2-deoxy-3,5-di-O-(p-toluoyl)-α-D-erythropentofuranosyl chloride | 3601-89-6

• 物质功能分类: 生物化工 - 糖类化合物 - 单糖
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 2-deoxy-3,5-di-O-(p-toluoyl)-α-D-erythropentofuranosyl chloride
• 英文别名: Hoffer's chlorosugar；1-Chloro-2-deoxy-3,5-di-O-toluoyl-a-D-ribofuranose；[(2R,3S,5S)-5-chloro-3-(4-methylbenzoyl)oxyoxolan-2-yl]methyl 4-methylbenzoate
• CAS: 3601-89-6；4330-21-6
• 化学式: C₂₁H₂₁ClO₅
• 分子量: 388.848
• InChiKey: FJHSYOMVMMNQJQ-IPMKNSEASA-N

物化性质

• 熔点：
  109°C dec.
• 沸点：
  518.4±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.28±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于乙腈（少量）、氯仿（少量）、二氯甲烷（少量）、DMSO

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.9
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  61.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 危险品标志：
  Xi
• 安全说明：
  S26,S36
• 危险类别码：
  R36/37/38
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

制备方法与用途

1-氯-3,5-二-O-对甲苯甲酰基-2-脱氧-D-呋喃核糖是制备 β-胸苷的重要原料，而 β-胸苷则是合成齐多夫定和司他夫定这类药物过程中必不可少的中间体。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-deoxy-3,5-di-O-(p-toluoyl)-α-D-erythropentofuranosyl chloride 在 氢氧化钾 、 sodium hydroxide 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 6-amino-1-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-1,5-dihydro-3-iodo-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one
  参考文献：
  名称：

  Seela, Frank; Ramzaeva, Natalya; Becher, Georg, Collection of Czechoslovak Chemical Communications, 1996, vol. 61, p. S258 - S261

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  2-deoxy-D-ribose 在 吡啶 、 盐酸 作用下， 以 氘代氯仿 为溶剂， 反应 1.42h， 生成 2-deoxy-3,5-di-O-(p-toluoyl)-α-D-erythropentofuranosyl chloride
  参考文献：
  名称：

  2-Deoxy-3,5-di-Op-toluoyl-α-D-erythro-pentofuranosyl Chloride 的方便制备

  摘要：

  摘要 采用乙酰氯作为HCl发生剂，显着改进了α-氯糖4a的Hoffer制备工艺。通过使用 NOE 测量确认了氯原子的 α-构型。研究了 4a 到 β-端基异构体和糠基衍生物 6 的顺序转化。

  DOI：

  10.1080/00397919708007071
• 作为试剂：
  描述：

  咪唑-4-甲酸甲酯 、 2-deoxy-3,5-di-O-(p-toluoyl)-α-D-erythropentofuranosyl chloride 在 sodium hydride 、 2-deoxy-3,5-di-O-(p-toluoyl)-α-D-erythropentofuranosyl chloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 、 mineral oil 为溶剂， 反应 0.5h， 以51%的产率得到3,5-di-O-p-toluoyl-1,2-dideoxy-1-(4-(methylcarboxy)imidazol-1-yl)-d-ribofuranose
  参考文献：
  名称：

  DNA中金属介导的碱基配对，涉及人工核碱基的咪唑-4-羧酸盐。

  摘要：

  据报道，在金属介导的碱基配对中，将咪唑-4-羧酸盐（X）用作人工核碱基。为此，合成了相应的脱氧核糖核苷，并在结构上表征为其钠盐（1,2-二脱氧-1-（4-羧基咪唑-1-基）-d-呋喃核糖钠。将脱氧核糖核苷掺入不同的DNA双链体（平行链和反平行链）中，并研究了它们的Cu（II）-和Ag（I）结合行为。结果表明，可以同时形成X-Cu（II）-X和X-Ag（I）-X碱基对，前者比后者更稳定。X-Cu（II）-X碱基对的形成伴随着反平行链双链体双链解链温度升高约20°C，平行链双链体的双链体解链温度升高约12°C。咪唑-4-羧酸盐代表Cu（II）介导的碱基配对的第一个基于咪唑的核苷。而且，它是已知形成稳定的Cu（II）介导的碱基对的最小核苷。基于使用模型核碱基1-苄基-1H-咪唑-4-羧酸盐获得的分子结构，也提出了X-Cu（II）-X和X-Ag（I）-X碱基对的结构。

  DOI：

  10.1016/j.jinorgbio.2018.10.013

文献信息

• Chain-Terminating and Clickable NAD⁺Analogues for Labeling the Target Proteins of ADP-Ribosyltransferases
  作者：Yan Wang、Daniel Rösner、Magdalena Grzywa、Andreas Marx

  DOI：10.1002/anie.201404431

  日期：2014.7.28

  of PAR. Herein, we report new NAD+ analogues that are efficiently processed by wild‐type ARTs and lead to chain termination owing to a lack of the required hydroxy group, thereby significantly reducing the complexity of the protein modification. Due to the presence of an alkyne group, these NAD+ analogues allow subsequent manipulations by click chemistry for labeling with dyes or affinity markers.

  ADP-核糖基转移酶（ART）使用NAD +作为底物，并通过将多个ADP-核糖单元转移到靶蛋白上形成聚（ADP-核糖），在DNA损伤反应和细胞周期调控等众多生物学过程中发挥重要作用。 （PAR）大小可变的链。努力确定PARylation的直接靶标以及特定的ADP核糖受体位点，都必须解决PAR的复杂性。在本文中，我们报道了新的NAD +类似物，它们可以被野生型ART有效处理，并且由于缺少所需的羟基而导致链终止，从而显着降低了蛋白质修饰的复杂性。由于存在炔基，这些NAD +类似物允许通过点击化学进行后续操作，以使用染料或亲和标记物进行标记。这项研究提供了对ARTs底物范围的深入了解，并可能为进一步研究PAR代谢的化学工具铺平道路。
• The role of alkyl substituents in deazaadenine-based diarylethene photoswitches
  作者：Christopher Sarter、Michael Heimes、Andres Jäschke

  DOI：10.3762/bjoc.12.106

  日期：——

  Diarylethenes are an important class of reversible photoswitches and often claimed to require two alkyl substituents at the carbon atoms between which the bond is formed or broken in the electrocyclic rearrangement. Here we probe this claim by the synthesis and characterization of four pairs of deazaadenine-based diarylethene photoswitches with either one or two methyl groups at these positions. Depending

  双芳烃是一类重要的可逆光开关，通常声称在碳原子上需要两个烷基取代基，在两个碳原子之间在电环重排中形成或断开键。在这里，我们通过合成和表征在这些位置带有一个或两个甲基的四对基于脱氮腺嘌呤的二芳基乙烯光开关来探讨这一主张。根据取代方式的不同，具有一个烷基的二芳烃可表现出显着的光致变色性，但它们通常对扩展的紫外线辐射显示出较差的稳定性，较低的热稳定性和降低的抗疲劳性。获得的结果为设计用于生物纳米技术和合成生物学的新型高效DNA光开关提供了重要的方向。
• [EN] REAGENTS FOR REVERSIBLY TERMINATING PRIMER EXTENSION<br/>[FR] RÉACTIFS UTILISÉS POUR L'INTERRUPTION RÉVERSIBLE D'EXTENSION D'AMORCE
  申请人：BENNER STEVEN ALBERT

  公开号：WO2010110775A1

  公开（公告）日：2010-09-30

  This invention relates to the field of nucleic acid chemistry, more specifically to the field of compositions of matter that comprise triphosphates of modified 2'-deoxynucleosides and oligonucleotides that are formed when these are appended to the 3'-end of a primer, wherein said modifications comprise NH2 moiety attached to their 3'-hydroxyl group and a fluorescent species in a form of a tag affixed to the nucleobase via a linker that can be cleaved. Such compositions and their associated processes enable and improve the sequencing of oligonucleotides using a strategy of cyclic reversible termination, as outlined in US Patent 6,664,079. Most specifically, the invention concerns compositions of matter that are 5'-triphosphates of ribo- and 2'- deoxyribonucleosides carrying detectable tags and oligonucleotides that might be derived from them. The invention also concerns processes wherein a DNA polymerase, RNA polymerase, or reverse transcriptase synthesizes said oligonucleotides via addition of said triphosphates to a primer.

  这项发明涉及核酸化学领域，更具体地涉及包括改性2'-脱氧核苷酸三磷酸和寡核苷酸的物质组合的领域，当这些物质附加到引物的3'-末端时形成，其中这些改性包括连接到它们的3'-羟基的NH2基团和以可切割的方式通过连接器固定到核碱基上的荧光物种的标签。这种组合物及其相关的过程使得并改善了使用循环可逆终止策略进行寡核苷酸测序，正如美国专利6,664,079中所概述的那样。具体而言，该发明涉及的是包含可检测标签的核糖和2'-脱氧核糖核苷酸的5'-三磷酸和可能由它们衍生的寡核苷酸的物质组合。该发明还涉及DNA聚合酶、RNA聚合酶或逆转录酶通过将这些三磷酸添加到引物而合成所述寡核苷酸的过程。
• [EN] INDOLIN-2-ONE OR PYRROLO-PYRIDIN/PYRIMIDIN-2-ONE DERIVATIVES<br/>[FR] DÉRIVÉS INDOLIN-2-ONE OU PYRROLO-PYRIDIN/PYRIMIDIN-2-ONE
  申请人：HOFFMANN LA ROCHE

  公开号：WO2014202493A1

  公开（公告）日：2014-12-24

  The present invention is concerned with 2-oxo-2,3-dihydro-indoles of general formula (I) wherein Ar is a heteroaryl group, containing one, two or three heteroatoms, selected from N, S or O; R1 is hydrogen, lower alkyl, halogen, amino, dimethylamino, cyano, lower alkyl substituted by halogen, lower alkyl substituted by hydroxy, CH(OH)CF3, (CH2)o-lower alkoxy, cycloalkyl optionally substituted by CF3, or heterocycloalkyl optionally substituted by lower alkyl; R2 is hydrogen, lower alkyl, (CH2)o-cycloalkyl, (CH2)o-O-cycloalkyl, (CH2)o-lower alkoxy, CH2)o-lower alkoxy substituted by halogen, (CH2)o-heterocycloalkyl optionally substituted by lower alkyl, (CH2)o-S(O)2-cycloalkyl, lower alkyl substituted by one or two hydroxy, lower alkyl substituted by one or two lower alkoxy, (CH2)o-S(O)2-lower alkyl, lower alkyl substituted by halogen or CH2CH(OH)CF3; R3 is halogen or lower alkyl; X is CH or N; X1 is CH or N; n is 1 or 2; o is 0, 1, 2 or 3; m is 0, 1 or 2; and the dotted line is a bond or not; as well as with a pharmaceutically acceptable salts thereof, with a racemic mixture, or with its corresponding enantiomer and/or optical isomer and/or stereoisomer thereof The compounds may be used for the treatment of certain central nervous system disorders which are positive (psychosis) and negative symptoms of schizophrenia, substance abuse, alcohol and drug addiction, obsessive-compulsive disorders, cognitive impairment, bipolar disorders, mood disorders, major depression, treatment resistant depression, anxiety disorders, Alzheimer's disease, autism, Parkinson's disease, chronic pain, borderline personality disorder, sleep disturbances, chronic fatigue syndrome, stiffness, antiinflammatory effects in arthritis and balance problems.

  本发明涉及通式（I）中的2-氧代-2,3-二氢吲哚，其中Ar是一个杂环烃基，含有一个、两个或三个杂原子，选自N、S或O；R1是氢、低碳基、卤素、氨基、二甲胺基、氰基、被卤素取代的低碳基、被羟基取代的低碳基、CH(OH)CF3、（CH2）o-低碳醚、环烷基（可选地被CF3取代）、或杂环烷基（可选地被低碳基取代）；R2是氢、低碳基、（CH2）o-环烷基、（CH2）o-O-环烷基、（CH2）o-低碳醚、被卤素取代的（CH2）o-低碳醚、（CH2）o-杂环烷基（可选地被低碳基取代）、（CH2）o-S(O)2-环烷基、被一个或两个羟基取代的低碳基、被一个或两个低碳醚取代的低碳基、（CH2）o-S(O)2-低碳基、被卤素或CH2CH(OH)CF3取代的低碳基；R3是卤素或低碳基；X是CH或N；X1是CH或N；n是1或2；o是0、1、2或3；m是0、1或2；虚线是键或非键；以及其在药学上可接受的盐、消旋混合物、或其相应的对映体和/或光学异构体和/或立体异构体。这些化合物可用于治疗某些中枢神经系统障碍，包括精神病（阳性和阴性症状）、精神分裂症、物质滥用、酒精和药物成瘾、强迫症、认知障碍、双相情感障碍、情绪障碍、重性抑郁症、治疗难治性抑郁症、焦虑障碍、阿尔茨海默病、自闭症、帕金森病、慢性疼痛、边缘人格障碍、睡眠障碍、慢性疲劳综合征、僵硬、关节炎的抗炎作用和平衡问题。
• Synthesis and characterization of N2-(p-n-butylphenyl)-2'-deoxyguanosine and its 5'-triphosphate and their inhibition of HeLa DNA polymerase .alpha.
  作者：George E. Wright、Lech W. Dudycz

  DOI：10.1021/jm00368a012

  日期：1984.2

  N2-(p-n-Butylphenyl)-2'-deoxyguanosine (BuPdG) and its 5'-triphosphate (BuPdGTP), expected to be inhibitors of eukaryotic DNA polymerase alpha, have been synthesized. BuPdG was synthesized by two methods and characterized by 1H NMR and by chemical relation to guanosine. Direct synthesis involving silylated N2-(p-n-butylphenyl)guanine (BuPG) and 1-chloro-3,5-di-p-toluoyl-2-deoxyribofuranose in the presence

  已经合成了N2-（pn-丁基苯基）-2'-脱氧鸟苷（BuPdG）及其5'-三磷酸（BuPdGTP），它们有望成为真核DNA聚合酶α的抑制剂。通过两种方法合成BuPdG，并通过1H NMR和与鸟嘌呤的化学关系进行表征。在三甲基甲硅烷基三氟甲磺酸酯存在下，直接合成包括甲硅烷基化的N2-（pn-丁基苯基）鸟嘌呤（BuPG）和1-氯-3,5-二-对甲苯甲酰基-2-脱氧核糖呋喃糖的方法得到了一个脱氧核糖核苷的α和两个β异构体通过1 H NMR。但是，NMR和UV光谱在区分7个和9个异构体方面是模棱两可的。所需的9-β-BuPdG的身份最终由其从相应的核糖核苷的独立合成中证实。O'的1 H NMR谱 BuPG的乙酰化核糖核苷表现出O'乙酰化鸟苷的特征性模式，并且通过将O'乙酰化的2-溴代肌苷异构体与pn丁基苯胺和氨反应的产物联系起来，证明了它们的同一性：2-溴代肌苷鸟苷还产生了可疑的9-β-核糖核苷B