3-((2R,3R,4R,5R)-3,4-Dimethoxy-5-methoxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-7-methylsulfanyl-3H-8-thia-1,3,4,6-tetraaza-cyclopenta[a]indene | 437614-46-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 3-((2R,3R,4R,5R)-3,4-Dimethoxy-5-methoxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-7-methylsulfanyl-3H-8-thia-1,3,4,6-tetraaza-cyclopenta[a]indene
• 英文别名: 3-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-dimethoxy-5-(methoxymethyl)oxolan-2-yl]-9-methylsulfanyl-7-thia-3,5,10,12-tetrazatricyclo[6.4.0.02,6]dodeca-1(8),2(6),4,9,11-pentaene
• CAS: 437614-46-5
• 化学式: C₁₆H₂₀N₄O₄S₂
• 分子量: 396.491
• InChiKey: VSOWMLMEMKUEDP-LKGUXBDMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-((2R,3R,4R,5R)-3,4-Dimethoxy-5-methoxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-7-methylsulfanyl-3H-8-thia-1,3,4,6-tetraaza-cyclopenta[a]indene 在 氨 作用下， 以 正丁醇 为溶剂， 反应 90.0h， 以92%的产率得到3-((2R,3R,4R,5R)-3,4-Dimethoxy-5-methoxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-3H-8-thia-1,3,4,6-tetraaza-cyclopenta[a]inden-7-ylamine
  参考文献：
  名称：

  “弹性工具”。一类新型形状修饰的核苷的设计与合成（1）。

  摘要：

  引入了一类新的形状修饰的核苷。这些新颖的“挠性分子”具有腺嘌呤，肌苷和鸟苷的嘌呤环系统，分为各自的咪唑和嘧啶组分（如1-3所示）。这种结构修饰用于将柔韧性引入核苷，同时仍保留识别所必需的元素。结果，这些新颖的挠性基团应该被用作研究探针-辅酶结合位点以及核酸和蛋白质相互作用的生物探针。描述了它们的设计和综合。

  DOI：

  10.1021/jo0255476
• 作为产物：
  描述：

  5-Bromo-3-((2R,3R,4R,5R)-3,4-dimethoxy-5-methoxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-3H-imidazole-4-carbaldehyde 在 tetraphosphorus decasulfide 、 盐酸羟胺 、 sodium ethanolate 、 乙酸酐 、 碳酸氢钠 、 potassium carbonate 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 乙醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 53.25h， 生成 3-((2R,3R,4R,5R)-3,4-Dimethoxy-5-methoxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-7-methylsulfanyl-3H-8-thia-1,3,4,6-tetraaza-cyclopenta[a]indene
  参考文献：
  名称：

  “弹性工具”。一类新型形状修饰的核苷的设计与合成（1）。

  摘要：

  引入了一类新的形状修饰的核苷。这些新颖的“挠性分子”具有腺嘌呤，肌苷和鸟苷的嘌呤环系统，分为各自的咪唑和嘧啶组分（如1-3所示）。这种结构修饰用于将柔韧性引入核苷，同时仍保留识别所必需的元素。结果，这些新颖的挠性基团应该被用作研究探针-辅酶结合位点以及核酸和蛋白质相互作用的生物探针。描述了它们的设计和综合。

  DOI：

  10.1021/jo0255476

文献信息

• “Fleximers”. Design and Synthesis of a New Class of Novel Shape-Modified Nucleosides¹
  作者：Katherine L. Seley、Liang Zhang、Asmerom Hagos、Stephen Quirk

  DOI：10.1021/jo0255476

  日期：2002.5.1

  A new class of shape-modified nucleosides is introduced. These novel "fleximers" feature the purine ring systems of adenosine, inosine, and guanosine split into their individual imidazole and pyrimidine components (as in 1-3). This structural modification serves to introduce flexibility into the nucleoside while still retaining the elements essential for recognition. As a consequence, these novel fleximers

  引入了一类新的形状修饰的核苷。这些新颖的“挠性分子”具有腺嘌呤，肌苷和鸟苷的嘌呤环系统，分为各自的咪唑和嘧啶组分（如1-3所示）。这种结构修饰用于将柔韧性引入核苷，同时仍保留识别所必需的元素。结果，这些新颖的挠性基团应该被用作研究探针-辅酶结合位点以及核酸和蛋白质相互作用的生物探针。描述了它们的设计和综合。