p-Nitrophenyl 6-amino-6-deoxy-α-D-mannopyranoside

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: p-Nitrophenyl 6-amino-6-deoxy-α-D-mannopyranoside
• 英文别名: (2R,3S,4S,5S,6R)-2-(aminomethyl)-6-(4-nitrophenoxy)oxane-3,4,5-triol
• 化学式: C₁₂H₁₆N₂O₇
• 分子量: 300.268
• InChiKey: BPAZZKCLQLIGQG-GCHJQGSQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.7
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  151
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  p-Nitrophenyl 6-amino-6-deoxy-α-D-mannopyranoside 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 methyl 2-((((2R,3S,4S,5S,6R)-6-(4-aminophenoxy)-3,4,5-trihydroxytetrahydro-2H-pyran-2-yl)methyl)amino)-2-oxoacetate
  参考文献：
  名称：

  [EN] M6PR CELL SURFACE RECEPTOR BINDING COMPOUNDS AND CONJUGATES
  [FR] COMPOSÉS ET CONJUGUÉS DE LIAISON AU RÉCEPTEUR DE SURFACE CELLULAIRE M6PR

  摘要：

  本公开提供了一类化合物，包括一个配体基团，该基团专门结合细胞表面的甘露醇-6-磷酸受体（M6PR）。M6PR结合化合物可以触发受体内部化到细胞中结合的化合物。本公开的配体基团可以与各种感兴趣的基团链接，而不会影响对M6PR的特异性结合和功能。还提供了化合物，它们是与生物分子（例如抗体）连接的配体基团的共轭物，这些共轭物可以利用细胞途径从细胞表面或细胞外环境中去除特定的靶蛋白质。例如，本文所述的共轭物可以在细胞溶酶体中固定和/或降解感兴趣的靶分子。还提供了使用共轭物来靶向蛋白质进行固定和/或溶酶体降解的方法。

  公开号：

  WO2023288015A1
• 作为产物：
  描述：

  p-nitrophenyl 6-azido-6-deoxy-α-D-mannopyranoside 在 水 、 三苯基膦 、 silica gel 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 12.5h， 以98%的产率得到p-Nitrophenyl 6-amino-6-deoxy-α-D-mannopyranoside
  参考文献：
  名称：

  Trivalent α-D-mannoside clusters as inhibitors of type-1 fimbriae-mediated adhesion of Escherichia coli: structural variation and biotinylation

  摘要：

  本文介绍了对三价簇甘露糖苷的结构改造，以进一步阐明大肠杆菌 1 型脂质凝集素的配体偏好。研究人员对两种类型的甘露糖苷进行了改变，一种是改变 2 型甘露糖苷簇的苷元部分，从而得到 27 型甘露糖苷簇；另一种是改变 1 型甘露糖苷簇的间隔长度，从而得到 20-22 型甘露糖苷簇。图中还显示了生物素与 1 型脂质凝集素亲和力最高的簇甘露糖苷的亲和力（33）。在酶联免疫吸附试验（ELISA）中，测试了合成的簇苷作为大肠杆菌与甘露聚糖特异性（1 型纤维凝集素介导的）结合的抑制剂的抑制效力，结果表明，簇 2a 中的结构预组织可以与簇 22 中更大的间隔灵活性很好地结合起来。

  DOI：

  10.1039/b009786l

文献信息

• Trivalent α-D-mannoside clusters as inhibitors of type-1 fimbriae-mediated adhesion of Escherichia coli: structural variation and biotinylation
  作者：Thisbe K. Lindhorst、Sven Kötter、Ulrike Krallmann-Wenzel、Stefan Ehlers

  DOI：10.1039/b009786l

  日期：——

  Structural modifications of trivalent cluster mannosides are presented to further elucidate the ligand preferences of the type-1 fimbrial lectin of Escherichia coli. Two types of variations are performed, either regarding the aglycone part of cluster mannosides of type 2, leading to 27, or altering the spacer lengths of mannosyl clusters of type 1, leading to clusters 20–22. Biotinylation of the cluster mannoside with the highest affinity to the type-1 fimbrial lectin is also shown (33). Testing of the inhibitory potencies of the synthesised cluster glycosides as inhibitors of mannose-specific (type-1 fimbriae-mediated) binding of E. coli to mannan in an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) suggests that a structural preorganisation as given in cluster 2a can be favourably combined with greater spacer flexibility as in cluster 22.

  本文介绍了对三价簇甘露糖苷的结构改造，以进一步阐明大肠杆菌 1 型脂质凝集素的配体偏好。研究人员对两种类型的甘露糖苷进行了改变，一种是改变 2 型甘露糖苷簇的苷元部分，从而得到 27 型甘露糖苷簇；另一种是改变 1 型甘露糖苷簇的间隔长度，从而得到 20-22 型甘露糖苷簇。图中还显示了生物素与 1 型脂质凝集素亲和力最高的簇甘露糖苷的亲和力（33）。在酶联免疫吸附试验（ELISA）中，测试了合成的簇苷作为大肠杆菌与甘露聚糖特异性（1 型纤维凝集素介导的）结合的抑制剂的抑制效力，结果表明，簇 2a 中的结构预组织可以与簇 22 中更大的间隔灵活性很好地结合起来。
• [EN] M6PR CELL SURFACE RECEPTOR BINDING COMPOUNDS AND CONJUGATES<br/>[FR] COMPOSÉS ET CONJUGUÉS DE LIAISON AU RÉCEPTEUR DE SURFACE CELLULAIRE M6PR
  申请人：LYCIA THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2023288015A1

  公开（公告）日：2023-01-19

  The present disclosure provides a class of compounds including a ligand moiety that specifically binds to a cell surface mannose-6-phosphate receptor (M6PR). The M6PR binding compounds can trigger the receptor to internalize into the cell a bound compound. The ligand moieties of this disclosure can be linked to a variety of moieties of interest without impacting the specific binding to, and function of, the M6PR. Also provided are compound that are conjugates of the ligand moieties linked to a biomolecule, such as an antibody, which conjugates can harness cellular pathways to remove specific target proteins from the cell surface or the extracellular milieu. For example, the conjugates described herein may sequester and/or degrade a target molecule of interest in a cell's lysosome. Also provided are methods of using the conjugates to target a protein for sequestration and/or lysosomal degradation.

  本公开提供了一类化合物，包括一个配体基团，该基团专门结合细胞表面的甘露醇-6-磷酸受体（M6PR）。M6PR结合化合物可以触发受体内部化到细胞中结合的化合物。本公开的配体基团可以与各种感兴趣的基团链接，而不会影响对M6PR的特异性结合和功能。还提供了化合物，它们是与生物分子（例如抗体）连接的配体基团的共轭物，这些共轭物可以利用细胞途径从细胞表面或细胞外环境中去除特定的靶蛋白质。例如，本文所述的共轭物可以在细胞溶酶体中固定和/或降解感兴趣的靶分子。还提供了使用共轭物来靶向蛋白质进行固定和/或溶酶体降解的方法。