现已公认,尽管仅约5%的人类
基因组编码蛋白质,但大多数DNA仍具有某些功能,例如合成特定的功能性RNA和/或控制
基因表达。这些功能性序列为使用可渗透细胞的小分子(可结合DNA的混合碱基对序列调节
基因组功能)打开了巨大的可能性,在
生物技术和治疗学领域均如此。不幸的是,已经设计出很少类型的模块来识别混合的DNA序列,并且为了靶向特定
基因的进步,必须拥有更多种类的化合物。可以从已建立的模块中合理设计并且可以与混合碱基对DNA序列强烈结合的化合物特别有吸引力。基于在用于AT识别的小沟剂设计方面的丰富经验,制备了一个小化合物库,该化合物具有两个AT特异性结合模块,这些模块通过可识别G·C碱基对的接头连接。使用强大的
生物物理方法对化合物-DNA的相互作用进行了评估,结果表明,一些
吡啶基连接的化合物与靶序列结合,具有亚纳摩尔级K D,在没有G·C碱基对的情况下,解离动力学非常慢,选择性是相关序列的200