作者:Katherine I. Taylor、Jordan S. Ho、Hallie O. Trial、Alan W. Carter、Laura L. Kiessling
DOI:10.1021/jacs.2c05691
日期:2023.11.22
Probes that covalently label protein targets facilitate the identification of ligand-binding sites. Lysine residues are prevalent in the proteome, making them attractive substrates for covalent probes. However, identifying electrophiles that undergo amine-specific, regioselective reactions with binding site lysine residues is challenging. Squarates can engage in two sequential conjugate addition–elimination
共价标记蛋白质靶标的探针有助于鉴定配体结合位点。赖氨酸残基在蛋白质组中普遍存在,使其成为共价探针的有吸引力的底物。然而,鉴定与结合位点赖氨酸残基发生胺特异性区域选择性反应的亲电试剂具有挑战性。Squa酸盐可以与胺进行两次连续的偶联加成-消除反应。氮供体降低了第二次反应速率,使单方酰胺成为温和的亲电试剂。我们假设这种温和的亲电性需要在胺附近停留更长的时间,从而为结合位点赖氨酸提供更高的选择性。因此,我们比较了 squa酸盐和单平方酰胺胺取代与替代胺生物偶联手柄的动力学。数据显示,N-羟基琥珀酰亚胺酯的反应速度快 4 个数量级,与它们的标记混杂一致。Squarate 反应性可以通过替换模式进行调整。乙烯基或酰胺上的吸电子基团可提高反应速率。连佬酸盐比二连苯甲酸盐反应更快,而乙烯基硫酯类似物二硫喹酸盐反应更慢。我们使用来自结核分枝杆菌的 UDP-糖加工酶 GlfT2 选择性地评估了 squarate,该酶具有