6-amino-5-nitro-4-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosylamino)pyrimidine | 183004-17-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 6-amino-5-nitro-4-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosylamino)pyrimidine
• 英文别名: 5-(6-amino-5-nitropyrimidin-4-ylamino)-2-hydroxymethyltetrahydrofuran-3-ol；(2R,3S,5R)-5-[(6-amino-5-nitropyrimidin-4-yl)amino]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 183004-17-3
• 化学式: C₉H₁₃N₅O₅
• 分子量: 271.233
• InChiKey: BTTVTTZXZFODOY-KVQBGUIXSA-N

物化性质

• 沸点：
  654.4±55.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.686±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.6
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  159
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-amino-5-nitro-4-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosylamino)pyrimidine 在 磷酸三乙酯 、 三丁基焦磷酸铵 、 三氯氧磷 作用下， 生成 6-amino-5-nitro-4-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosylamino)pyrimidine 5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  Molecular Diversity and Libraries of Structures: Synthesis and Screening

  摘要：

  图书馆或分子多样性方法是当代生物相互作用和药物发现研究中的一种先进工具。所有图书馆方法都包含一定程度的合理性，因此不能被归类为随机或非理性技术。回顾的技术是所谓的“理性设计”的补充；它们既可以作为生成引导的工具，也可以通过快速评估结构活性关系来优化“设计”的引导。组合方法基于随机或多重原理，可以生产大量不同的分子结构，这些结构可以同时在生物测定中进行筛选和评估，以找到最优的相互作用分子。

  DOI：

  10.1135/cccc19960171
• 作为产物：
  描述：

  1-Α-氯-3,5-二-O-对甲苯甲酰基-2-脱氧-D-呋喃核糖 在 苯磺酰胺 、 sodium methylate 、 四氯化锡 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 6-amino-5-nitro-4-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosylamino)pyrimidine
  参考文献：
  名称：

  Molecular Diversity and Libraries of Structures: Synthesis and Screening

  摘要：

  图书馆或分子多样性方法是当代生物相互作用和药物发现研究中的一种先进工具。所有图书馆方法都包含一定程度的合理性，因此不能被归类为随机或非理性技术。回顾的技术是所谓的“理性设计”的补充；它们既可以作为生成引导的工具，也可以通过快速评估结构活性关系来优化“设计”的引导。组合方法基于随机或多重原理，可以生产大量不同的分子结构，这些结构可以同时在生物测定中进行筛选和评估，以找到最优的相互作用分子。

  DOI：

  10.1135/cccc19960171

文献信息

• Synthesis and Characterization of Oligodeoxynucleotides Containing Formamidopyrimidine Lesions and Nonhydrolyzable Analogues
  作者：Kazuhiro Haraguchi、Michael O. Delaney、Carissa J. Wiederholt、Aruna Sambandam、Zsolt Hantosi、Marc M. Greenberg

  DOI：10.1021/ja012135q

  日期：2002.4.1

  the nucleotide proper base-pairing partner. However, duplexes containing Fapy.dG-dA mispairs melt significantly higher than those comprised of dG-dA. All duplexes containing Fapy.dA-dX or its C-nucleoside analogue melt lower than the respective complexes containing dA-dX. Studies of the alkaline lability of oligodeoxynucleotides containing formamidopyrimidine lesions indicate that Fapy.dA is readily

  通过固相合成和在某些情况下酶促连接制备在特定位点含有甲酰氨基嘧啶损伤和 C-核苷类似物的寡聚脱氧核苷酸。甲酰胺嘧啶损伤作为二核苷酸引入，以防止重排为其吡喃糖异构体。通过使用各自的亚磷酰胺引入包含 Fapy.dA 的 C-核苷类似物的单一非对映异构体的寡脱氧核苷酸。当与核苷酸正确的碱基配对伙伴相对时，甲酰胺嘧啶病变会降低十二聚体相对于其未修饰核苷酸对应物的 T(M)。然而，含有 Fapy.dG-dA 错误配对的双链体比由 dG-dA 组成的双链体熔解度显着更高。含有 Fapy.dA-dX 或其 C-核苷类似物的所有双链体的熔解低于含有 dA-dX 的相应复合物。
• Molecular Diversity and Libraries of Structures: Synthesis and Screening
  作者：Markéta Rinnová、Michal Lebl

  DOI：10.1135/cccc19960171

  日期：——

  Library, or molecular diversity, approaches are a progressive tool in contemporary investigation of biological interactions and drug discovery. All library approaches include certain degree of rationality and cannot be therefore classified as random or irrational techniques. Reviewed techniques are complementary to so called "rational design"; they can serve either as a tool to generate a lead, or, on the other hand, to optimize a "designed" lead by rapid evaluation of structure-activity relationships. Combinatorial approaches are based on either a random or multiple principle which enables production of large number of diverse molecular structures that can be simultaneously screened and evaluated in a biological assay to find an optimal interacting molecule.

  图书馆或分子多样性方法是当代生物相互作用和药物发现研究中的一种先进工具。所有图书馆方法都包含一定程度的合理性，因此不能被归类为随机或非理性技术。回顾的技术是所谓的“理性设计”的补充；它们既可以作为生成引导的工具，也可以通过快速评估结构活性关系来优化“设计”的引导。组合方法基于随机或多重原理，可以生产大量不同的分子结构，这些结构可以同时在生物测定中进行筛选和评估，以找到最优的相互作用分子。
• Nucleoside compounds and their use for treating cancer and diseases associated with somatic mutations
  申请人：Wilde G. Richard

  公开号：US20080090774A1

  公开（公告）日：2008-04-17

  The invention encompasses nucleoside compounds, compositions comprising the compounds and methods for treating or preventing diseases associated with nonsense mutations of mRNA by administering these compounds or compositions.

  该发明涵盖了核苷酸化合物、包含这些化合物的组合物以及通过给予这些化合物或组合物治疗或预防与mRNA无意义突变相关的疾病的方法。
• METHODS FOR THE PRODUCTION OF FUNCTIONAL PROTEIN FROM DNA HAVING A NONSENSE MUTATION AND THE TREATMENT OF DISORDERS ASSOCICATED THEREWITH
  申请人：Almstead Neil G.

  公开号：US20110046136A1

  公开（公告）日：2011-02-24

  The present invention relates to functional proteins encoded by nucleic acid sequences comprising a nonsense mutation. The present invention also relates to methods for the production of functional proteins encoded by nucleic acid sequences comprising a nonsense mutation and the use of such proteins for prevention, management and/or treatment of diseases associated with a nonsense mutation(s) in a gene.

  本发明涉及由核酸序列编码的功能性蛋白质，其中包括一个无意义突变。本发明还涉及用于生产由包含无意义突变的核酸序列编码的功能性蛋白质的方法，以及利用这些蛋白质预防、管理和/或治疗与基因中的无意义突变相关的疾病。
• METHODS FOR THE PRODUCTION OF FUNCTIONAL PROTEIN FROM DNA HAVING A NONSENSE MUTATION AND THE TREATMENT OF DISORDERS ASSOCIATED THEREWITH
  申请人：PTC THERAPEUTICS, INC

  公开号：US20160199357A1

  公开（公告）日：2016-07-14

  The present invention relates to functional proteins encoded by nucleic acid sequences comprising a nonsense mutation. The present invention also relates to methods for the production of functional proteins encoded by nucleic acid sequences comprising a nonsense mutation and the use of such proteins for prevention, management and/or treatment of diseases associated with a nonsense mutation(s) in a gene.

  本发明涉及由包含无意义突变的核酸序列编码的功能蛋白质。本发明还涉及用于生产由包含无意义突变的核酸序列编码的功能蛋白质的方法，并使用这些蛋白质预防、管理和/或治疗与基因中的无意义突变相关的疾病。