5-{5-[1-(pyrrolidin-1-yl)cyclohexyl]-1,3-thiazol-2-yl}-1H-indole | 1624848-41-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 5-{5-[1-(pyrrolidin-1-yl)cyclohexyl]-1,3-thiazol-2-yl}-1H-indole
• 英文别名: 5-{5-[1-(Pyrrolidin-1-Yl)cyclohexyl]-1,3-Thiazol-2-Yl}-1h-Indole；2-(1H-indol-5-yl)-5-(1-pyrrolidin-1-ylcyclohexyl)-1,3-thiazole
• CAS: 1624848-41-4
• 化学式: C₂₁H₂₅N₃S
• 分子量: 351.516
• InChiKey: MXBHIYKTGVOQMD-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  60.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-{5-[1-(pyrrolidin-1-yl)cyclohexyl]-1,3-thiazol-2-yl}-1H-indole 在 sodium hydride 、 caesium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 37.0h， 生成 1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-5-{5-[1-(pyrrolidin-1-yl)cyclohexyl]-1,3-thiazol-2-yl}-1H-indole
  参考文献：
  名称：

  环己基吡咯烷配体用于锥虫还原酶的生物学评估和X射线共晶体结构，锥虫还原酶是一种锥虫的氧化还原酶。

  摘要：

  人类非洲锥虫病，南美锥虫病和各种形式的利什曼病是热带疾病，是由锥虫病家族的寄生虫引起的。这些原生动物具有独特的氧化还原代谢，该代谢基于锥虫硫烷和锥虫硫醇还原酶（TR），使TR成为有前途的药物靶标。我们通过基于结构的设计报告了TR的环己基吡咯烷抑制剂的性能和效能的优化。最好的抑制剂是可自由溶解的，并显示出对锥虫（T.）brucei TR和T. cruzi TR的竞争抑制常数（K i）和体外活性（半数最大抑制浓度，IC 50）在低微摩尔范围内对这些寄生虫具有抗人谷胱甘肽还原酶的高选择性。X射线共晶结构证实了配体与“ mepacrine结合位点”的疏水壁的结合，并且具有面向大活性位点表面的新的可提供溶解度的载体。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201800067
• 作为产物：
  描述：

  1-吡咯烷-1-环己烯 在 T406石油添加剂 、 (1,1'-bis(diphenylphosphino)ferrocene)palladium(II) dichloride 、 caesium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 30.75h， 生成 5-{5-[1-(pyrrolidin-1-yl)cyclohexyl]-1,3-thiazol-2-yl}-1H-indole
  参考文献：
  名称：

  与大型酶口袋的结合：锥虫还原酶的小分子抑制剂

  摘要：

  人类非洲锥虫病寄生虫病的病原体属于锥虫科。这些寄生虫的原生动物具有独特的巯基氧化还原代谢，该代谢基于黄素酶锥虫硫酮还原酶（TR）。TR被确定为潜在的药物靶标，并具有一个较大的活性位点，可以实现多种可能的配体取向，这使得合理的基于结构的抑制剂设计极具挑战性。在本文中，我们描述了一系列新的TR小分子抑制剂的合成，结合特性和动力学分析。生物活性，突变研究和虚拟配体对接模拟的结合导致对结合模式的预测，该结合模式已通过晶体结构分析得到证实。晶体结构表明，配体与所谓的“ mepacrine结合位点”的疏水壁结合。抑制剂对TR的结合构象和效价从布氏锥虫和克鲁斯锥虫。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201402032

文献信息

• Targeting a Large Active Site: Structure‐Based Design of Nanomolar Inhibitors of <i>Trypanosoma brucei</i> Trypanothione Reductase
  作者：Raoul De Gasparo、Ondrej Halgas、Dora Harangozo、Marcel Kaiser、Emil F. Pai、R. Luise Krauth‐Siegel、François Diederich

  DOI：10.1002/chem.201901664

  日期：2019.9.2

  73 nm, which is fully selective against human glutathione reductase (hGR). The best ligands exhibited in vitro IC50 values (half-maximal inhibitory concentration) against the HAT pathogen, T. brucei rhodesiense, in the mid-nanomolar range, reaching down to 50 nm. X-Ray co-crystal structures confirmed the binding mode of the ligands and revealed the presence of a HEPES buffer molecule in the large active

  锥虫酮还原酶（TR）在锥虫的独特氧化还原代谢中起着关键作用，锥虫是人类非洲锥虫病（HAT），恰加斯氏病和利什曼病的病原体。向已知的TR抑制剂类中引入新的瘦型脯氨酸载体导致报道最强的布鲁氏锥虫（Trypanosoma（T.）Brucei TR）竞争性抑制剂，其抑制常数Ki为73 nm，对人谷胱甘肽还原酶（hGR）具有完全选择性）。最好的配体在中纳摩尔范围内对HAT病原体T. brucei rhodesiense表现出体外IC50值（半数最大抑制浓度），低至50 nm。X射线共晶结构证实了配体的结合模式，并揭示了HEPES缓冲分子在较大的活性位点中的存在。炔丙基载体的扩展，
• Biological Evaluation and X-ray Co-crystal Structures of Cyclohexylpyrrolidine Ligands for Trypanothione Reductase, an Enzyme from the Redox Metabolism of Trypanosoma
  作者：Raoul De Gasparo、Elke Brodbeck-Persch、Steve Bryson、Nina B. Hentzen、Marcel Kaiser、Emil F. Pai、R. Luise Krauth-Siegel、François Diederich

  DOI：10.1002/cmdc.201800067

  日期：2018.5.8

  were freely soluble and showed competitive inhibition constants (Ki) against Trypanosoma (T.) brucei TR and T. cruzi TR and in vitro activities (half‐maximal inhibitory concentration, IC50) against these parasites in the low micromolar range, with high selectivity against human glutathione reductase. X‐ray co‐crystal structures confirmed the binding of the ligands to the hydrophobic wall of the “mepacrine

  人类非洲锥虫病，南美锥虫病和各种形式的利什曼病是热带疾病，是由锥虫病家族的寄生虫引起的。这些原生动物具有独特的氧化还原代谢，该代谢基于锥虫硫烷和锥虫硫醇还原酶（TR），使TR成为有前途的药物靶标。我们通过基于结构的设计报告了TR的环己基吡咯烷抑制剂的性能和效能的优化。最好的抑制剂是可自由溶解的，并显示出对锥虫（T.）brucei TR和T. cruzi TR的竞争抑制常数（K i）和体外活性（半数最大抑制浓度，IC 50）在低微摩尔范围内对这些寄生虫具有抗人谷胱甘肽还原酶的高选择性。X射线共晶结构证实了配体与“ mepacrine结合位点”的疏水壁的结合，并且具有面向大活性位点表面的新的可提供溶解度的载体。
• Binding to Large Enzyme Pockets: Small-Molecule Inhibitors of Trypanothione Reductase
  作者：Elke Persch、Steve Bryson、Nickolay K. Todoroff、Christian Eberle、Jonas Thelemann、Natalie Dirdjaja、Marcel Kaiser、Maria Weber、Hassan Derbani、Reto Brun、Gisbert Schneider、Emil F. Pai、R. Luise Krauth-Siegel、François Diederich

  DOI：10.1002/cmdc.201402032

  日期：2014.4.30

  conjunction of biological activities, mutation studies, and virtual ligand docking simulations led to the prediction of a binding mode that was confirmed by crystal structure analysis. The crystal structures revealed that the ligands bind to the hydrophobic wall of the so‐called “mepacrine binding site”. The binding conformation and potency of the inhibitors varied for TR from Trypanosoma brucei and T

  人类非洲锥虫病寄生虫病的病原体属于锥虫科。这些寄生虫的原生动物具有独特的巯基氧化还原代谢，该代谢基于黄素酶锥虫硫酮还原酶（TR）。TR被确定为潜在的药物靶标，并具有一个较大的活性位点，可以实现多种可能的配体取向，这使得合理的基于结构的抑制剂设计极具挑战性。在本文中，我们描述了一系列新的TR小分子抑制剂的合成，结合特性和动力学分析。生物活性，突变研究和虚拟配体对接模拟的结合导致对结合模式的预测，该结合模式已通过晶体结构分析得到证实。晶体结构表明，配体与所谓的“ mepacrine结合位点”的疏水壁结合。抑制剂对TR的结合构象和效价从布氏锥虫和克鲁斯锥虫。