6-[2-[3-(3,3-dimethyl-5-sulfo-1H-indol-2-ylidene)prop-1-enyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-1-yl]hexanoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 6-[2-[3-(3,3-dimethyl-5-sulfo-1H-indol-2-ylidene)prop-1-enyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-1-yl]hexanoic acid
• 化学式: C₂₉H₃₅N₂O₈S₂
• 分子量: 603.737
• InChiKey: SQNDUKQKAFIGES-UHFFFAOYSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  178
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  、 6-[2-[3-(3,3-dimethyl-5-sulfo-1H-indol-2-ylidene)prop-1-enyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-1-yl]hexanoic acid 在 O-(N-succinimidyl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 四氯苯醌 作用下， 以45%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  遗传性靶向比率和活化的pH指示剂配合物（TRApHIC），用于受体运输。

  摘要：

  基于荧光蛋白的pH传感器是用于通过与胞吞作用和胞吐作用相关的pH改变来测量蛋白质运输的有用工具。但是，常用的pH敏感探针会随其感兴趣的蛋白质在整个细胞中普遍表达，这阻碍了我们专注于特定的蛋白质运输库的能力。我们开发了一系列激发比率式，可激活的pH响应串联染料，该染料由与荧光孔雀石绿受体相连的pH敏感Cy3供体组成。这些细胞排除的染料在与遗传表达的氟激活蛋白结合后被靶向并被激活，适用于使用共聚焦和超分辨率显微镜对表面蛋白进行选择性标记，以分析内吞作用并在活细胞中回收。

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.7b01135
• 作为产物：
  描述：

  1-(5-羧基己基)-2,3,3-三甲基-3H-吲哚-5-磺酸内盐 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 2,3,3-三甲基-3H-吲哚-5-磺酸 在 硫酸 、 溶剂黄146 、 吡啶 、 乙酸酐 作用下， 以 二乙二醇二甲醚 为溶剂， 以38%的产率得到6-[2-[3-(3,3-dimethyl-5-sulfo-1H-indol-2-ylidene)prop-1-enyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-1-yl]hexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  遗传性靶向比率和活化的pH指示剂配合物（TRApHIC），用于受体运输。

  摘要：

  基于荧光蛋白的pH传感器是用于通过与胞吞作用和胞吐作用相关的pH改变来测量蛋白质运输的有用工具。但是，常用的pH敏感探针会随其感兴趣的蛋白质在整个细胞中普遍表达，这阻碍了我们专注于特定的蛋白质运输库的能力。我们开发了一系列激发比率式，可激活的pH响应串联染料，该染料由与荧光孔雀石绿受体相连的pH敏感Cy3供体组成。这些细胞排除的染料在与遗传表达的氟激活蛋白结合后被靶向并被激活，适用于使用共聚焦和超分辨率显微镜对表面蛋白进行选择性标记，以分析内吞作用并在活细胞中回收。

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.7b01135