5-bromopentanoyl-L-valinyl-L-tyrosine benzyl ester | 180078-19-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 5-bromopentanoyl-L-valinyl-L-tyrosine benzyl ester
• 英文别名: benzyl (2S)-2-[[(2S)-2-(5-bromopentanoylamino)-3-methylbutanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoate
• CAS: 180078-19-7
• 化学式: C₂₆H₃₃BrN₂O₅
• 分子量: 533.462
• InChiKey: MAQJPHBJPBXDTL-UPVQGACJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-bromopentanoyl-L-valinyl-L-tyrosine benzyl ester 在 potassium carbonate 、 sodium iodide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 9S-isopropyl-7,10-dioxo-2-oxa-8,11-diaza-bicyclo[12.2.2]octadeca-1(17),14(18),15-triene-12S-carboxylic acid benzyl ester
  参考文献：
  名称：

  在水和非质子溶剂中模拟三肽 β-链的构象限制大环化合物

  摘要：

  水溶液中的短肽的 β 链构象是未知的，但它是蛋白质的基本构建块，也是能够形成和转换所有蛋白质的蛋白水解酶的关键识别基序。为了创建通用支架作为预组织在 β 链中的肽模拟物，我们单独合成了一系列 15-22 元三肽的大环类似物并分析了它们的结构。每个循环都受到两个反式酰胺键和一个平面芳环的高度限制，它们之间有一个短的非肽接头。该环应变的一个量度是组分酪氨酰芳环（DeltaG(rot) 76.7 kJ mol(-1) (16-元环), 46.1 kJ mol(-1) (17-元环)）的受限旋转通过变温质子 NMR 光谱 (DMF-d(7), 200-400 K)。在这些大环的质子和非质子溶剂中检测到与大二面角相对应的异常大酰胺偶联常数 ((3)J(NH-CHalpha) 9-10 Hz)，与溶液中的高度结构一致。所有酰胺 NH 化学位移 (Deltadelta/T 7-12 ppb/deg) 的

  DOI：

  10.1021/ja0256461
• 作为产物：
  描述：

  L-tyrosine benzyl ester 在 N-甲基吗啉 、 potassium carbonate 、 三氟乙酸 、 氯甲酸异丁酯 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 3.83h， 生成 5-bromopentanoyl-L-valinyl-L-tyrosine benzyl ester
  参考文献：
  名称：

  在水和非质子溶剂中模拟三肽 β-链的构象限制大环化合物

  摘要：

  水溶液中的短肽的 β 链构象是未知的，但它是蛋白质的基本构建块，也是能够形成和转换所有蛋白质的蛋白水解酶的关键识别基序。为了创建通用支架作为预组织在 β 链中的肽模拟物，我们单独合成了一系列 15-22 元三肽的大环类似物并分析了它们的结构。每个循环都受到两个反式酰胺键和一个平面芳环的高度限制，它们之间有一个短的非肽接头。该环应变的一个量度是组分酪氨酰芳环（DeltaG(rot) 76.7 kJ mol(-1) (16-元环), 46.1 kJ mol(-1) (17-元环)）的受限旋转通过变温质子 NMR 光谱 (DMF-d(7), 200-400 K)。在这些大环的质子和非质子溶剂中检测到与大二面角相对应的异常大酰胺偶联常数 ((3)J(NH-CHalpha) 9-10 Hz)，与溶液中的高度结构一致。所有酰胺 NH 化学位移 (Deltadelta/T 7-12 ppb/deg) 的

  DOI：

  10.1021/ja0256461

文献信息

• Conformational Selection of Inhibitors and Substrates by Proteolytic Enzymes:  Implications for Drug Design and Polypeptide Processing
  作者：David P. Fairlie、Joel D. A. Tyndall、Robert C. Reid、Allan K. Wong、Giovanni Abbenante、Martin J. Scanlon、Darren R. March、Douglas A. Bergman、Christina L. L. Chai、Brendan A. Burkett

  DOI：10.1021/jm990315t

  日期：2000.4.6

  profound implications for inhibitor design. This conclusion is supported by NMR, CD, and binding studies for HIV-1 protease inhibitors/substrates which, when preorganized in an extended conformation, have significantly higher protease affinity. Recognition is dependent upon conformational equilibria since helical and turn peptide conformations are not processed by proteases. Conformational selection

  蛋白水解酶（蛋白酶）的抑制剂正在作为对诸如艾滋病和病毒感染，癌症，炎性疾病和阿尔茨海默氏病等疾病的前瞻性治疗方法出现。蛋白酶抑制剂设计的通用方法受到抑制剂和蛋白酶在结合过程中相互作用和结构变化的不可预测性的限制。对与48种蛋白酶（16种天冬氨酸，17种丝氨酸，8种半胱氨酸和7种金属蛋白酶）结合的266种小分子抑制剂的叠加晶体结构的计算机分析，提供了第一个确凿的证据，证明抑制剂（包括底物类似物）通常结合在扩展的β链中所有这些蛋白酶的活性位点处的构象。显示了（a）与每种蛋白酶结合的多种抑制剂的代表性叠加结构，（b）分别与多种蛋白酶结合的单一抑制剂，和（c）与蛋白酶结合的构象约束抑制剂。因此，抑制剂/底物构象，而不是单独的序列/组成，影响蛋白酶的识别，这对抑制剂的设计具有深远的意义。NMR，CD和对HIV-1蛋白酶抑制剂/底物的结合研究支持了这一结论，当HIV-1蛋白酶抑制剂/底物以扩展构象进行
• Conformationally Constrained Macrocycles That Mimic Tripeptide β-Strands in Water and Aprotic Solvents
  作者：Robert C. Reid、Michael J. Kelso、Martin J. Scanlon、David P. Fairlie

  DOI：10.1021/ja0256461

  日期：2002.5.1

  highly constrained by two trans amide bonds and a planar aromatic ring with a short nonpeptidic linker between them. A measure of this ring strain is the restricted rotation of the component tyrosinyl aromatic ring (DeltaG(rot) 76.7 kJ mol(-1) (16-membered ring), 46.1 kJ mol(-1) (17-membered ring)) evidenced by variable temperature proton NMR spectra (DMF-d(7), 200-400 K). Unusually large amide coupling

  水溶液中的短肽的 β 链构象是未知的，但它是蛋白质的基本构建块，也是能够形成和转换所有蛋白质的蛋白水解酶的关键识别基序。为了创建通用支架作为预组织在 β 链中的肽模拟物，我们单独合成了一系列 15-22 元三肽的大环类似物并分析了它们的结构。每个循环都受到两个反式酰胺键和一个平面芳环的高度限制，它们之间有一个短的非肽接头。该环应变的一个量度是组分酪氨酰芳环（DeltaG(rot) 76.7 kJ mol(-1) (16-元环), 46.1 kJ mol(-1) (17-元环)）的受限旋转通过变温质子 NMR 光谱 (DMF-d(7), 200-400 K)。在这些大环的质子和非质子溶剂中检测到与大二面角相对应的异常大酰胺偶联常数 ((3)J(NH-CHalpha) 9-10 Hz)，与溶液中的高度结构一致。所有酰胺 NH 化学位移 (Deltadelta/T 7-12 ppb/deg) 的