cyclo(Nal-Gly-D-Tyr-Orn-Arg-)

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: cyclo(Nal-Gly-D-Tyr-Orn-Arg-)
• 英文别名: cyclo[D-Tyr-Orn-Arg-2-Nal-Gly]；cyclo[D-Tyr-Orn-R-2-Nal-G]；1-[3-[(2S,5S,11R,14S)-14-(3-aminopropyl)-11-[(4-hydroxyphenyl)methyl]-5-(2-naphthylmethyl)-3,6,9,12,15-pentaoxo-1,4,7,10,13-pentazacyclopentadec-2-yl]propyl]guanidine；2-[3-[(2S,5S,11R,14S)-14-(3-aminopropyl)-11-[(4-hydroxyphenyl)methyl]-5-(naphthalen-2-ylmethyl)-3,6,9,12,15-pentaoxo-1,4,7,10,13-pentazacyclopentadec-2-yl]propyl]guanidine
• 化学式: C₃₅H₄₅N₉O₆
• 分子量: 687.799
• InChiKey: ZLTWSKRUWSCNKB-XFTNXAEASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.6
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  256
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  cyclo(Nal-Gly-D-Tyr-Orn-Arg-) 、 戊二酸 在 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 N,N'-Bis[3-[(2S,5S,8S,14R)-5-(3-carbamimidamidopropyl)-14-[(4-hydroxyphenyl)methyl]-8-(naphthalen-2-ylmethyl)-3,6,9,12,15-pentaoxo-1,4,7,10,13-pentazacyclopentadec-2-yl]propyl]pentanediamide
  参考文献：
  名称：

  CANCER IMAGING AND TREATMENT

  摘要：

  一种化合物，或其药用可接受的盐或酯，包括结构：[(P1-S1j)p-L-(S2q-P2)r]t其中：P1和P2，可能相同或不同，是环状寡肽基团，P1和P2中至少一个具有环状基团内的B-Arg或B-(Me)Arg基序，其中B是一种碱性氨基酸，其衍生物，苯丙氨酸或其衍生物；S1和S2是间隔基团，可能相同或不同；L是一个连接基团，含有至少两个功能基团，用于连接环状寡肽基团或间隔基团；n和q独立地为0或1；p和r独立地为1或更多的整数；t是1或更多的整数，但当t、p或r大于1时，环状寡肽基团、间隔基团和/或j或q的值在多个(P1-S1j)基团或多个(S2q-P2)基团之间可能相同或不同。

  公开号：

  US20140039153A1
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-甘氨酸 、 Fmoc-O-叔丁基-D-酪氨酸 、 Fmoc-3-(2-萘基)-L-丙氨酸 、 Fmoc-Pbf-L-精氨酸 、 alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 生成 cyclo(Nal-Gly-D-Tyr-Orn-Arg-)
  参考文献：
  名称：

  通过环四肽支架的结构调整鉴定新型低分子量CXCR4拮抗剂。

  摘要：

  先前通过使用两个正交环状五肽文库发现了一种高效CXCR4拮抗剂化合物2，所述正交五环文库涉及基于14-mer肽拮抗剂1的药效基团的基于构象和基于序列的文库。合成了具有γ-氨基酸的二肽单元（Nal-Gly）以及由二硫键和烯烃桥环合的假肽，以发现不同于环状五肽的新型支架结构。与化合物2相比，这些化合物包含的肽键数量减少。此外，还制备了几种具有Arg（4）侧链化学修饰的类似物（2）。由此，鉴定了具有高至中等CXCR4拮抗活性的几种新的铅。

  DOI：

  10.1021/jm050009h

文献信息

• Cancer Imaging and Treatment
  申请人：Wester Hans Jürgen

  公开号：US20100240072A1

  公开（公告）日：2010-09-23

  A compound, or a pharmaceutically acceptable salt or ester thereof, comprises the structure: [(P1-S1 j ) p -L-(S2 q -P2) r ] t wherein: P1 and P2, which may be the same or different, are cyclic oligopeptide moieties, at least one of P1 and P2 having the motif B-Arg or B-(Me) Arg within the cyclic moiety, wherein B is a basic amino acid, a derivative thereof, or phenylalanine or a derivative thereof; S1 and S2 are spacer groups, which may be the same or different; L is a linker moiety containing at least two functional groups for attachment of the cyclic oligopeptides or spacer groups; n and q are independently 0 or 1; p and r are independently integers of 1 or more; and t is an integer of 1 or more, provided that, when t, p or r is greater than 1, the cyclic oligopeptide moiety, spacer group and/or the value of j or q may be the same or different between the multiple (P1-S1 j ) moieties or multiple (S2 q -P2) moieties.

  该化合物或其药学上可接受的盐或酯包括结构：[(P1-S1j)p-L-(S2q-P2)r]t，其中：P1和P2可以相同也可以不同，是环状寡肽基团，其中至少一个P1和P2在环状基团内具有B-Arg或B-(Me) Arg基序，其中B是一种碱性氨基酸，其衍生物，苯丙氨酸或其衍生物；S1和S2是间隔基团，可以相同也可以不同；L是一个连接基团，含有至少两个功能基团，用于连接环状寡肽或间隔基团；n和q独立地为0或1；p和r独立地为1或更多的整数；t是1或更多的整数，但当t，p或r大于1时，环状寡肽基团，间隔基团和/或j或q的值可能在多个（P1-S1j）基团或多个（S2q-P2）基团之间相同或不同。
• TRIAZACYCLONONANE-BASED PHOSPHINATE LIGAND AND ITS USE FOR MOLECULAR IMAGING
  申请人：Scintomics GmbH

  公开号：EP2663571B1

  公开（公告）日：2015-08-12
• [EN] CANCER IMAGING AND TREATMENT<br/>[FR] IMAGERIE ET TRAITEMENT D'UN CANCER
  申请人：UNIV MUENCHEN TECH

  公开号：WO2009027706A2

  公开（公告）日：2009-03-05

  A compound, or a pharmaceutically acceptable salt or ester thereof, comprises the structure: [(P1-S1j)p - L - (S2q-P2)r]t wherein: P1 and P2, which may be the same or different, are cyclic oligopeptide moieties, at least one of P1 and P2 having the motif B-Arg or B-(Me) Arg within the cyclic moiety, wherein B is a basic amino acid, a derivative thereof, or phenylalanine or a derivative thereof; S1 and S2 are spacer groups, which may be the same or different; L is a linker moiety containing at least two functional groups for attachment of the cyclic oligopeptides or spacer groups; n and q are independently 0 or 1; p and r are independently integers of 1 or more; and t is an integer of 1 or more, provided that, when t, p or r is greater than 1, the cyclic oligopeptide moiety, spacer group and/or the value of j or q may be the same or different between the multiple (P1-S1j) moieties or multiple (S2q-P2) moieties.
• CANCER IMAGING AND TREATMENT
  申请人：Technische Universitat Munchen

  公开号：US20140039153A1

  公开（公告）日：2014-02-06

  A compound, or a pharmaceutically acceptable salt or ester thereof, comprises the structure: [(P1-S1 j ) p -L-(S2 q -P2) r ] t wherein: P1 and P2, which may be the same or different, are cyclic oligopeptide moieties, at least one of P1 and P2 having the motif B-Arg or B-(Me)Arg within the cyclic moiety, wherein B is a basic amino acid, a derivative thereof, or phenylalanine or a derivative thereof; S1 and S2 are spacer groups, which may be the same or different; L is a linker moiety containing at least two functional groups for attachment of the cyclic oligopeptides or spacer groups; n and q are independently 0 or 1; p and r are independently integers of 1 or more; and t is an integer of 1 or more, provided that, when t, p or r is greater than 1, the cyclic oligopeptide moiety, spacer group and/or the value of j or q may be the same or different between the multiple (P1-S1 j ) moieties or multiple (S2 q -P2) moieties.

  一种化合物，或其药用可接受的盐或酯，包括结构：[(P1-S1j)p-L-(S2q-P2)r]t其中：P1和P2，可能相同或不同，是环状寡肽基团，P1和P2中至少一个具有环状基团内的B-Arg或B-(Me)Arg基序，其中B是一种碱性氨基酸，其衍生物，苯丙氨酸或其衍生物；S1和S2是间隔基团，可能相同或不同；L是一个连接基团，含有至少两个功能基团，用于连接环状寡肽基团或间隔基团；n和q独立地为0或1；p和r独立地为1或更多的整数；t是1或更多的整数，但当t、p或r大于1时，环状寡肽基团、间隔基团和/或j或q的值在多个(P1-S1j)基团或多个(S2q-P2)基团之间可能相同或不同。
• Identification of Novel Low Molecular Weight CXCR4 Antagonists by Structural Tuning of Cyclic Tetrapeptide Scaffolds
  作者：Hirokazu Tamamura、Takanobu Araki、Satoshi Ueda、Zixuan Wang、Shinya Oishi、Ai Esaka、John O. Trent、Hideki Nakashima、Naoki Yamamoto、Stephen C. Peiper、Akira Otaka、Nobutaka Fujii

  DOI：10.1021/jm050009h

  日期：2005.5.1

  found by using two orthogonal cyclic pentapeptide libraries involving conformation-based and sequence-based libraries based on the pharmacophore of a 14-mer peptidic antagonist, 1. Herein, cyclic tetrapeptides derived from replacements of the dipeptide unit (Nal-Gly) with a gamma-amino acid and pseudopeptides cyclized by disulfide and olefin bridges were synthesized to find novel scaffold structures different

  先前通过使用两个正交环状五肽文库发现了一种高效CXCR4拮抗剂化合物2，所述正交五环文库涉及基于14-mer肽拮抗剂1的药效基团的基于构象和基于序列的文库。合成了具有γ-氨基酸的二肽单元（Nal-Gly）以及由二硫键和烯烃桥环合的假肽，以发现不同于环状五肽的新型支架结构。与化合物2相比，这些化合物包含的肽键数量减少。此外，还制备了几种具有Arg（4）侧链化学修饰的类似物（2）。由此，鉴定了具有高至中等CXCR4拮抗活性的几种新的铅。