IBIS00560282

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: IBIS00560282
• 英文别名: (2S,3S,4R,5R,6R)-5-amino-2-(aminomethyl)-6-[(2R,3R,4R,5S)-5-[(1R,2R,3S,5R,6S)-3,5-diamino-2-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-amino-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-hydroxycyclohexyl]oxy-2-(hydroxymethyl)-4-(2-phenylethoxy)oxolan-3-yl]oxyoxane-3,4-diol
• 化学式: C₃₁H₅₃N₅O₁₄
• 分子量: 719.787
• InChiKey: XUFVERPMQLESNP-GOSBMTRPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.2
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  336
• 氢给体数：
  12
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (2S,3S,4R,5R,6R)-5-amino-2-(aminomethyl)-6-[(2R,3R,4R,5S)-5-[(1R,2R,3S,5R,6S)-3,5-diamino-2-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-amino-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-hydroxycyclohexyl]oxy-2-(hydroxymethyl)-4-(2-hydroxy-2-phenylethoxy)oxolan-3-yl]oxyoxane-3,4-diol 在 palladium dihydroxide 氢气 、 溶剂黄146 作用下， 反应 18.0h， 生成 IBIS00560282
  参考文献：
  名称：

  功能新颖的氨基糖苷类抗生素的结构化设计，合成和A位rRNA共结晶复合物：巴龙霉素的C2“醚类似物。

  摘要：

  根据新的位点选择性功能化，制备了一系列2'-O-取代的巴龙霉素醚类似物。几种类似物的X射线共晶复合物揭示了在A位rRNA中的新结合方式，即环I和II采用了以前对巴龙霉素观察到的熟悉的方向和位置，但环III和IV的取向不同，除少数例外，所有这些新类似物对敏感的金黄色葡萄球菌均表现出与巴龙霉素相同或更好的抑制活性。获得了针对大肠杆菌的MIC值，其中一些醚附件含有极性或碱性端基；两种类似物在小鼠败血病保护试验中显示出优异的存活率；对肾脏的初步组织病理学分析未显示明显的毒性迹象，而使用新霉素和卡那霉素的对照组在较低剂量下有毒。

  DOI：

  10.1021/jm061200+

文献信息

• WO2006/52930
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• Structure-Based Design, Synthesis, and A-Site rRNA Cocrystal Complexes of Functionally Novel Aminoglycoside Antibiotics:  C2‘ ‘ Ether Analogues of Paromomycin
  作者：Stephen Hanessian、Janek Szychowski、Susanta Sekhar Adhikari、Guillermo Vasquez、Pachamuthu Kandasamy、Eric E. Swayze、Michael T. Migawa、Ray Ranken、Boris François、Julia Wirmer-Bartoschek、Jiro Kondo、Eric Westhof

  DOI：10.1021/jm061200+

  日期：2007.5.1

  A series of 2"-O-substituted ether analogues of paromomycin were prepared based on new site-selective functionalizations. X-ray cocrystal complexes of several such analogues revealed a new mode of binding in the A-site rRNA, whereby rings I and II adopted the familiar orientation and position previously observed with paromomycin, but rings III and IV were oriented differently. With few exceptions,

  根据新的位点选择性功能化，制备了一系列2'-O-取代的巴龙霉素醚类似物。几种类似物的X射线共晶复合物揭示了在A位rRNA中的新结合方式，即环I和II采用了以前对巴龙霉素观察到的熟悉的方向和位置，但环III和IV的取向不同，除少数例外，所有这些新类似物对敏感的金黄色葡萄球菌均表现出与巴龙霉素相同或更好的抑制活性。获得了针对大肠杆菌的MIC值，其中一些醚附件含有极性或碱性端基；两种类似物在小鼠败血病保护试验中显示出优异的存活率；对肾脏的初步组织病理学分析未显示明显的毒性迹象，而使用新霉素和卡那霉素的对照组在较低剂量下有毒。