已经完成了HIV-1
蛋白酶高效
抑制剂的合理设计和合成。
抑制剂SB 206343基于源自MVT-101 / HIV-1
蛋白酶复合物结构的模型,并包含一个4(5)-酰基
咪唑环,可等位取代P1'-P2'酰胺键。 。它是一种竞争性
抑制剂,在pH 6.0下的表观抑制常数为0.6 nM。已通过X射线衍射技术以2.3 A的分辨率确定了结合在HIV-1
蛋白酶活性位点上的SB 206343的三维结构,并细化为晶体学差异因子R(=σ平行fo // Fc平行/ sigma值),为0.194。
抑制剂通过一系列疏
水和极性相互作用保持在酶中。
咪唑环的N-3参与与结合的
水分子的新型氢键相互作用,证明了
咪唑环作为等规替代羟基
乙烯基HIV-1
蛋白酶中P1'-P2'酰胺键的有效性
抑制剂。在
咪唑环的N-1与Gly-127的羰基之间以及
咪唑的酰基羰基氧与Asp-129的酰胺氮之间还存在氢键相互作用,这说明了4(5)的拟肽性质-酰