SiR650-6CP

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: SiR650-6CP
• 英文别名: 4-[[4-[(2-Amino-6-chloropyrimidin-4-yl)oxymethyl]phenyl]methylcarbamoyl]-2-[7-(dimethylamino)-3-dimethylazaniumylidene-5,5-dimethylbenzo[b][1]benzosilin-10-yl]benzoate；4-[[4-[(2-amino-6-chloropyrimidin-4-yl)oxymethyl]phenyl]methylcarbamoyl]-2-[7-(dimethylamino)-3-dimethylazaniumylidene-5,5-dimethylbenzo[b][1]benzosilin-10-yl]benzoate
• 化学式: C₃₉H₃₉ClN₆O₄Si
• 分子量: 719.315
• InChiKey: DAEUWESHNKQOKA-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.13
• 重原子数：
  51
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  137
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-溴四苯醌 在 盐酸 、 氯化亚砜 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 水 、 叔丁基锂 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 7.5h， 生成 SiR650-6CP
  参考文献：
  名称：

  [EN] CELL PERMEABLE, FLUORESCENT DYE
  [FR] COLORANT FLUORESCENT CAPABLE DE PÉNÉTRER DANS LES CELLULES

  摘要：

  该发明涉及一种近红外荧光染料，可以穿透细胞并附着于活细胞中的特定蛋白质。该染料具有一般式(I)或其相应的螺内酯(II)，其中Y选择自Si、Ge和Sn组成的群；R0为-COO-或COOH；R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15和R16为取代基，包括独立于彼此的氢。该染料(i)在600纳米以上的波长吸收和发射光；(ii)具有高光稳定性；(iii)具有高消光系数和高量子产率；(iv)可以与不同分子衍生化；(v)具有膜通透性，并显示对生物分子和生物分子结构的最小背景结合。

  公开号：

  WO2013029650A1

文献信息

• [EN] CELL PERMEABLE, FLUORESCENT DYE<br/>[FR] COLORANT FLUORESCENT CAPABLE DE PÉNÉTRER DANS LES CELLULES
  申请人：ECOLE POLYTECH

  公开号：WO2013029650A1

  公开（公告）日：2013-03-07

  The invention pertains to a near-infrared fluorescent dye that is cell permeable and can be attached to selected proteins in living cells. The dye has the general formula (I) or its or its corresponding spirolactone (II) wherein Y is chosen from the group consisting of Si, Ge and Sn; R0 is -COO- or COOH; R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9, R10, R11, R12, R13, R14, R15 and R16 are substituents, including hydrogen, independently from each other. The dye (i) absorbs and emits light at wavelengths above 600 nm; (ii) possesses high photostability; (iii) has high extinction coefficients and high quantum yields; (iv) can be derivatized with different molecules; and (v) is membrane-permeable and shows mini¬ mal background binding to biomolecules and biomolecular structures.

  该发明涉及一种近红外荧光染料，可以穿透细胞并附着于活细胞中的特定蛋白质。该染料具有一般式(I)或其相应的螺内酯(II)，其中Y选择自Si、Ge和Sn组成的群；R0为-COO-或COOH；R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15和R16为取代基，包括独立于彼此的氢。该染料(i)在600纳米以上的波长吸收和发射光；(ii)具有高光稳定性；(iii)具有高消光系数和高量子产率；(iv)可以与不同分子衍生化；(v)具有膜通透性，并显示对生物分子和生物分子结构的最小背景结合。