[(2R,3S,5R)-2-[[[(2R,3S,5R)-2-(acetyloxymethyl)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(cyanomethylsulfanyl)phosphoryl]oxymethyl]-5-[6-(2,5-dichlorophenoxy)-2-(2-methylpropanoylamino)purin-9-yl]oxolan-3-yl] 4-oxopentanoate | 1053743-24-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: [(2R,3S,5R)-2-[[[(2R,3S,5R)-2-(acetyloxymethyl)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(cyanomethylsulfanyl)phosphoryl]oxymethyl]-5-[6-(2,5-dichlorophenoxy)-2-(2-methylpropanoylamino)purin-9-yl]oxolan-3-yl] 4-oxopentanoate
• CAS: 1053743-24-0
• 化学式: C₄₅H₄₆Cl₂N₉O₁₄PS
• 分子量: 1070.86
• InChiKey: SRBNFSVGQCLBLG-SSNPWHGESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  72
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  316
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2R,3S,5R)-2-[[[(2R,3S,5R)-2-(acetyloxymethyl)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(cyanomethylsulfanyl)phosphoryl]oxymethyl]-5-[6-(2,5-dichlorophenoxy)-2-(2-methylpropanoylamino)purin-9-yl]oxolan-3-yl] 4-oxopentanoate 在 syn-2-硝基苯甲醛肟[脱保护剂] 、 四甲基胍 、 ammonium hydroxide 、 Amberlite IR 120 (Na+ form) 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 、 水 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 deoxycytidylyl-(3',5')-guanosine sodium salt
  参考文献：
  名称：

  寡核苷酸硫代磷酸酯脱硫的方法

  摘要：

  通过两步法将受保护的寡核苷酸硫代磷酸酯转化为具有标准磷酸二酯核苷酸间键的寡核苷酸。然后通过氨解除去其余的保护基。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(03)00322-8
• 作为产物：
  描述：

  2'-deoxy-6-O-(2,5-dichlorophenyl)-2-N-isobutyryl-3'-O-levulinylguanosine 在 吡啶 、 二氯乙酸 、 吡咯 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 氯磷酸二苯酯 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 29.58h， 生成 [(2R,3S,5R)-2-[[[(2R,3S,5R)-2-(acetyloxymethyl)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(cyanomethylsulfanyl)phosphoryl]oxymethyl]-5-[6-(2,5-dichlorophenoxy)-2-(2-methylpropanoylamino)purin-9-yl]oxolan-3-yl] 4-oxopentanoate
  参考文献：
  名称：

  寡核苷酸硫代磷酸酯脱硫的方法

  摘要：

  通过两步法将受保护的寡核苷酸硫代磷酸酯转化为具有标准磷酸二酯核苷酸间键的寡核苷酸。然后通过氨解除去其余的保护基。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(03)00322-8

文献信息

• An approach to the desulfurization of oligonucleotide phosphorothioates
  作者：Colin B. Reese、Hongbin Yan

  DOI：10.1016/s0040-4039(03)00322-8

  日期：2003.3

  Protected oligonucleotide phosphorothioates are converted by a two-step procedure into oligonucleotides with standard phosphodiester internucleotide linkages. The remaining protecting groups are then removed by ammonolysis.

  通过两步法将受保护的寡核苷酸硫代磷酸酯转化为具有标准磷酸二酯核苷酸间键的寡核苷酸。然后通过氨解除去其余的保护基。