methyl (S)-2-((S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (S)-2-((S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propanoate
• 英文别名: methyl N-(tert-butoxycarbonyl)-L-leucyl-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-L-alaninate；Boc-Leu-Ala((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)-OMe；methyl (2S)-2-[[(2S)-4-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoyl]amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propanoate
• 化学式: C₁₉H₃₃N₃O₆
• 分子量: 399.488
• InChiKey: GDODHLHDUMTIOB-IHRRRGAJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  123
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

上下游信息

• 上游原料

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  (alphaS,3S)-alpha-[(叔-丁基氧羰基)氨基]-2-氧代-3-吡咯烷丙酸甲酯	methyl (S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propanoate	328086-60-8	C13H22N2O5	286.328
  (S)-2-氨基-3-((S)-2-氧代吡咯烷-3-基)丙酸甲酯	methyl (2S)-2-amino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propanoate	1027601-37-1	C8H14N2O3	186.211
  (4R)-N-(叔-丁基氧羰基)-4-(氰基甲基)-L-谷氨酸1,5-二甲酯	dimethyl (2S,4R)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-4-(cyanomethyl)pentanedioate	328086-57-3	C14H22N2O6	314.338

• 下游产品

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  ——	methyl (2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methyl-pentanoyl]amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propanoate	——	C14H25N3O4	299.37
  ——	2-[2-(2-benzyloxycarbonylamino-3-phenylpropionylamino)-4-methyl-pentanoylamino]-3-(2-oxo-pyrrolidin-3-yl)propionic acid methyl ester	——	C31H40N4O7	580.681

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (S)-2-((S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propanoate 在 4-二甲氨基吡啶 、 锂硼氢 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三氟乙酸 、 2-碘酰基苯甲酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 32.0h， 生成 N-[(1S)-1-[[(1S)-1-formyl-2-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl]carbamoyl]-3-methyl-butyl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Inhibitors of cysteine proteases and methods of use thereof

  摘要：

  该披露提供了具有战斗头的化合物及其在治疗医学疾病或紊乱，如病毒感染方面的用途。提供了制药组合物和制备各种带有战斗头的化合物的方法。这些化合物被认为能够抑制蛋白酶，如3C、CL-或3CL样蛋白酶。提供的示例化合物包括Formula II-I，其中R3、RB如下所示：

  公开号：

  US11124497B1
• 作为产物：
  描述：

  (alphaS,3S)-alpha-[(叔-丁基氧羰基)氨基]-2-氧代-3-吡咯烷丙酸甲酯 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 15.0h， 生成 methyl (S)-2-((S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propanoate
  参考文献：
  名称：

  基于结构的 SARS-CoV-2 3C 类蛋白酶拟肽抑制剂设计作为有效的抗病毒候选药物

  摘要：

  严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 作为 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 的病原体，已感染数百万人并夺去数十万人的生命。不幸的是，缺乏预防或治疗 COVID-19 的有效药物。SARS-CoV-2 的3C 样蛋白酶 (3CL Pro ) 对病毒复制和转录至关重要，是开发抗 SARS-CoV-2 药物的有吸引力的靶标。针对3CL Pro，我们筛选了我们的蛋白酶抑制剂库，得到了化合物10a作为弱抑制SARS-CoV-2 3CL Pro的靶标，并确定了10a的共晶结构和蛋白酶。基于对 hit 与 SARS-CoV-2 3CL Pro之间的蛋白配体复合物的深入理解，我们设计了一系列拟肽抑制剂，对 SARS-CoV-2 3CL Pro 具有突出的抑制活性，对 SARS-CoV-2 3CL Pro具有出色的抗病毒效力SARS-CoV-2。X 射线共晶研究明确描述了其他关键抑制剂与

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2022.114458

文献信息

• [EN] PEPTIDOMIMETICS FOR THE TREATMENT OF CORONAVIRUS AND PICORNAVIRUS INFECTIONS<br/>[FR] PEPTIDOMIMÉTIQUES POUR LE TRAITEMENT D'INFECTIONS PAR CORONAVIRUS ET PICORNAVIRUS
  申请人：UNIV EMORY

  公开号：WO2020247665A1

  公开（公告）日：2020-12-10

  Compounds, compositions and methods for preventing, treating or curing a coronavirus, picornavirus, and/or Hepeviridae virus infection in human subjects or other animal hosts. Specific viruses that can be treated include enteroviruses. In one embodiment, the compounds can be used to treat an infection with a severe acute respiratory syndrome virus, such as human coronavirus 229E, SARS, MERS, SARS-CoV-1 (OC43), and SARS-CoV- 2. In another embodiment, the methods are used to treat a patient co-infected with two or more of these viruses, or a combination of one or more of these viruses and norovirus.

  用于预防、治疗或治愈人类主体或其他动物宿主中的冠状病毒、小RNA病毒和/或肝炎病毒感染的化合物、组合物和方法。可治疗的特定病毒包括肠病毒。在一个实施例中，这些化合物可用于治疗严重急性呼吸综合征病毒感染，如人类冠状病毒229E、SARS、MERS、SARS-CoV-1（OC43）和SARS-CoV-2。在另一个实施例中，这些方法用于治疗患有两种或更多这些病毒的患者，或一种或多种这些病毒与诺如病毒的组合。
• [EN] PEPTIDOMIMETICS FOR THE TREATMENT OF NOROVIRUS INFECTION<br/>[FR] PEPTIDOMIMÉTIQUES POUR LE TRAITEMENT D'UNE INFECTION À NOROVIRUS
  申请人：UNIV EMORY

  公开号：WO2017197377A1

  公开（公告）日：2017-11-16

  The present invention is directed to compounds, compositions and methods for preventing, treating or curing Norovirus infection in human subjects or other animal hosts.

  本发明涉及用于预防、治疗或治愈人类主体或其他动物宿主中的诺如病毒感染的化合物、组合物和方法。
• Improved SARS-CoV-2 Mpro inhibitors based on feline antiviral drug GC376: Structural enhancements, increased solubility, and micellar studies
  作者：Wayne Vuong、Conrad Fischer、Muhammad Bashir Khan、Marco J. van Belkum、Tess Lamer、Kurtis D. Willoughby、Jimmy Lu、Elena Arutyunova、Michael A. Joyce、Holly A. Saffran、Justin A. Shields、Howard S. Young、James A. Nieman、D. Lorne Tyrrell、M. Joanne Lemieux、John C. Vederas

  DOI：10.1016/j.ejmech.2021.113584

  日期：2021.10

  accommodates the P3 position. Alternative binding is induced by polar P3 groups or a nearby methyl. NMR and solubility studies with GC376 show that it exists as a mixture of stereoisomers and forms colloids in aqueous media at higher concentrations, a property not previously reported. Replacement of its Na+ counter ion with choline greatly increases solubility. The physical, biochemical, crystallographic

  SARS-CoV-2（引起 COVID-19 的冠状病毒）的复制需要主要蛋白酶 (M pro ) 来裂解病毒蛋白。因此，M pro是抗病毒药物的靶标。我们和其他人之前证明，GC376 是一种亚硫酸氢盐前药，在动物中具有抗冠状病毒作用，是 SARS-CoV-2 中 M pro的有效抑制剂。在这里，我们报告了改进的 GC376 衍生物的结构活性研究，其具有纳摩尔亲和力和治疗指数 >200。抑制剂-M pro复合物的晶体结构表明，M pro中的另一个结合袋（S4）可容纳 P3 位置。替代结合是由极性 P3 基团或附近的甲基诱导的。 GC376 的 NMR 和溶解度研究表明，它以立体异构体的混合物形式存在，并在较高浓度的水介质中形成胶体，这一特性以前未曾报道过。用胆碱代替其Na +抗衡离子大大增加了溶解度。物理、生化、晶体学和细胞数据揭示了 M pro抑制剂设计的新途径。
• 拟肽醛类化合物在制备治疗猪瘟病毒(ASFV)感染疾病药物的应用
  申请人：南开大学

  公开号：CN110354248A

  公开（公告）日：2019-10-22

  本发明涉及拟肽醛类化合物I，化合物II在制备治疗猪瘟病毒(ASFV)感染疾病药物的应用，还涉及其各种光学异构体，药学上可接受的溶剂合物以及前药在制备治疗猪瘟病毒(ASFV)感染疾病药物的应用。本发明还涉及含有式I，式II结构拟肽醛类化合物的药物组合物在制备治疗猪瘟病毒(ASFV)感染疾病药物的应用。III
• [EN] NITRILE-CONTAINING ANTIVIRAL COMPOUNDS<br/>[FR] COMPOSÉS ANTIVIRAUX CONTENANT DU NITRILE
  申请人：PFIZER

  公开号：WO2021250648A1

  公开（公告）日：2021-12-16

  The invention relates to compounds of Formula (I'') wherein R, R1, R2, R3, p, q and q' are as defined herein, pharmaceutical compositions comprising the compounds, methods of treating coronavirus infection such as COVID-19 in a patient by administering therapeutically effective amounts of the compounds, and methods of inhibiting or preventing replication of coronaviruses such as SARS- CoV-2 with the compounds.

  该发明涉及公式(I'')中的化合物，其中R、R1、R2、R3、p、q和q'的定义如本文所述，包括该化合物的药物组合物，通过向患者施用治疗有效量的化合物来治疗冠状病毒感染，如COVID-19的方法，以及使用该化合物抑制或预防冠状病毒如SARS-CoV-2的复制的方法。