N-(2-(2-(2-aminoethoxy)ethoxy)ethyl)-2-((4S)-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-benzo[f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-4-yl)acetamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯二氮卓类
• 英文名称: N-(2-(2-(2-aminoethoxy)ethoxy)ethyl)-2-((4S)-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-benzo[f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-4-yl)acetamide
• 英文别名: (S)-N-(2-(2-(2-aminoethoxy)ethoxy)ethyl)-2-(6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-benzo[f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-4-yl)-acetamide；N-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethyl]-2-[(4S)-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepin-4-yl]acetamide
• 化学式: C₂₆H₃₁ClN₆O₄
• 分子量: 527.023
• InChiKey: TUIDDXSQRJWUAQ-QFIPXVFZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  原儿茶酸 、 N-(2-(2-(2-aminoethoxy)ethoxy)ethyl)-2-((4S)-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-benzo[f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-4-yl)acetamide 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 15.17h， 以16%的产率得到N-(2-(2-(2-(2-((4S)-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-benzo[f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-4-yl)acetamido)ethoxy)ethoxy)ethyl)-3,4-dihydroxybenzamide
  参考文献：
  名称：

  [EN] BROMODOMAIN LIGANDS CAPABLE OF DIMERIZING IN AN AQUEOUS SOLUTION
  [FR] LIGANDS DE BROMODOMAINE POUVANT SE DIMÉRISER DANS UNE SOLUTION AQUEUSE

  摘要：

  本文描述的是一种单体，当与水性介质中的一个、两个、三个或更多其他单体接触时，能够形成具有生物学用途的多聚体。在一个方面，这些单体可能能够在水性介质中（例如体内）与另一个单体结合，形成一个多聚体（例如二聚体）。考虑到的单体可能包括一个配体基团、一个连接元素和连接配体基团与连接元素的连接元素。在水性介质中，这些考虑到的单体可以通过每个连接元素相互结合，因此可以同时调节一个或多个生物分子，例如，调节蛋白质上的两个或更多结合结构域或不同蛋白质上的结合结构域。

  公开号：

  WO2015081280A1
• 作为产物：
  描述：

  (S)-2-(5-(4-氯苯基)-7-甲氧基-2-氧代-2,3-二氢-1H-苯并[E][1,4]二 在 tetraphosphorus decasulfide 、 sodium carbonate 、 一水合肼 、 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 三氟乙酸 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 121.0h， 生成 N-(2-(2-(2-aminoethoxy)ethoxy)ethyl)-2-((4S)-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-benzo[f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-4-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  评估连接子长度对BET溴结构域探针的影响†

  摘要：

  在表观遗传机制的治疗潜力的推动下，BET溴结构域作为药物靶标引起了人们的极大兴趣。在本文中，我们将不同的接头引入BET溴结构域苯并二氮杂配体（I-BET762），以评估其在杂交药物，成像探针和小分子药物偶联物开发中的意义。生物物理研究证实，包括成像探针在内的合成实体对BRD4空腔结合的破坏最小。在细胞内证实了靶标结合，但是尽管在膜破裂后有效地定位在细胞核中，但是发现膜的扩散较差。我们的研究突出了成功设计苯并二氮杂卓衍生的药物递送系统所面临的挑战和机遇。

  DOI：

  10.1039/c9cc05054j

文献信息

• BROMODOMAIN LIGANDS CAPABLE OF DIMERIZING IN AN AQUEOUS SOLUTION, AND METHODS OF USING SAME
  申请人：Coferon, Inc.

  公开号：US20140243286A1

  公开（公告）日：2014-08-28

  Described herein are monomers capable of forming a biologically useful multimer when in contact with one, two, three or more other monomers in an aqueous media. In one aspect, such monomers may be capable of binding to another monomer in an aqueous media (e.g. in vivo) to form a multimer (e.g. a dimer). Contemplated monomers may include a ligand moiety, a linker element, and a connector element that joins the ligand moiety and the linker element. In an aqueous media, such contemplated monomers may join together via each linker element and may thus be capable of modulating one or more biomolecules substantially simultaneously, e.g., modulate two or more binding domains on a protein or on different proteins.

  本文介绍了一种单体，当在水介质中与一个、两个、三个或更多其他单体接触时，能够形成生物上有用的多聚体。在其中一方面，这种单体可以在水介质中（例如在体内）与另一个单体结合形成多聚体（例如二聚体）。考虑到的单体可能包括配体基团、连接元素和连接配体基团和连接元素的连接元素。在水介质中，这些考虑到的单体可以通过每个连接元素连接在一起，因此可以同时调节一个或多个生物分子，例如调节蛋白质或不同蛋白质上的两个或更多结合结构域。
• BIVALENT BROMODOMAIN LIGANDS, AND METHODS OF USING SAME
  申请人：Coferon, Inc.

  公开号：US20140243322A1

  公开（公告）日：2014-08-28

  Described herein are compounds capable of modulating one or more biomolecules substantially simultaneously, e.g., modulating two or more binding domains (e.g., bromodomains) on a protein or on different proteins.

  本文描述了一些化合物，能够在实质上同时调节一个或多个生物分子，例如，在蛋白质上或不同蛋白质上调节两个或更多结合域（例如溴结构域）。
• [EN] USE OF CHEMICAL EPIGENETIC MODIFIERS TO MODULATE GENE EXPRESSION<br/>[FR] UTILISATION DE MODIFICATEURS ÉPIGÉNÉTIQUES CHIMIQUES POUR MODULER L'EXPRESSION GÉNIQUE
  申请人：[en]THE UNIVERSITY OF NORTH CAROLINA AT CHAPEL HILL

  公开号：WO2023172889A1

  公开（公告）日：2023-09-14

  The invention relates to relates to a chemical epigenetic modifier (CEM) comprising compound 1 (AP1867) or a pharmaceutically acceptable salt thereof, a linker, and a chromatin regulatory protein ligand and compositions thereof. The invention also relates to methods for modulating expression of a gene comprising contacting a polynucleotide with a target gene sequence to a fusion protein comprising a FK506-binding protein (FKBP) polypeptide with a F36V mutation and a gRNA binding polypeptide, a gRNA comprising a gene targeting polynucleotide sequence that binds to a target gene sequence and a polynucleotide sequence recognized by the gRNA binding polypeptide, a CEM, and a protein with a DNA binding domain that binds to the target gene sequence and the gRNA, thereby modulating expression of the gene.
• [EN] BROMODOMAIN LIGANDS CAPABLE OF DIMERIZING IN AN AQUEOUS SOLUTION<br/>[FR] LIGANDS DE BROMODOMAINE POUVANT SE DIMÉRISER DANS UNE SOLUTION AQUEUSE
  申请人：COFERON INC

  公开号：WO2015081280A1

  公开（公告）日：2015-06-04

  Described herein are monomers capable of forming a biologically useful multimer when in contact with one, two, three or more other monomers in an aqueous media. In one aspect, such monomers may be capable of binding to another monomer in an aqueous media (e.g. in vivo) to form a multimer (e.g. a dimer). Contemplated monomers may include a ligand moiety, a linker element, and a connector element that joins the ligand moiety and the linker element. In an aqueous media, such contemplated monomers may join together via each linker element and may thus be capable of modulating one or more biomolecules substantially simultaneously, e.g., modulate two or more binding domains on a protein or on different proteins.

  本文描述的是一种单体，当与水性介质中的一个、两个、三个或更多其他单体接触时，能够形成具有生物学用途的多聚体。在一个方面，这些单体可能能够在水性介质中（例如体内）与另一个单体结合，形成一个多聚体（例如二聚体）。考虑到的单体可能包括一个配体基团、一个连接元素和连接配体基团与连接元素的连接元素。在水性介质中，这些考虑到的单体可以通过每个连接元素相互结合，因此可以同时调节一个或多个生物分子，例如，调节蛋白质上的两个或更多结合结构域或不同蛋白质上的结合结构域。
• Evaluation of linker length effects on a BET bromodomain probe
  作者：Rui Traquete、Elizabeth Henderson、Sarah Picaud、Pedro M. S. D. Cal、Florian Sieglitz、Tiago Rodrigues、Rudi Oliveira、Panagis Filippakopoulos、Gonçalo J. L. Bernardes

  DOI：10.1039/c9cc05054j

  日期：——

  drug targets. Herein, we introduce different linkers to a BET bromodomain benzodiazepine ligand (I-BET762) to gauge its implications in the development of hybrid drugs, imaging probes and small molecule drug conjugates. Biophysical studies confirmed minimal disruption to binding of the BRD4 cavity by the synthesized entities, which includes imaging probes. Target engagement was confirmed in a cellular

  在表观遗传机制的治疗潜力的推动下，BET溴结构域作为药物靶标引起了人们的极大兴趣。在本文中，我们将不同的接头引入BET溴结构域苯并二氮杂配体（I-BET762），以评估其在杂交药物，成像探针和小分子药物偶联物开发中的意义。生物物理研究证实，包括成像探针在内的合成实体对BRD4空腔结合的破坏最小。在细胞内证实了靶标结合，但是尽管在膜破裂后有效地定位在细胞核中，但是发现膜的扩散较差。我们的研究突出了成功设计苯并二氮杂卓衍生的药物递送系统所面临的挑战和机遇。