5-chloro-3-hydroxy-3-(2-(3-methoxyphenyl)-2-oxoethyl)indolin-2-one

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 5-chloro-3-hydroxy-3-(2-(3-methoxyphenyl)-2-oxoethyl)indolin-2-one
• 英文别名: AK-778/41314725；5-chloro-3-hydroxy-3-[2-(3-methoxyphenyl)-2-oxoethyl]-1H-indol-2-one
• 化学式: C₁₇H₁₄ClNO₄
• 分子量: 331.755
• InChiKey: SRQCVZDPIDPYHZ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  75.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-chloro-3-hydroxy-3-(2-(3-methoxyphenyl)-2-oxoethyl)indolin-2-one 在 盐酸 、 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 为溶剂， 20.0~90.0 ℃ 、400.01 kPa 条件下， 反应 1.0h， 生成 5-chloro-3-(2-(3-methoxyphenyl)-2-oxoethyl)indolin-2-one
  参考文献：
  名称：

  苯并[d]恶唑-2（3H）-one衍生物作为色域蛋白CDYL的第一个有效和选择性小分子抑制剂的鉴定和表征。

  摘要：

  组蛋白翻译后修饰（PTM）的表观遗传“阅读器”的化学探针已成为在生理学和病理学上对其靶蛋白进行机理和功能研究的强大工具。然而，仅开发了有限的“阅读器”探针，这限制了我们对这些大分子及其在细胞或动物中的作用的理解。在这里，我们报道了一种结构导向的方法来开发和表征苯并[d]恶唑-2（3H）-类似物，作为第一个有效的和选择性的小分子抑制剂，称为色域Y样（CDYL），一种组蛋白甲基赖氨酸阅读器蛋白。通过分子对接和动态模拟研究了CDYL的色域与修饰的拟肽之间的结合构象，便于随后从Specs化学文库中通过SPR技术验证的数十个命中点进行虚拟筛选（KD值：从271.1μM到5.4μM）。43种化合物的进一步设计和合成有助于解释结构-活性关系（SAR），这导致发现了新型CDYL小分子抑制剂。发现了化合物D03（KD：0.5μM），并且在其他色域蛋白中表现出优异的选择性，包​​括CDYL2（> 140倍），CDY1（未观察到结合）和CBX7（>

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.111656
• 作为产物：
  描述：

  5-氯靛红 、 3-甲氧基苯乙酮 在 二乙胺 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 0.33h， 以93%的产率得到5-chloro-3-hydroxy-3-(2-(3-methoxyphenyl)-2-oxoethyl)indolin-2-one
  参考文献：
  名称：

  3-羟基吲哚-2-酮类似物作为潜在抗HIV-1药物的命中优化研究

  摘要：

  在本研究中，设计，合成了22种基于3-羟基-3-（2-氧代-2-苯基乙基）吲哚-2-酮核的化合物，并在体外评估了其对HIV-1 RT的抑制作用和抗HIV的作用。 -1活动。化合物3d，5c和5e在低微摩尔至纳摩尔浓度下显示出令人鼓舞的针对RT酶和HIV-1的效力，并具有良好至极佳的安全指数。结构活性关系研究表明，在羟吲哚环第5位的卤素（如溴或氯）显着提高了对RT的效力。此外，在苯环邻位的甲氧基或氯基团也显着有利于RT抑制活性。七种化合物（3b，3c，3d，3e，5b，5c和5e）对突变的HIV-1 K103N菌株测试了具有更好抗HIV-1效力的药物。通过对接研究对推定的结合模式以及最佳活性化合物5c与野生HIV-1 RT的相互作用模式进行了研究。

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2018.04.027

文献信息

• Identification and characterization of benzo[d]oxazol-2(3H)-one derivatives as the first potent and selective small-molecule inhibitors of chromodomain protein CDYL
  作者：Lixin Yang、Yongqing Liu、Minghua Fan、Guiwang Zhu、Hongwei Jin、Jing Liang、Zhenming Liu、Zhuo Huang、Liangren Zhang

  DOI：10.1016/j.ejmech.2019.111656

  日期：2019.11

  [d]oxazol-2(3H)-one analogs as the first potent and selective small-molecule inhibitors of chromodomain Y-like (CDYL), a histone methyllysine reader protein. The binding conformation between the chromodomain of CDYL and the modified peptidomimetics was studied via molecular docking and dynamic simulations, facilitating subsequent virtual screening of tens of hits from Specs chemical library validated by SPR technique

  组蛋白翻译后修饰（PTM）的表观遗传“阅读器”的化学探针已成为在生理学和病理学上对其靶蛋白进行机理和功能研究的强大工具。然而，仅开发了有限的“阅读器”探针，这限制了我们对这些大分子及其在细胞或动物中的作用的理解。在这里，我们报道了一种结构导向的方法来开发和表征苯并[d]恶唑-2（3H）-类似物，作为第一个有效的和选择性的小分子抑制剂，称为色域Y样（CDYL），一种组蛋白甲基赖氨酸阅读器蛋白。通过分子对接和动态模拟研究了CDYL的色域与修饰的拟肽之间的结合构象，便于随后从Specs化学文库中通过SPR技术验证的数十个命中点进行虚拟筛选（KD值：从271.1μM到5.4μM）。43种化合物的进一步设计和合成有助于解释结构-活性关系（SAR），这导致发现了新型CDYL小分子抑制剂。发现了化合物D03（KD：0.5μM），并且在其他色域蛋白中表现出优异的选择性，包​​括CDYL2（> 140倍），CDY1（未观察到结合）和CBX7（>
• Hit optimization studies of 3-hydroxy-indolin-2-one analogs as potential anti-HIV-1 agents
  作者：Subhash Chander、Cheng-Run Tang、Ashok Penta、Ping Wang、Deepak P. Bhagwat、Nicolas Vanthuyne、Muriel Albalat、Payal Patel、Sanskruti Sankpal、Yong-Tang Zheng、Murugesan Sankaranarayanan

  DOI：10.1016/j.bioorg.2018.04.027

  日期：2018.9

  In the current study, twenty-two compounds based upon 3-hydroxy-3-(2-oxo-2-phenylethyl)indolin-2-one nucleus were designed, synthesized and in vitro evaluated for HIV-1 RT inhibition and anti-HIV-1 activity. Compounds 3d, 5c and 5e demonstrated encouraging potency against RT enzyme as well as HIV-1 in low micromolar to nanomolar concentration with good to excellent safety index. Structure activity

  在本研究中，设计，合成了22种基于3-羟基-3-（2-氧代-2-苯基乙基）吲哚-2-酮核的化合物，并在体外评估了其对HIV-1 RT的抑制作用和抗HIV的作用。 -1活动。化合物3d，5c和5e在低微摩尔至纳摩尔浓度下显示出令人鼓舞的针对RT酶和HIV-1的效力，并具有良好至极佳的安全指数。结构活性关系研究表明，在羟吲哚环第5位的卤素（如溴或氯）显着提高了对RT的效力。此外，在苯环邻位的甲氧基或氯基团也显着有利于RT抑制活性。七种化合物（3b，3c，3d，3e，5b，5c和5e）对突变的HIV-1 K103N菌株测试了具有更好抗HIV-1效力的药物。通过对接研究对推定的结合模式以及最佳活性化合物5c与野生HIV-1 RT的相互作用模式进行了研究。