5-{6-amino-8-[3-bromomethyl-5-(3-trifluoromethyl-3H-diazirin-3-yl)benzylsulfanyl]purin-9-yl}-2-hydroxymethyltetrahydrofuran-3,4-diol | 676371-83-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 5-{6-amino-8-[3-bromomethyl-5-(3-trifluoromethyl-3H-diazirin-3-yl)benzylsulfanyl]purin-9-yl}-2-hydroxymethyltetrahydrofuran-3,4-diol
• 英文别名: (2R,3R,4S,5R)-2-[6-amino-8-[[3-(bromomethyl)-5-[3-(trifluoromethyl)diazirin-3-yl]phenyl]methylsulfanyl]purin-9-yl]-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 676371-83-8
• 化学式: C₂₀H₁₉BrF₃N₇O₄S
• 分子量: 590.381
• InChiKey: DMAVRFGNMXCBTI-LSCFUAHRSA-N

物化性质

• 沸点：
  793.0±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.05±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  190
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-{6-amino-8-[3-bromomethyl-5-(3-trifluoromethyl-3H-diazirin-3-yl)benzylsulfanyl]purin-9-yl}-2-hydroxymethyltetrahydrofuran-3,4-diol 在 磷酸三甲酯 、 Proton Sponge 、 Dowex-MWA-1 、 N,N'-羰基二咪唑 、 三氟乙酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.21h， 生成 2-{2-[3-[6-amino-9-(3,4-dihydroxy-5-phosphonooxyphosphonooxyphosphonooxymethyltetrahydrofuran-2-yl)-9H-purin-8-ylsulfanylmethyl]-5-(3-trifluoromethyl-3H-diazirin-3-yl)benzylamino]ethyldisulfanyl}ethylamine
  参考文献：
  名称：

  磁性微球（PALMm）上的光亲和性标记方法，用于地形图绘制：PALMm试剂的制备和生化相关性的证明。

  摘要：

  光亲和标记（PAL）是一种广泛用于识别蛋白质内结合位点的技术。尽管经典方法既通用又功能强大，但是它具有许多缺点，例如需要放射性标记PAL配体，以及需要对标记的蛋白质和衍生自其的标记的肽进行高度复杂的分离。在这里，我们提出了一种新颖而通用的方法-磁性微球上的光亲和标记（PALMm），旨在简化和缩短PAL协议。在这种情况下，我们描述了PALMm试剂的制备及其对两种ATP结合酶（己糖激酶和腺苷三磷酸酶）的生化相关性的评估。

  DOI：

  10.1039/b303425a
• 作为产物：
  描述：

  3,5-二甲基-2,2,2-三氟苯乙酮 在 吡啶 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 氨 、 羟胺 、 过氧化苯甲酰 作用下， 以 乙醚 、 乙醇 、 甲酸甲酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 37.0h， 生成 5-{6-amino-8-[3-bromomethyl-5-(3-trifluoromethyl-3H-diazirin-3-yl)benzylsulfanyl]purin-9-yl}-2-hydroxymethyltetrahydrofuran-3,4-diol
  参考文献：
  名称：

  磁性微球（PALMm）上的光亲和性标记方法，用于地形图绘制：PALMm试剂的制备和生化相关性的证明。

  摘要：

  光亲和标记（PAL）是一种广泛用于识别蛋白质内结合位点的技术。尽管经典方法既通用又功能强大，但是它具有许多缺点，例如需要放射性标记PAL配体，以及需要对标记的蛋白质和衍生自其的标记的肽进行高度复杂的分离。在这里，我们提出了一种新颖而通用的方法-磁性微球上的光亲和标记（PALMm），旨在简化和缩短PAL协议。在这种情况下，我们描述了PALMm试剂的制备及其对两种ATP结合酶（己糖激酶和腺苷三磷酸酶）的生化相关性的评估。

  DOI：

  10.1039/b303425a

文献信息

• Photoaffinity labeling on magnetic microspheres (PALMm) methodology for topographic mapping: preparation of PALMm reagents and demonstration of biochemical relevance
  作者：Efrat Halbfinger、Karine Gorochesky、Sébastien A. Lévesque、Adrien R. Beaudoin、Larisa Sheihet、Shlomo Margel、Bilha Fischer

  DOI：10.1039/b303425a

  日期：——

  to conduct highly complicated separations of both the labeled protein and the labeled peptides derived from it. Here, we propose a novel and universal methodology--Photo-Affinity Labeling on Magnetic microspheres (PALMm) designed to simplify and shorten the PAL protocol. In this context, we describe the preparation of PALMm reagents and the evaluation of their biochemical relevance regarding two ATP-binding

  光亲和标记（PAL）是一种广泛用于识别蛋白质内结合位点的技术。尽管经典方法既通用又功能强大，但是它具有许多缺点，例如需要放射性标记PAL配体，以及需要对标记的蛋白质和衍生自其的标记的肽进行高度复杂的分离。在这里，我们提出了一种新颖而通用的方法-磁性微球上的光亲和标记（PALMm），旨在简化和缩短PAL协议。在这种情况下，我们描述了PALMm试剂的制备及其对两种ATP结合酶（己糖激酶和腺苷三磷酸酶）的生化相关性的评估。