DYn-2 | 1354630-46-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: DYn-2
• 英文别名: 4-(Pent-4-yn-1-yl)cyclohexane-1,3-dione；4-pent-4-ynylcyclohexane-1,3-dione
• CAS: 1354630-46-8
• 化学式: C₁₁H₁₄O₂
• 分子量: 178.231
• InChiKey: UNMICBPHYXLMRA-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  305.6±22.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.046±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  DMF：30mg/mL； DMSO：20mg/mL；乙醇：20mg/mL

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  34.1
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-[18F]fluoroethylazide 、 DYn-2 在 CU-CATALYZED 作用下， 生成
  参考文献：
  名称：

  [EN] COMPOUNDS USEFUL FOR IN VIVO IMAGING OF PROTEIN OXIDATION AND/OR CANCER TREATMENT
  [FR] COMPOSÉS UTILES POUR L'IMAGERIE IN VIVO DE L'OXYDATION DE PROTÉINE ET/OU DU TRAITEMENT D'UN CANCER

  摘要：

  本文提供了一些化合物的公式I、公式II和公式III，这些化合物可用于标记受试者的组织（例如，对受试者进行PET成像）、治疗癌症和/或制备药物。还提供了含有与巯基化蛋白反应的基团的化合物，用于治疗癌症和/或制备药物。还提供了这些化合物和前体化合物的合成方法。

  公开号：

  WO2020018613A1
• 作为产物：
  描述：

  5-氯戊炔 在 sodium iodide 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 六甲基磷酰三胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 20.5h， 生成 DYn-2
  参考文献：
  名称：

  基于光笼活性的探针，用于改进活细胞中蛋白质 S-磺酰化的监测

  摘要：

  蛋白质S-磺酰化（蛋白质磺酸）作为最重要的氧化翻译后修饰（OxiPTM）之一，在调节蛋白质功能中发挥着至关重要的作用。已经开发出多种基于活性的探针来分析活细胞中的次磺酸。然而，由于活细胞中磺酸的短暂存在和含量较低，需要高剂量的探针才能实现有效标记。更重要的是，当前的探针无法对次磺酸标记进行时间控制。为了克服这些限制，本研究开发了两种带有邻硝基苯甲基或香豆素保护基团的笼式半胱氨酸磺酸探针 DYn-2-ONB 和 DYn-2-Cou 。两种探针都可以通过辐射有效地解开束缚，产生活性 C-亲核试剂探针 DYn-2。活细胞中的标记测定表明，与 DYn-2 相比，DYn-2-ONB 表现出更好的标记能力，使其成为改善活细胞中蛋白质S-磺酰化监测的有力工具。

  DOI：

  10.1016/j.cclet.2023.108560

文献信息

• [EN] TARGETED COVALENT PROBES AND INHIBITORS OF PROTEINS CONTAINING REDOX-SENSITIVE CYSTEINES<br/>[FR] SONDES COVALENTES CIBLÉES ET INHIBITEURS DE PROTÉINES CONTENANT DES CYSTÉINES SENSIBLES À L'OXYDORÉDUCTION
  申请人：SCRIPPS RESEARCH INST

  公开号：WO2014089546A1

  公开（公告）日：2014-06-12

  Covalent, irreversible small-molecule inhibitors that modify the sulfenyl form (i.e., sulfenic acid, RSOH and sulfenamide, RSNR'2) of therapeutically important proteins (particularly kinases and phosphatases) are disclosed, where the compositions include a compound having a substituted aryl or heterocyclic core structure that promotes binding interactions with a specific protein, and a nucleophilic reaction center (carbon, nitrogen, sulfur, or phosphorous) that is capable of forming a covalent bond with a sulfenic acid- or sulfenamide-modified cysteine residue in the protein. Methods for synthesizing these compounds are also disclosed, as well as methods of using them for determining the bioactivity of a chemical composition comprising an active compound toward a specific protein and for determining the potency of an inhibitor against a specific protein.

  揭示了用于修饰治疗重要蛋白质（特别是激酶和磷酸酶）的亚硫酰形式（即亚硫酸，RSOH和亚硫酰胺，RSNR'2）的共价、不可逆的小分子抑制剂，其中组合物包括具有取代芳基或杂环核结构的化合物，促进与特定蛋白质的结合相互作用，以及能够与蛋白质中的亚硫酸或亚硫酰胺修饰的半胱氨酸残基形成共价键的亲核反应中心（碳、氮、硫或磷）。还揭示了合成这些化合物的方法，以及使用它们确定包含活性化合物的化学组合物对特定蛋白质的生物活性以及确定抑制剂对特定蛋白质的效力的方法。
• Diverse Redoxome Reactivity Profiles of Carbon Nucleophiles
  作者：Vinayak Gupta、Jing Yang、Daniel C. Liebler、Kate S. Carroll

  DOI：10.1021/jacs.7b01791

  日期：2017.4.19

  excessive production of reactive oxygen species. Once oxidized, the sulfur atom of cysteine is much less reactive toward electrophilic groups used in the traditional FBLD paradigm. To address this limitation, we recently developed a novel library of diverse carbon-based nucleophile fragments that react selectively with cysteine sulfenic acid formed in proteins via oxidation or hydrolysis reactions. Here,

  靶向共价抑制剂已成为药物发现管道中的一种强大方法。这个过程的关键是识别特定于（或过度表达）疾病细胞的信号通路（或受体）。在这种情况下，基于片段的配体发现 (FBLD) 极大地扩展了我们对可配体蛋白质组的看法，并为生物学研究提供了工具化合物。迄今为止，这种共价配体的发现几乎完全采用了半胱氨酸反应性小分子片段。然而，蛋白质中的功能性半胱氨酸残基通常对氧化还原敏感，并且可以在细胞中发生氧化。这种反应与癌症等疾病特别相关，这些疾病与活性氧的过度产生有关。一旦氧化，半胱氨酸的硫原子对传统 FBLD 范例中使用的亲电子基团的反应性要低得多。为了解决这一限制，我们最近开发了一个新的各种碳基亲核试剂片段库，这些片段可以与通过氧化或水解反应在蛋白质中形成的半胱氨酸次磺酸选择性地反应。在这里，我们报告了针对结肠癌细胞蛋白质组筛选的次磺酸反应性 C-亲核试剂片段的分析。共价配体被鉴定为存在于“可成药”蛋白质和孤儿靶标中的
• COMPOUNDS USEFUL FOR PROMOTING PROTEIN DEGRADATION AND METHODS USING SAME
  申请人：YALE UNIVERSITY

  公开号：US20150119435A1

  公开（公告）日：2015-04-30

  The present invention includes compounds that act as degraders of a target protein, wherein degradation is independent of the class of the target protein or its localization. In certain embodiments, the invention comprises a compound comprising a protein degradation moiety covalently bound to a linker, wherein the ClogP of the compound is equal to or higher than 1.5. In other embodiments, the target protein contemplated within the invention comprises a posttranslational modified protein or intracellular protein. In yet other embodiments, compounds of the present invention are used to treat disease states wherein protein degradation is a viable therapeutic approach, such as cancer or any sort of oxidative stress disease state.

  本发明涉及作为目标蛋白质降解剂的化合物，其中降解独立于目标蛋白质的类别或其定位。在某些实施例中，本发明包括一种化合物，该化合物包括与链接物共价结合的蛋白质降解基团，其中化合物的ClogP等于或高于1.5。在其他实施例中，本发明中考虑的目标蛋白质包括后翻译修饰蛋白质或细胞内蛋白质。在其他实施例中，本发明的化合物被用于治疗蛋白质降解是一种有效的治疗方法的疾病状态，例如癌症或任何形式的氧化应激疾病状态。
• Targeted Covalent Probes and Inhibitors of Proteins Containing Redox-Sensitive Cysteines
  申请人：THE SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE

  公开号：US20160195532A1

  公开（公告）日：2016-07-07

  Covalent, irreversible small-molecule inhibitors that modify the sulfenyl form (i.e., sulfenic acid, RSOH and sulfenamide, RSNR′2) of therapeutically important proteins (particularly kinases and phosphatases) are disclosed, where the compositions include a compound having a substituted aryl or heterocyclic core structure that promotes binding interactions with a specific protein, and a nucleophilic reaction center (carbon, nitrogen, sulfur, or phosphorous) that is capable of forming a covalent bond with a sulfenic acid- or sulfenamide-modified cysteine residue in the protein. Methods for synthesizing these compounds are also disclosed, as well as methods of using them for determining the bioactivity of a chemical composition comprising an active compound toward a specific protein and for determining the potency of an inhibitor against a specific protein.
• COMPOUNDS USEFUL FOR IN VIVO IMAGING OF PROTEIN OXIDATION AND/OR CANCER TREATMENT
  申请人：Wake Forest University Health Sciences

  公开号：US20210299285A1

  公开（公告）日：2021-09-30

  Provided herein are compounds of Formula I, Formula II Formula III which are useful in labeling tissues in a subject (e.g., PET imaging of a subject), for treatment of cancer, and/or for preparing a medicament. Also provided are compounds containing a group that is reactive with sulfenylated proteins for treatment of cancer and/or for preparing a medicament. Methods of synthesis of the compounds and precursor compounds are also provided.