2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)guanosine | 87619-81-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)guanosine
• 英文别名: 2'-3'-O-isopropylidene-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)guanosine；5'-(tert-Butyldimethylsilyl)-2',3'-O-isopropylidene guanosine；5'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',3'-O-isopropylideneguanosine；5'-tert-butyl-dimethylsilyl-2',3'-isopropylidene guanosine；2',3'-O-isopropylidene-5'-O-t-butyldimethylsilylguanosine；5'-t-butyl-dimethylsilyl-2',3'-O-isopropylidene-guanosine；5'-O-[(Tert-butyldimethylsilyl]-2',3'-O-(1-methylethylidene)-guanosine；9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-2-amino-1H-purin-6-one
• CAS: 87619-81-6
• 化学式: C₁₉H₃₁N₅O₅Si
• 分子量: 437.571
• InChiKey: OLZBCUNELXTSII-XNIJJKJLSA-N

物化性质

• 密度：
  1.39±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.14
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.74
• 拓扑面积：
  122
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)guanosine 在 吡啶 、 水 、 碘 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲苯 为溶剂， 反应 25.34h， 生成 3',5'-di-O-acetyl-2'-deoxy-2-N-(mono-p-methoxytrityl)guanosine
  参考文献：
  名称：

  C6 上鸟苷和 2'-脱氧鸟苷的功能化：改进的 Appel 过程和咪唑的 SNAr 置换

  摘要：

  用咪唑/三苯基膦/碘/乙基二异丙胺处理糖保护的鸟苷和 2'-脱氧鸟苷的 2-N-三苯甲基衍生物，得到相应的 6-(咪唑-1-基)-2-(三苯甲基氨基)嘌呤核苷。用亲核试剂对咪唑部分进行 SNAr 置换，提供 2-氨基-6-取代的嘌呤核苷和 2'-脱氧核苷。†为了纪念和庆祝 Leroy B. Townsend 教授 70 岁生日。#这篇论文是：核酸相关化合物，122。论文 121 是参考文献。1.

  DOI：

  10.1081/ncn-120027823
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 、 2',3'-O-异丙亚基鸟苷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 反应 24.0h， 生成 2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)guanosine
  参考文献：
  名称：

  C6 上鸟苷和 2'-脱氧鸟苷的功能化：改进的 Appel 过程和咪唑的 SNAr 置换

  摘要：

  用咪唑/三苯基膦/碘/乙基二异丙胺处理糖保护的鸟苷和 2'-脱氧鸟苷的 2-N-三苯甲基衍生物，得到相应的 6-(咪唑-1-基)-2-(三苯甲基氨基)嘌呤核苷。用亲核试剂对咪唑部分进行 SNAr 置换，提供 2-氨基-6-取代的嘌呤核苷和 2'-脱氧核苷。†为了纪念和庆祝 Leroy B. Townsend 教授 70 岁生日。#这篇论文是：核酸相关化合物，122。论文 121 是参考文献。1.

  DOI：

  10.1081/ncn-120027823

文献信息

• Protection of the Amino Group of Adenosine and Guanosine Derivatives by Elaboration into a 2,5-Dimethylpyrrole Moiety
  作者：Ireneusz Nowak、Morris J. Robins

  DOI：10.1021/ol035264f

  日期：2003.9.1

  [reaction: see text] Protection of the amino group of adenine and guanine nucleosides was effected by heating the substrates in 2,5-hexanedione. The resulting 2,5-dimethylpyrrole adducts were stable toward bases but were hydrolyzed with TFA/H(2)O to regenerate the amino function.

  [反应：见正文]通过在2，5-己二酮中加热底物来实现对腺嘌呤和鸟嘌呤核苷氨基的保护。所得的2，5-二甲基吡咯加合物对碱稳定，但可与TFA / H（2）O水解以再生氨基功能。
• Reversed Cation Selectivity of G ₈ ‐Octamer and G ₁₆ ‐Hexadecamer towards Monovalent and Divalent Cations
  作者：Ying He、Yanbin Zhang、Lukasz Wojtas、Novruz G. Akhmedov、Qinhe Pan、Hao Guo、Xiaodong Shi

  DOI：10.1002/asia.202000016

  日期：2020.4

  monovalent and divalent cations was observed for two different self-assembly G16-hexadecamer and G8-octamer systems. The dissociation constant between G4-quadruplex and monomer was calculated via VT-1H NMR experiments. Quantitative energy profiles revealed entropy as the key factor for the weaker binding toward Ba2+ compared with K+ in the G8-octamer system despite stronger ion-dipole interactions. This study

  对于两种不同的自组装 G16-十六聚体和 G8-八聚体系统，观察到单价和二价阳离子之间的反向结合选择性。通过 VT-1H NMR 实验计算 G4-四链体和单体之间的解离常数。定量能量分布揭示，尽管离子偶极相互作用更强，但与 G8 八聚体系统中的 K+ 相比，熵是与 Ba2+ 结合较弱的关键因素。这项研究是首次直接比较单价和二价阳离子之间的 G4-四联体结合亲和力，并将有利于 G-四联体相关研究的未来应用。G8-octamer 和 18-crown-6 与 K+ 之间的进一步竞争实验证明了该 G8 系统作为新钾受体的潜力。
• Toward Artificial Ion Channels:  A Lipophilic G-Quadruplex
  作者：Scott L. Forman、James C. Fettinger、Silvia Pieraccini、Giovanni Gottarelli、Jeffery T. Davis

  DOI：10.1021/ja9925148

  日期：2000.5.1

  Single crystals of a lipophilic G-quadruplex formed by 5‘-tert-butyl-dimethylsilyl-2‘,3‘,-di-O-isopropylidene G 2 were obtained from a CH3CN solution containing potassium picrate and cesium picrate. The X-ray structure showed that 16 units of G 2 and 4 equiv of alkali picrate form the lipophilic G-quadruplex. The quadruplex has a filled cation channel, with three K+ ions and one Cs+ ion located along

  从含有苦味酸钾和苦味酸铯的 CH3CN 溶液中获得由 5'-叔丁基-二甲基甲硅烷基-2'，3'，-二-O-异亚丙基 G 2 形成的亲脂性 G-四链体的单晶。X 射线结构显示 16 个单位的 G 2 和 4 当量的碱性苦味酸盐形成亲脂性 G-四链体。四链体有一个填充的阳离子通道，三个 K+ 离子和一个 Cs+ 离子位于其中心轴上。四链体由一对头尾相连的 (G 2)8-K+ 八聚体形成。两种八聚体都使用八个羰基氧来配位 K+。两个 (G 2)8-K+ 八聚体极性相反，以头对头方向同轴堆叠。Cs+ 阳离子具有不寻常的配位几何形状，覆盖了阳离子通道。Cs+ 以 η2 方式与四个乙腈溶剂分子配位。在八聚体中，两个四聚体堆叠在一起，相距 3.3 A 并扭曲 30°。第二个堆叠相互作用由两个 (G 2)8-K+ 八聚体之间的头对头排列定义...
• Selective ²²⁶Ra²⁺ Ionophores Provided by Self-Assembly of Guanosine and Isoguanosine Derivatives
  作者：Fijs W. B. van Leeuwen、Willem Verboom、Xiaodong Shi、Jeffery T. Davis、David N. Reinhoudt

  DOI：10.1021/ja0455650

  日期：2004.12.1

  226Ra2+ extraction even at a 0.35 x 10(6) fold excess of Na+, K+, Rb+, Cs+, Mg2+, or Ca2+ (10(-2) M) to 226Ra2+ (2.9 x 10(-8) M) and at a 100-fold salt to ionophore excess. In the case of the G 1-picrate assembly, more competition was observed from Sr2+ and Ba2+, as extraction of 226Ra2+ ceased at an M2+/226Ra2+ ratio of 10(6) and 10(4), respectively. With the isoG 2 assembly, 226Ra2+ extraction also occurred

  自组装鸟苷 (G 1) 基十六聚体和异鸟苷 (isoG 2) 基十聚体即使在存在过量碱（Na+、K+、Rb+ 和 Cs+）和碱土（Mg2+、Ca2+）的情况下也是出色的 226Ra2+ 选择性离子载体、Sr2+ 和 Ba2+) 阳离子，pH 范围为 3-11。G 1 需要额外的苦味酸阴离子以提供中性组装，而 isoG 2 组装提取 226Ra2+ 阳离子而无需任何此类添加剂。G 1-苦味酸盐和 isoG 2 组件均显示 226Ra2+ 提取，即使 Na+、K+、Rb+、Cs+、Mg2+ 或 Ca2+ (10(-2) M) 至 226Ra2+ (2.9 x 10 (-8) M) 和离子载体过量的 100 倍盐。在 G 1-苦味酸盐组件的情况下，从 Sr2+ 和 Ba2+ 观察到更多的竞争，因为 226Ra2+ 的提取在 M2+/226Ra2+ 比率分别为 10(6) 和 10(4) 时停止。使用
• Direct Experimental Observation of the Effect of the Base Pairing on the Oxidation Potential of Guanine
  作者：Tonino Caruso、Maurizio Carotenuto、Ermanno Vasca、Andrea Peluso

  DOI：10.1021/ja055130s

  日期：2005.11.1

  The effect of complementary base pairing on the oxidation potential of a guanosine derivative has been determined by cyclic and differential pulse voltammetry in CHCl3. The formation of the Watson-Crick H-bonded complex lowers the oxidation potential of the free molecule by 0.34 V, which compares well with the value obtained by DFT/B3LYP/6-311++g** computations.