2-[(2R,5S)-4-benzyl-5-[[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]methyl]-3,6-dioxopiperazin-2-yl]acetic acid | 1389331-88-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 2-[(2R,5S)-4-benzyl-5-[[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]methyl]-3,6-dioxopiperazin-2-yl]acetic acid
• CAS: 1389331-88-7
• 化学式: C₁₉H₂₅N₃O₆
• 分子量: 391.424
• InChiKey: HYDJUDPRAOKHQE-KGLIPLIRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  125
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-[(2R,5S)-4-benzyl-5-[[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]methyl]-3,6-dioxopiperazin-2-yl]acetic acid 在 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 20.0 ℃ 、100.0 kPa 条件下， 反应 3.0h， 生成 N2-(2-((2R,5S)-5-(((S)-2-amino-4-(tert-butoxy)-4-oxobutanamido)methyl)-4-benzyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl)acetyl)-Nw-((4-methoxy-2,3,6-trimethylphenyl)sulfonyl)-L-arginylglycine
  参考文献：
  名称：

  包含新型双功能整合素配体的双功能二酮哌嗪支架的环状RGD拟肽。

  摘要：

  描述了八个双功能二酮哌嗪（DKP）支架的合成。它们正式衍生自2,3-二氨基丙酸和天冬氨酸（DKP - 1 – DKP - 7）或谷氨酸（DKP - 8），具有胺和羧酸官能团。支架在两个立体中心的构型和在二酮哌嗪氮原子上的取代不同。将双功能二酮哌嗪引入了八个具有Arg-Gly-Asp（RGD）序列的环状拟肽中。将所得的肽模拟RGD筛选的能力抑制生物素化的玻连蛋白结合到纯化的整α v β3和α v β 5，其参与肿瘤血管生成。从反式DKP支架（DKP ‐ 2 – DKP ‐ 8）衍生的RGD拟肽获得了纳摩尔IC 50值。通过水溶液中的1 H NMR光谱实验（VT-NMR和NOESY光谱）和Monte Carlo /随机动力学（MC / SD）模拟对环状RGD拟肽进行构象研究，结果表明，亲和力最高的配体具有分子内明确定义的优选构象氢键转弯基序和RGD序列的扩展排列[Cβ（Arg）Cβ（Asp）平均距离≥8

  DOI：

  10.1002/chem.201200457
• 作为产物：
  描述：

  L-N-苄基丝氨酸甲酯 在 四氢吡咯 、 4-二甲氨基吡啶 、 四(三苯基膦)钯 、 迭氮酸 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 、 三甲基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 异丙醇 、 甲苯 为溶剂， 反应 35.5h， 生成 2-[(2R,5S)-4-benzyl-5-[[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]methyl]-3,6-dioxopiperazin-2-yl]acetic acid
  参考文献：
  名称：

  包含新型双功能整合素配体的双功能二酮哌嗪支架的环状RGD拟肽。

  摘要：

  描述了八个双功能二酮哌嗪（DKP）支架的合成。它们正式衍生自2,3-二氨基丙酸和天冬氨酸（DKP - 1 – DKP - 7）或谷氨酸（DKP - 8），具有胺和羧酸官能团。支架在两个立体中心的构型和在二酮哌嗪氮原子上的取代不同。将双功能二酮哌嗪引入了八个具有Arg-Gly-Asp（RGD）序列的环状拟肽中。将所得的肽模拟RGD筛选的能力抑制生物素化的玻连蛋白结合到纯化的整α v β3和α v β 5，其参与肿瘤血管生成。从反式DKP支架（DKP ‐ 2 – DKP ‐ 8）衍生的RGD拟肽获得了纳摩尔IC 50值。通过水溶液中的1 H NMR光谱实验（VT-NMR和NOESY光谱）和Monte Carlo /随机动力学（MC / SD）模拟对环状RGD拟肽进行构象研究，结果表明，亲和力最高的配体具有分子内明确定义的优选构象氢键转弯基序和RGD序列的扩展排列[Cβ（Arg）Cβ（Asp）平均距离≥8

  DOI：

  10.1002/chem.201200457

文献信息

• Neutrophil Elastase Promotes Linker Cleavage and Paclitaxel Release from an Integrin-Targeted Conjugate
  作者：André Raposo Moreira Dias、Arianna Pina、Amelia Dean、Hans-Georg Lerchen、Michele Caruso、Fabio Gasparri、Ivan Fraietta、Sonia Troiani、Daniela Arosio、Laura Belvisi、Luca Pignataro、Alberto Dal Corso、Cesare Gennari

  DOI：10.1002/chem.201805447

  日期：2019.2.1

  enzymes, to promote the activation of an anticancer drug at the tumor site. The peptidomimetic integrin ligand cyclo(DKP-RGD) was found to accumulate on the surface of αv β3 integrin-expressing human renal cell carcinoma 786-O cells. The ligand was conjugated to the anticancer drug paclitaxel through a Asn-Pro-Val (NPV) tripeptide linker, which is a substrate of neutrophil-secreted elastase. In vitro

  这项工作利用了癌症的特征之一，即免疫系统肿瘤浸润细胞和白细胞分泌酶的存在，以促进肿瘤部位抗癌药物的激活。发现拟肽整合素配体环（DKP-RGD）积聚在表达αv β3整合素的人肾细胞癌786-O细胞的表面。该配体通过 Asn-Pro-Val (NPV) 三肽接头（中性粒细胞分泌的弹性蛋白酶的底物）与抗癌药物紫杉醇缀合。体外接头裂解测定和细胞抗增殖实验证明了这种肿瘤靶向缀合物的功效，为潜在的治疗应用开辟了道路。
• Cyclic RGD Peptidomimetics Containing Bifunctional Diketopiperazine Scaffolds as New Potent Integrin Ligands
  作者：Mattia Marchini、Michele Mingozzi、Raffaele Colombo、Ileana Guzzetti、Laura Belvisi、Francesca Vasile、Donatella Potenza、Umberto Piarulli、Daniela Arosio、Cesare Gennari

  DOI：10.1002/chem.201200457

  日期：2012.5.14

  introduced into eight cyclic peptidomimetics containing the Arg‐Gly‐Asp (RGD) sequence. The resulting RGD peptidomimetics were screened for their ability to inhibit biotinylated vitronectin binding to the purified integrins αvβ3 and αvβ5, which are involved in tumor angiogenesis. Nanomolar IC50 values were obtained for the RGD peptidomimetics derived from trans DKP scaffolds (DKP‐2–DKP‐8). Conformational

  描述了八个双功能二酮哌嗪（DKP）支架的合成。它们正式衍生自2,3-二氨基丙酸和天冬氨酸（DKP - 1 – DKP - 7）或谷氨酸（DKP - 8），具有胺和羧酸官能团。支架在两个立体中心的构型和在二酮哌嗪氮原子上的取代不同。将双功能二酮哌嗪引入了八个具有Arg-Gly-Asp（RGD）序列的环状拟肽中。将所得的肽模拟RGD筛选的能力抑制生物素化的玻连蛋白结合到纯化的整α v β3和α v β 5，其参与肿瘤血管生成。从反式DKP支架（DKP ‐ 2 – DKP ‐ 8）衍生的RGD拟肽获得了纳摩尔IC 50值。通过水溶液中的1 H NMR光谱实验（VT-NMR和NOESY光谱）和Monte Carlo /随机动力学（MC / SD）模拟对环状RGD拟肽进行构象研究，结果表明，亲和力最高的配体具有分子内明确定义的优选构象氢键转弯基序和RGD序列的扩展排列[Cβ（Arg）Cβ（Asp）平均距离≥8