tubulysin D | 309935-57-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: tubulysin D
• 英文别名: (2S,4R)-4-[[2-[(1R,3R)-1-acetyloxy-4-methyl-3-[3-methylbutanoyloxymethyl-[(2S,3S)-3-methyl-2-[[(2R)-1-methylpiperidine-2-carbonyl]amino]pentanoyl]amino]pentyl]-1,3-thiazole-4-carbonyl]amino]-2-methyl-5-phenylpentanoic acid
• CAS: 309935-57-7
• 化学式: C₄₃H₆₅N₅O₉S
• 分子量: 828.083
• InChiKey: SAJNCFZAPSBQTQ-HZZFHOQESA-N

物化性质

• 熔点：
  79-80 °C
• 沸点：
  950.5±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.170±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  溶于二甲基亚砜

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  58
• 可旋转键数：
  24
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  213
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  12

制备方法与用途

生物活性

Tubulysin D 是从粘细菌 Archangium geophyra 和 Angiococcus disciformis 中分离出的微管溶素中最有效的衍生物。它是一种新型四肽，通过抑制微管蛋白聚合显示出有效的抗肿瘤活性，并导致细胞周期停滞和凋亡，其 IC50 值为 1.7 μM。在哺乳动物细胞中，Tubulysin D 显示出极其高效的细胞毒性作用，包括多药耐药细胞系。

靶点

• IC50: 1.7 μM (微管)

体外研究

• Tubulysin D 对 HL60、HCT116、MCF7 和 A549 细胞系的抗增殖作用具有以下 IC50 值：4.7 pM、3.1 pM、670 pM 和 13 pM。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tubulysin D 在 盐酸 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以67%的产率得到(2S,4R)-4-[[2-[(1R,3R)-1-acetyloxy-3-[methoxymethyl-[(2S,3S)-3-methyl-2-[[(2R)-1-methylpiperidine-2-carbonyl]amino]pentanoyl]amino]-4-methylpentyl]-1,3-thiazole-4-carbonyl]amino]-2-methyl-5-phenylpentanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Antiproliferative compounds, conjugates thereof, methods therefor, and uses thereof

  摘要：

  具有由式(II)表示的结构的抗增殖化合物，其中n、R1、R2、R3、R4和R5如本文所定义，可用于治疗肿瘤，优选地当与配体（如抗体）偶联时使用。

  公开号：

  US09226974B2
• 作为产物：
  描述：

  (2R)-1-甲基-2-哌啶甲酸 在 palladium on activated charcoal 吡啶 、 氢气 、 溶剂黄146 、 达卡巴嗪 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三甲基氢氧化锡 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 、 1,2-二氯乙烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 178.0h， 生成 tubulysin D
  参考文献：
  名称：

  微管溶素 D 的全合成

  摘要：

  报道了微管溶素 D 的首次全合成。新的叔丁烷亚磺酰胺方法的开发和应用使得 tubuvaline 和 tubuphenylalanine 片段的快速合成成为可能。最重要的是，设计并实施了一条路线来引入和推进高度不稳定的 N,O-缩醛功能。Tubulysin D 是 tubulysin 家族中最活跃的成员，本文所述的有效合成路线将允许类似物的快速合成来探测这类重要天然产物的生物活性。

  DOI：

  10.1021/ja067177z

文献信息

• Expedient Synthesis of <i>N</i>-Methyl Tubulysin Analogues with High Cytotoxicity
  作者：Andrew W. Patterson、Hillary M. Peltier、Jonathan A. Ellman

  DOI：10.1021/jo800384x

  日期：2008.6.1

  protection of the tubuvaline alcohol by implementing a unique N-methylation strategy via formation and reduction of a 1,3-tetrahydrooxazine heterocycle. Acylation of the hindered N-methyl tubuvaline amine utilizes a novel sequence of O-acylation followed by an O- to N-acyl transfer to form the hindered amide bond between N-methyl tubuvaline and isoleucine. This high-yielding synthesis should enable the production

  一种有效的，具有生物活性的N-甲基微管溶素类似物2和4的优化高效合成已实现，总收率> 40％。与先前报道的这些和相关微管溶素类似物的合成相比，该合成代表了显着的改进。非天然氨基酸微管蛋白的立体选择性合成是使用叔丁烷亚磺酰胺化学来完成的。通过形成和还原1，3-四氢恶嗪杂环实施独特的N-甲基化策略，进行N-烷基化反应以形成N-甲基tubuvaline，而无需保护tubuvaline醇。酰化受阻氮-甲基tubuvaline胺利用O-酰化的新序列，随后进行O-至N-酰基转移，以形成N-甲基tubuvaline与异亮氨酸之间的受阻酰胺键。这种高产的合成应能够生产大量用于生物学研究的材料。
• Total Syntheses of Tubulysins
  作者：Taku Shibue、Toshihiro Hirai、Iwao Okamoto、Nobuyoshi Morita、Hyuma Masu、Isao Azumaya、Osamu Tamura

  DOI：10.1002/chem.201000963

  日期：——

  (S)‐4‐isopropyl‐3‐propionyl‐2‐oxazolidinone with N‐protected phenylalaninal and a subsequent Barton deoxygenation protocol. We accomplished the total syntheses of tubulysins U (1 c) and V (1 d) by using these methodologies, in which the isoxazolidine ring was used as the effective protective group for γ‐amido alcohol functionality. Furthermore, to understand the structure‐activity relationship of tubulysins

  描述了作为强效微管蛋白聚合抑制剂的四肽微管蛋白溶素D（1b），U（1 c）和V（1 d）的总合成。Tuv（2）的合成是微管蛋白的一种不常见的氨基酸组成，包括衍生自D-古洛糖的手性硝酮D - 6与N-丙烯酰基樟脑（s）9的1,3-偶极环加成反应，采用双不对称诱导，而另一种不常见的氨基酸Tup（20）的合成涉及由（S）生成的（Z）-硼烯醇盐的立体选择性Evans aldol反应）带有N保护的苯丙氨酸的4-异丙基-3-丙酰基-2-恶唑烷酮和随后的Barton脱氧方案。通过使用这些方法，我们完成了微管溶素U（1 c）和V（1 d）的总合成，其中异恶唑烷环用作γ-氨基醇官能团的有效保护基。此外，为了了解微管溶素的结构-活性关系，我们合成了微管蛋白抑制剂d（图1b）和环-微管蛋白抑制剂d（图1e）由2 -Me和20，和ENT -tubulysin d（ENT - 1 d）从ENT - 2个‐Me和ent
• BIOACTIVE PRE-TUBULYSINS AND USE THEREOF
  申请人：Chai Yi

  公开号：US20110245295A1

  公开（公告）日：2011-10-06

  The invention relates to bioactive pre-tubulysin derivatives, their preparation and pharmacological use.

  这项发明涉及生物活性的前图布林衍生物，其制备和药理用途。
• [EN] BIOACTIVE PRE-TUBULYSINS AND USE THEREOF<br/>[FR] PRÉ-TUBULYSINES BIOACTIVES ET LEUR UTILISATION
  申请人：UNIV SAARLAND

  公开号：WO2010034724A1

  公开（公告）日：2010-04-01

  The invention relates to bioactive pre-tubulysin derivatives, their preparation and pharmacological use.

  该发明涉及生物活性的前土霉素衍生物，其制备和药理学用途。
• Tubulysin D Analogues
  申请人：Ellman Jonathan A.

  公开号：US20110263650A1

  公开（公告）日：2011-10-27

  The present invention provides novel tubulysin analogues, methods of making and methods of using such analogues and conjugates thereof. The essential features for the potent cytotoxicity of tubulysin D have been established for the first time by the synthesis and evaluation of a series of analogues. By identifying functionality that surprisingly is not necessary for activity, highly potent cell-growth inhibitors have been developed that are smaller and considerably more stable than tubulysin D.

  本发明提供了新型的管芽菌素类似物，以及制备和使用这些类似物及其共轭物的方法。通过合成和评估一系列类似物，首次确定了管芽菌素D的强效细胞毒性的基本特征。通过确定出令人惊讶的不必要的活性功能，开发出了比管芽菌素D更小、更稳定的高效细胞生长抑制剂。