2-(4-(benzyloxy)-3-methoxyphenyl)-2-methylpropanenitrile | 1260884-02-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 2-(4-(benzyloxy)-3-methoxyphenyl)-2-methylpropanenitrile
• 英文别名: 2-(3-Methoxy-4-phenylmethoxyphenyl)-2-methylpropanenitrile
• CAS: 1260884-02-3
• 化学式: C₁₈H₁₉NO₂
• 分子量: 281.354
• InChiKey: VCHAHPXXIJFIHJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  42.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(4-(benzyloxy)-3-methoxyphenyl)-2-methylpropanenitrile 在 palladium 10% on activated carbon 、 potassium tert-butylate 、 氢气 、 硝酸 、 potassium carbonate 、 溶剂黄146 、 potassium iodide 、 锌 、 十二硫醇 作用下， 以 乙醇 、 乙酸酐 、 溶剂黄146 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 53.0h， 生成 6-(3-(5-(benzyloxy)isoindolin-2-yl)propoxy)-5-(cyclopropylmethoxy)-3,3-dimethyl-3H-indol-2-amine
  参考文献：
  名称：

  Tudor域蛋白Spindlin1研究染色质功能的化学探针。

  摘要：

  组蛋白尾巴的修饰，包括赖氨酸/精氨酸甲基化，提供了“染色质或组蛋白密码”的基础。包含“阅读器”结构域的蛋白质可以结合这些修饰并形成特定的效应物复合物，最终介导染色质功能。spindlin1（SPIN1）蛋白包含三个Tudor甲基赖氨酸/精氨酸阅读器域，被鉴定为推定的癌基因和转录共激活因子。在这里，我们报告SPIN1化学探针抑制剂具有较低的纳摩尔体外活性，对甲基读取器和写入器蛋白质面板具有出色的选择性以及亚微摩尔的细胞活性。X射线晶体学表明该Tudor结构域化学探针通过二齿结合模式同时与Tudor结构域1和2结合。SPIN1的小分子抑制和siRNA敲低

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b00562
• 作为产物：
  描述：

  1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基苯 在 正丁基锂 、 四氯化锡 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 2-(4-(benzyloxy)-3-methoxyphenyl)-2-methylpropanenitrile
  参考文献：
  名称：

  Structure-Based Design, Docking and Binding Free Energy Calculations of A366 Derivatives as Spindlin1 Inhibitors

  摘要：

  染色质阅读蛋白Spindlin1在表观遗传调控中扮演重要角色，已与多种恶性肿瘤相关。在当前工作中，我们报道了先前发表的主要抑制剂A366的新类似物的开发。为了提高活性并探索结构-活性关系（SAR），合成了一系列21个衍生物，在体内进行了测试，并通过分子建模工具进行了研究。进行了对接研究和分子动力学（MD）模拟，以分析和理解负责Spindlin1活性的结构差异。MD模拟的分析揭示了重要的相互作用。我们的研究突出显示了用于Spindlin1抑制活性所需的主要结构特征，其中包括嵌入芳香笼中的带正电的吡咯烷基，通过丙氧基连接到2-氨基吲哚核心。在后者中，酰胺基固定化合物到通过与Asp184的盐桥相互作用的口袋中。测试了不同的协议以识别一种快速的计算机辅助方法，可以帮助区分A366系列中的活性和非活性化合物。使用MM-GBSA计算重新评分对接姿势在这方面取得了成功。由于A366被认为是G9a的抑制剂，因此还测试了最活跃的开发的Spindlin1抑制剂对G9a和GLP的选择性配置文件进行验证A366类似物。这导致了多种选择性化合物的发现，其中1s和1t显示出纳摩尔级别的Spindlin1活性，并且对G9a和GLP具有选择性。最后，基于我们的发现提出了未来的设计假设。

  DOI：

  10.3390/ijms22115910

文献信息

• INHIBITORS OF HISTONE METHYLTRANSFERASE G9a
  申请人：AbbVie Inc.

  公开号：US20150274660A1

  公开（公告）日：2015-10-01

  Described herein are compounds, pharmaceutical compositions and methods for treating cancer, inflammation, or autoimmune disease in a subject, or for inhibiting histone methyltransferase G9a.

  本文介绍了一种用于治疗癌症、炎症或自身免疫疾病，或用于抑制组蛋白甲基转移酶G9a的化合物、药物组合物和方法。
• Discovery and Development of Potent and Selective Inhibitors of Histone Methyltransferase G9a
  作者：Ramzi F. Sweis、Marina Pliushchev、Peter J. Brown、Jun Guo、Fengling Li、David Maag、Andrew M. Petros、Nirupama B. Soni、Chris Tse、Masoud Vedadi、Michael R. Michaelides、Gary G. Chiang、William N. Pappano

  DOI：10.1021/ml400496h

  日期：2014.2.13

  G9a is a histone lysine methyltransferase responsible for the methylation of histone H3 lysine 9. The discovery of A-366 arose from a unique diversity screening hit, which was optimized by incorporation of a propyl-pyrrolidine subunit to occupy the enzyme lysine channel. A-366 is a potent inhibitor of G9a (IC50: 3.3 nM) with greater than 1000-fold selectivity over 21 other methyltransferases.
• US9284272B2
  申请人：——

  公开号：US9284272B2

  公开（公告）日：2016-03-15