我们先前报道了使用未纯化的蛋白质(ID
UP)进行相互作用测定的方法,该方法可从细胞裂解液中DNA连接的小分子和未纯化的蛋白质靶标的混合物中选择性扩增编码
配体:靶标对的DNA序列。在这项研究中,我们将ID
UP应用于DNA编码的
生物活性化合物和带有DNA标签的人类激酶的文库,以在单个溶液相文库×文库实验中鉴定出32 096种可能的组合中的
配体:蛋白质结合伴侣。结果概括了已知的小分子:蛋白质相互作用,还揭示了
乙炔酸是
MAP2K6激酶的新型
配体和
抑制剂。
乙二酸部分地通过非保守的半胱
氨酸残基的烷基化抑制
MAP2K6。这项工作验证了ID
UP发现具有
生物医学相关性蛋白质的
配体的能力。