的，热消除亚砜衍生物适用于制备3,5-O-（四异丙基二硅氧烷-1,3-二基）（9）和3,5-O-（二叔丁基亚甲硅烷基）（11）4-硫代缩醛。通过使用尿嘧啶，胸腺嘧啶，胞嘧啶和N（6）-苯甲酰腺嘌呤的甲硅烷基化衍生物，在PhSeCl或NIS存在下，进行这些4-硫代糖基的糖基化反应。在这三种4-硫代糖中，有11种是出色的糖基供体，
• Biosynthetic Origin of the Atypical Stereochemistry in the Thioheptose Core of Albomycin Nucleoside Antibiotics
  作者：Richiro Ushimaru、Hung-wen Liu

  DOI：10.1021/jacs.8b12565

  日期：2019.2.13

  d-ribofuranose ring and an l-amino acid moiety. The conversion of l-to d-amino acid configuration is catalyzed by the PLP-dependent epimerase AbmD. The d- ribo to d- xylo conversion of the thiofuranose ring appears according to gene deletion experiments to be mediated by AbmJ, which is annotated as a radical S-adenosyl-l-methionine (SAM) enzyme. These studies establish several key steps in the assembly of the

  白霉素是肽基硫代核苷天然产物，对临床上重要的病原体显示出抗菌活性。它们的结构以具有非典型立体化学的硫庚糖为特征，包括用 d-氨基酸部分修饰的 d-呋喃木糖环。在本文中证明，AbmH 是一种依赖于 5'-磷酸 (PLP) 的吡哆醛转醛缩酶，其催化苏式选择性醛醇型反应以生成具有 d-呋喃核糖环和 l-氨基酸部分的硫庚糖核心。L-氨基酸构型向d-氨基酸构型的转化由PLP依赖性差向异构酶AbmD催化。根据基因缺失实验，硫代呋喃糖环从 d-核糖到 d-木糖的转化似乎是由 AbmJ 介导的，AbmJ 被注释为自由基 S-腺苷-l-甲硫氨酸 (SAM) 酶。