methyl (S)-5-(2-oxo-3-(3-oxo-3-(tritylamino)propyl)-5-phenyl-2,3-dihydro-1H-benzo[e][1,4]diazepin-1-yl)pentanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (S)-5-(2-oxo-3-(3-oxo-3-(tritylamino)propyl)-5-phenyl-2,3-dihydro-1H-benzo[e][1,4]diazepin-1-yl)pentanoate
• 英文别名: methyl 5-[(3S)-2-oxo-3-[3-oxo-3-(tritylamino)propyl]-5-phenyl-3H-1,4-benzodiazepin-1-yl]pentanoate
• 化学式: C₄₃H₄₁N₃O₄
• 分子量: 663.816
• InChiKey: CTAHFWMDGZQGAJ-QNGWXLTQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.4
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (S)-5-(2-oxo-3-(3-oxo-3-(tritylamino)propyl)-5-phenyl-2,3-dihydro-1H-benzo[e][1,4]diazepin-1-yl)pentanoate 在 N-甲基吗啉 、 三异丙基硅烷 、 氯甲酸乙酯 、 三氟乙酸 、 potassium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 16.25h， 生成 (S)-5-(3-(3-amino-3-oxopropyl)-2-oxo-5-phenyl-2,3-dihydro-1H-benzo[e][1,4]diazepin-1-yl)-N-hydroxypentanamide
  参考文献：
  名称：

  设计和合成苯二氮卓类似物作为同工型选择性人赖氨酸脱乙酰基酶抑制剂

  摘要：

  进行了全面的调查，以确定新的苯二氮卓（BZD）衍生物作为有效的和选择性的人赖氨酸脱乙酰基酶抑制剂（hKDACis）。总共设计，合成了108种BZD化合物，并从这104种化合物中分别针对人赖氨酸脱乙酰基酶（hKDAC）1、3和8（I类）和6（IIb类）进行了生物学评估。活性最高的化合物对hKDACs 1、3和6表现出中等纳摩尔效价，对hKDAC8的微摩尔活性，而一种有前途的化合物（6q）显示出在不同酶同工型中对hKDAC3的选择性。生成了hKDAC6同源性模型，该模型通过分子动力学模拟进行了改进，并进行了分子对接研究，以使主要的配体-残基相互作用合理化，并定义了结构-活性-关系。实验结果证实了在追求hKDAC同工型选择性抑制时，苯并二氮杂moiety部分作为封端基是有用的，这表明在设计新的hKDACis时可以继续使用。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2016.12.032
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-N-三苯甲基-L-谷氨酰胺 在 N-甲基吗啉 、 氯甲酸乙酯 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.25h， 生成 methyl (S)-5-(2-oxo-3-(3-oxo-3-(tritylamino)propyl)-5-phenyl-2,3-dihydro-1H-benzo[e][1,4]diazepin-1-yl)pentanoate
  参考文献：
  名称：

  设计和合成苯二氮卓类似物作为同工型选择性人赖氨酸脱乙酰基酶抑制剂

  摘要：

  进行了全面的调查，以确定新的苯二氮卓（BZD）衍生物作为有效的和选择性的人赖氨酸脱乙酰基酶抑制剂（hKDACis）。总共设计，合成了108种BZD化合物，并从这104种化合物中分别针对人赖氨酸脱乙酰基酶（hKDAC）1、3和8（I类）和6（IIb类）进行了生物学评估。活性最高的化合物对hKDACs 1、3和6表现出中等纳摩尔效价，对hKDAC8的微摩尔活性，而一种有前途的化合物（6q）显示出在不同酶同工型中对hKDAC3的选择性。生成了hKDAC6同源性模型，该模型通过分子动力学模拟进行了改进，并进行了分子对接研究，以使主要的配体-残基相互作用合理化，并定义了结构-活性-关系。实验结果证实了在追求hKDAC同工型选择性抑制时，苯并二氮杂moiety部分作为封端基是有用的，这表明在设计新的hKDACis时可以继续使用。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2016.12.032