Modulating physicochemical properties of tetrahydropyridine-2-amine BACE1 inhibitors with electron-withdrawing groups: A systematic study
作者:Frederik J.R. Rombouts、Chien-Chi Hsiao、Solène Bache、Michel De Cleyn、Pauline Heckmann、Jos Leenaerts、Carolina Martinéz-Lamenca、Sven Van Brandt、Aldo Peschiulli、Ann Vos、Harrie J.M. Gijsen
DOI:10.1016/j.ejmech.2021.114028
日期:2022.1
functionalized warheads, we first developed a design flow including predicted physicochemical parameters which allowed us to select only the most promising candidates for synthesis. For this we evaluated a set of commercial packages to predict physicochemical properties, which can guide medicinal chemists in their endeavors to modulate pKa values of amidine and amine bases.
药物化学家面临的一个共同挑战是将强碱性基团的共轭酸的 pK a降低到保持所需效果(通常是效力和/或溶解度)的范围内,但避免不希望的效果,例如高分布体积 (V d)、有限的膜渗透和脱靶结合,尤其是 hERG 通道和单胺受体。我们使用含有脒的 3,4,5,6-四氢吡啶-2-胺支架面临这一挑战,脒是 BACE1 潜在抑制剂的关键结构成分,BACE1 是构成淀粉样蛋白斑块的 Aβ 种类产生中的限速酶在阿尔茨海默病中。在我们努力平衡效力与实现大脑穿透的理想特性的过程中,我们在脒的 β 位置引入了一组不同的基团,它们调节 logD、PSA 和 pK a. 鉴于制备这些高度功能化弹头的合成挑战,我们首先开发了一个设计流程,包括预测的物理化学参数,这使我们能够只选择最有希望的合成候选者。为此,我们评估了一组商业软件包来预测物理化学性质,这可以指导药物化学家努力调节脒和胺碱的 pK a值。