EPZ5676 | 1380288-87-8

• 物质功能分类: 生物化工 - 抑制剂 - 表观遗传学(Epigenetics)
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: EPZ5676
• 英文别名: Pinometostat；(2R,3R,4S,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[[3-[2-(6-tert-butyl-1H-benzimidazol-2-yl)ethyl]cyclobutyl]-propan-2-ylamino]methyl]oxolane-3,4-diol
• CAS: 1380288-87-8；1380288-88-9
• 化学式: C₃₀H₄₂N₈O₃
• 分子量: 562.715
• InChiKey: LXFOLMYKSYSZQS-XKHGBIBOSA-N

物化性质

• 沸点：
  835.3±75.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.45±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  DMSO 中≥28.15 mg/mL；不溶于水； ≥50.3 mg/mL，乙醇溶液，超声波

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.3
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  151
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

制备方法与用途

生物活性

Pinometostat (EPZ5676) 是一种蛋白甲基转移酶 DOT1L 的 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 竞争性抑制剂，在无细胞试验中，其 Ki 值为 80 pM，并且比作用于所有其他测试的 PMTs 选择性高37,000倍以上。它能有效抑制肿瘤中的 H3K79 甲基化。Phase 1。

体外研究

EPZ-5676 减少了 MV4-11 细胞中 H3K79 双甲基化的水平，其 IC50 值为 2.6 nM。药物浓度和时间依赖性地降低了 H3K79 的甲基化程度，并且对其他组蛋白位点没有影响。这种作用导致在 MLL 重排的白血病细胞中关键靶基因 MLH 表达被抑制，从而选择性地诱导细胞凋亡。EPZ-5676 抑制了 MLL-AF4 重新排列细胞系 MV4-11 的增殖，其 IC50 值为 9 nM。

体内研究

在 MLL 重排的白血病异种移植模型中，连续静脉滴注 EPZ-5676 21 天后表现出剂量依赖性的抗肿瘤活性。最高剂量为 70.5 毫克/公斤/天时，肿瘤完全消退，治疗停止后长达 32 天没有观察到肿瘤再生长。在大鼠中进行的 EPZ-5676 治疗未发现显著体重减轻或明显毒性反应。

靶点

Target	Value
DOT1L (Cell-free assay)	80 pM (Ki)

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  EPZ5676 在 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 3.0h， 以26%的产率得到(1s,3r)-N-(((2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl)-3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)-N-isopropylcyclobutanamine oxide
  参考文献：
  名称：

  [EN] SUBSTITUTED PURINE AND 7 - DEAZAPURINE COMPOUNDS AS MODULATORS OF EPIGENETIC ENZYMES
  [FR] COMPOSÉS PURINES ET 7-DÉAZAPURINES SUBSTITUÉES EN TANT QUE MODULATEURS D'ENZYMES ÉPIGÉNIQUES

  摘要：

  本发明涉及替代嘌呤和7-去氮嘌呤化合物。本发明还涉及含有这些化合物的药物组合物以及通过向需要的受试者施用这些化合物和药物组合物来治疗DOT1介导的蛋白甲基化在内的疾病的方法，例如癌症和神经系统疾病。

  公开号：

  WO2012075381A1
• 作为产物：
  描述：

  3-氧代环丁烷甲酸甲酯 在 palladium 10% on activated carbon 、 palladium on activated charcoal titanium(IV) isopropylate 、 盐酸 、 甲醇 、 lithium hydroxide monohydrate 、 氢气 、 二异丁基氢化铝 、 potassium carbonate 、 1-羟基苯并三唑 、 溶剂黄146 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 lithium chloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 二氧化碳 、 乙腈 为溶剂， 反应 5.67h， 生成 EPZ5676
  参考文献：
  名称：

  [EN] SUBSTITUTED PURINE AND 7 - DEAZAPURINE COMPOUNDS AS MODULATORS OF EPIGENETIC ENZYMES
  [FR] COMPOSÉS PURINES ET 7-DÉAZAPURINES SUBSTITUÉES EN TANT QUE MODULATEURS D'ENZYMES ÉPIGÉNIQUES

  摘要：

  本发明涉及替代嘌呤和7-去氮嘌呤化合物。本发明还涉及含有这些化合物的药物组合物以及通过向需要的受试者施用这些化合物和药物组合物来治疗DOT1介导的蛋白甲基化在内的疾病的方法，例如癌症和神经系统疾病。

  公开号：

  WO2012075381A1

文献信息

• 5’-脱氧-5’-异丙基取代氨基核苷类化合物、 其制备方法和用途
  申请人：中国科学院上海药物研究所

  公开号：CN109748944B

  公开（公告）日：2021-12-10

  本发明公开了通式7所示的5’‑脱氧‑5’‑异丙基取代氨基核苷类化合物，该类化合物7的制备方法，以及该类化合物7作为中间体在制备5’‑脱氧‑5’‑多取代氨基核苷类化合物1中的应用。
• ANTIPROLIFERATIVE COMPOUNDS AND SECOND ACTIVE AGENTS FOR COMBINED USE
  申请人：Celgene Corporation

  公开号：US20200215060A1

  公开（公告）日：2020-07-09

  Provided herein are methods of using 4-(4-(4-(((2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1-oxoisoindolin-4-yl)oxy)methyl)benzyl)piperazin-1-yl)-3-fluorobenzonitrile, or an enantiomer, a mixture of enantiomers, a tautomer, or a pharmaceutically acceptable salt thereof, in combination with a second active agent for treating, preventing or managing multiple myeloma. The second active agent is one or more of a BTK inhibitor, an mTOR inhibitor, a PIM inhibitor, an IGF-1R inhibitor, an MEK inhibitor, an XPO1 inhibitor, a DOT1L inhibitor, an EZH2 inhibitor, a JAK2 inhibitor, a BRD4 inhibitor, a PLK 1 inhibitor, an NEK2 inhibitor, an AURKB inhibitor, a BIRC5 inhibitor, a BET inhibitor, or a DNA methyltransferase inhibitor.

  本文提供了使用4-(4-(4-(((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1-氧代异吲哚啉-4-基)氧基)甲基)苄基)哌嗪-1-基)-3-氟苯甲腈，或其对映体、对映体混合物、互变异构体或其药学上可接受的盐，与第二活性剂结合用于治疗、预防或管理多发性骨髓瘤的方法。第二活性剂是BTK抑制剂、mTOR抑制剂、PIM抑制剂、IGF-1R抑制剂、MEK抑制剂、XPO1抑制剂、DOT1L抑制剂、EZH2抑制剂、JAK2抑制剂、BRD4抑制剂、PLK1抑制剂、NEK2抑制剂、AURKB抑制剂、BIRC5抑制剂、BET抑制剂或DNA甲基转移酶抑制剂中的一个或多个。
• Substituted Purine And 7-Deazapurine Compounds
  申请人：Olhava Edward J.

  公开号：US20120142625A1

  公开（公告）日：2012-06-07

  The present invention relates to substituted purine and 7-deazapurine compounds. The present invention also relates to pharmaceutical compositions containing these compounds and methods of treating disorders in which DOT1-mediated protein methylation plays a part, such as cancer and neurological disorders, by administering these compounds and pharmaceutical compositions to subjects in need thereof.

  本发明涉及取代嘌呤和7-脱氮嘌呤化合物。本发明还涉及包含这些化合物的药物组合物，以及通过向需要这些化合物和药物组合物的受试者施用这些化合物和药物组合物来治疗DOT1介导的蛋白质甲基化参与的疾病，例如癌症和神经系统疾病的方法。
• Substituted Purine and 7-Deazapurine Compounds
  申请人：Epizyme, Inc.

  公开号：US20140051654A1

  公开（公告）日：2014-02-20

  The present invention relates to substituted purine and 7-deazapurine compounds. The present invention also relates to pharmaceutical compositions containing these compounds and methods of treating disorders in which DOT1-mediated protein methylation plays a part, such as cancer and neurological disorders, by administering these compounds and pharmaceutical compositions to subjects in need thereof.

  本发明涉及取代嘌呤和7-去氮嘌呤化合物。本发明还涉及含有这些化合物的药物组合物以及通过向需要这些化合物和药物组合物的受试者施用这些化合物和药物组合物来治疗DOT1介导的蛋白质甲基化参与的疾病，例如癌症和神经系统疾病的方法。
• Methods of Synthesizing Substituted Purine Compounds
  申请人：EPIZYME, INC.

  公开号：US20150011495A1

  公开（公告）日：2015-01-08

  The present invention provides an efficient process for the synthesis of (2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutyl)(isopropyl)amino)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol and hydrates thereof and methods for treating disorders in which DOT1-mediated protein methylation plays a part, such as cancer and neurological disorders, by administering these compounds and pharmaceutical compositions to subjects in need thereof. The present invention also provides novel crystalline forms of (2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutyl)(isopropyl)amino)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol and hydrates thereof (Form A, Form B, and Form C), characterized by a unique X-ray diffraction pattern and Differential Scanning Calorimetry profile, as well as a unique crystalline structure.

  本发明提供了一种有效的合成过程，用于合成(2R,3R,4S,5R)-2-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(叔丁基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)乙基)环丁基)(异丙基)氨基)甲基)四氢呋喃-3,4-二醇及其水合物，并通过向需要治疗DOT1介导的蛋白质甲基化在内的疾病的受试者投与这些化合物和制药组合物来治疗这些疾病，例如癌症和神经系统疾病。本发明还提供了(2R,3R,4S,5R)-2-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(叔丁基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)乙基)环丁基)(异丙基)氨基)甲基)四氢呋喃-3,4-二醇及其水合物的新型晶体形式(Form A、Form B和Form C)，其具有独特的X射线衍射图案和差示扫描量热分析曲线，以及独特的晶体结构。