二甲基吲哚红 | 1018705-53-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 中文名称: 二甲基吲哚红
• 英文名称: dimethylindole red
• 英文别名: DIR；3-[4-[3-(1,3,3-trimethylindol-2-ylidene)prop-1-enyl]quinolin-1-ium-1-yl]propane-1-sulfonate
• CAS: 1018705-53-7
• 化学式: C₂₆H₂₈N₂O₃S
• 分子量: 448.586
• InChiKey: NTABMUJQZABQGD-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  72.7
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3-(4-(2-(phenylamino)vinyl)quinolin-1-ium-1-yl)propane-1-sulfonate 、 1,2,3,3-四甲基-3H-吲哚鎓碘化物 在 吡啶 、 乙酸酐 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 反应 4.0h， 以23%的产率得到二甲基吲哚红
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of New Fluorogenic Cyanine Dyes and Incorporation into RNA Fluoromodules

  摘要：

  A new fluorogenic cyanine dye was synthesized and found to have low fluorescence quantum yield in fluid solution and in the presence of double-stranded DNA but 80-fold enhanced fluorescence in viscous glycerol solution. An RNA aptamer selected for binding to the new dye exhibits K-d = 87 nM and 60-fold fluorescence enhancement. The dye-aptamer pair is a fluoromodule that can be incorporated into fluorescent sensors and labels.

  DOI：

  10.1021/ol702920e