((R)-1-Benzyl-2-{(S)-2-[2-(4-cyano-phenyl)-ethylcarbamoyl]-pyrrolidin-1-yl}-2-oxo-ethyl)-carbamic acid tert-butyl ester | 183595-83-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: ((R)-1-Benzyl-2-{(S)-2-[2-(4-cyano-phenyl)-ethylcarbamoyl]-pyrrolidin-1-yl}-2-oxo-ethyl)-carbamic acid tert-butyl ester
• CAS: 183595-83-7
• 化学式: C₂₈H₃₄N₄O₄
• 分子量: 490.602
• InChiKey: XIYFRXBRXVPOTA-RPWUZVMVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.34
• 重原子数：
  36.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  111.53
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ((R)-1-Benzyl-2-{(S)-2-[2-(4-cyano-phenyl)-ethylcarbamoyl]-pyrrolidin-1-yl}-2-oxo-ethyl)-carbamic acid tert-butyl ester 在 盐酸羟胺 、 乙酸酐 、 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 30.67h， 生成 tert-butyl N-[(2R)-1-[(2S)-2-[2-(4-carbamimidoylphenyl)ethylcarbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  设计、合成和评估一种新型的基于苯甲脒的 VEGF-C 与 Neuropilin-2 结合的抑制剂。

  摘要：

  神经纤毛蛋白 (Nrp) 家族的细胞表面受体具有关键的生理和病理功能。Nrp2 由于其参与肿瘤转移而受到特别关注。目前，靶向 Nrp 的肽和小分子抑制剂使用基于精氨酸的分子，由于高固有灵活性和与稳定性相关的问题，这些分子具有局限性。此外，没有已知的 Nrp2 特异性小分子抑制剂。最近的分子见解确定了 Nrp2 的 b1 结构域中的一个关键配体结合区域，负责结合其同源配体 VEGF-C 的 C 端。基于此，我们报告了一种新的基于苯甲脒的抑制剂的发现，该抑制剂通过竞争性抑制 VEGF-C 与 Nrp2 的结合发挥作用。更远，我们通过定义其构效关系 (SAR) 探索了抑制剂的功能和选择性，为这种基于苯甲脒的 Nrp2 抑制剂家族提供了有价值的见解。本研究为进一步开发竞争性靶向病理 Nrp2 功能的强效特异性小分子抑制剂提供了基础。

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2020.103856
• 作为产物：
  描述：

  BOC-L-脯氨酸 在 盐酸 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 35.34h， 生成 ((R)-1-Benzyl-2-{(S)-2-[2-(4-cyano-phenyl)-ethylcarbamoyl]-pyrrolidin-1-yl}-2-oxo-ethyl)-carbamic acid tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  设计、合成和评估一种新型的基于苯甲脒的 VEGF-C 与 Neuropilin-2 结合的抑制剂。

  摘要：

  神经纤毛蛋白 (Nrp) 家族的细胞表面受体具有关键的生理和病理功能。Nrp2 由于其参与肿瘤转移而受到特别关注。目前，靶向 Nrp 的肽和小分子抑制剂使用基于精氨酸的分子，由于高固有灵活性和与稳定性相关的问题，这些分子具有局限性。此外，没有已知的 Nrp2 特异性小分子抑制剂。最近的分子见解确定了 Nrp2 的 b1 结构域中的一个关键配体结合区域，负责结合其同源配体 VEGF-C 的 C 端。基于此，我们报告了一种新的基于苯甲脒的抑制剂的发现，该抑制剂通过竞争性抑制 VEGF-C 与 Nrp2 的结合发挥作用。更远，我们通过定义其构效关系 (SAR) 探索了抑制剂的功能和选择性，为这种基于苯甲脒的 Nrp2 抑制剂家族提供了有价值的见解。本研究为进一步开发竞争性靶向病理 Nrp2 功能的强效特异性小分子抑制剂提供了基础。

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2020.103856

文献信息

• D-Phe-Pro-p-Amidinobenzylamine: A potent and highly selective thrombin inhibitor
  作者：Michael R. Wiley、Nickolay Y. Chirgadze、David K. Clawson、Trelia J. Craft、Donetta S. Gifford-Moore、Noel D. Jones、Jennifer L. Olkowski、Leonard C. Weir、Gerald F. Smith

  DOI：10.1016/0960-894x(96)00442-8

  日期：1996.10

  The design, synthesis, and enzyme inhibitory profile of D-Phe-Pro-p-Amidinobenzylamine are presented. This compound has inhibitory activity equivalent to D-Phe-Pro-Arg-H, two orders of magnitude more potent than D-Phe-Pro-Agmatine, The results indicate that binding energy provided by the covalent bond of a transition-state analog can be replaced with noncovalent interactions. Copyright (C) 1996 Elsevier Science Ltd.